New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4368615 = | 58 (1.510) | 6 (0.170) | 5/294 | NT | 10.1% | coding (147/1134 nt) | ampC | penicillin‑binding protein; beta‑lactamase, intrinsically weak |
? | CP009273 | 4368733 = | 52 (1.440) | coding (29/1134 nt) | ampC | penicillin‑binding protein; beta‑lactamase, intrinsically weak |
GCAATGGCAGGCCGCCAGCAGTGTAGGTTGCGAGATGTAATAGTGTGATCCCATTCCACTGTTTAGCGGTAAGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGCCATAGGCGGGCCGGATTTACATTGGCGATGCGTTAGATTGTAACGACACCAATCAGCGTGACAACTGTCAGGATAGCAGCCAGACCG > CP009273/4368356‑4368878 | gaaaTGGAAGGCCGCAAGCAATGTGGACTGAGTGTTGTAATATTGTGATCCCATTCCACTGTTTAGCGGTAAGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGTGATCTCTTAACTTGATTTCCCCGCGAGCACTAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCGAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCCGATAAATGaccgccaccgcc < 2:339067/273‑1 (MQ=255) tGCGAGATGTAATAGTGTGATCCCATTCCACTGTTTAGCGGTAAGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATCAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATaa > 1:302882/1‑275 (MQ=255) tgATCCCATTCCACTGCTTAGCGGTAAGCTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTGTGGCGATGTCCGCATAGCNCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGa > 1:516203/1‑275 (MQ=255) aTCCCATTCCACTGTTTAGCGGTAAGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCCTAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACAGCCACCGCCATACCCGGGAACATGTGTTGCTTTATAAGCGGGGTNATTTTGCCATg > 2:60725/1‑275 (MQ=255) ttCCACTGTTTAGCGGTAAGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTGGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGCCCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTGGGCGATGTCCGCATAGCTCAAGGTAAAGTCATCAGGTTTCCCCTGATAAATTACCGCCACCCCCATACCCGGGATCTTTTTATACCCTATTAGGTGGGTAATTCTTCGATTCACAat > 2:317898/1‑275 (MQ=255) tCCACTGTTTAGCGGTAAGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAata < 1:60726/275‑1 (MQ=255) ttAGCGGTAAGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGAt < 1:419772/275‑1 (MQ=255) tgcacgatctgaaaatccacgtacctgcgggcaaatgggttttctacggtctggctgctatcctgacagttgtcacgctgattggtgtcgttacaatctaacgcatcgccaatgtaaatccggccctcctatggcgggccgttttgtatggaaaccagaccctatgttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTaccgc < 2:258301‑M1/9‑1 (MQ=255) aGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTaa < 1:325909/241‑1 (MQ=255) aGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTaa > 2:325903/1‑241 (MQ=255) tATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAAt > 1:166085/1‑230 (MQ=255) ttgttgTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATtgtg < 2:166082/230‑1 (MQ=255) tgttgtGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTaccgccacc > 2:364446/1‑184 (MQ=255) gtgGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTAccgccaccgcca < 1:364452/184‑1 (MQ=255) tCGCGTATCTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGt < 1:317904/275‑1 (MQ=255) cccgaaaaaggCGTNGCCACCAAGGCAGCCAGTAAATGGTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGAAGGGCTGTTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGcg < 2:516196/265‑1 (MQ=255) acccAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGATCGAACCTAACTCACACATCGTTTGCTGTGTGACTGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGt < 2:302876/275‑1 (MQ=255) ccaAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTGGCTGTGGGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCTTCAttggtcgcgtattcc < 1:148165/274‑14 (MQ=255) cccccacctaTGCTTTTCTGACCGGAGCTGACTCAAGTGTCCTTTGGTGTAGTACTGGATGGTTTGTGGCGATGTCAGTATAGACCCAGGTAACGTGATTAGGTTTACCATGTTAAGTGACCGCCACCGCCATACACGGGATCTTTTGTTGCTATATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGGGGGGCGGCAAATGTGGCGCAAGGGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGttt < 2:95815/265‑1 (MQ=255) cGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACATCGTTTGCGGTGTGACGGGCTGTTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGttt < 2:663863/274‑1 (MQ=255) ttGCTGACCGATCCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGTTTTTTGGCGATGTCCGCATAGTCTCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGAGTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGAGCAGAGCGTAGGTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGcc < 1:147988/275‑1 (MQ=255) tGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCttt > 1:153977/1‑131 (MQ=255) gCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGa > 1:292129/1‑160 (MQ=255) gACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTttgtt < 2:153974/131‑1 (MQ=255) aCCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGca < 2:292123/160‑1 (MQ=255) aCCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATNCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGCCATAggag > 1:612212/1‑273 (MQ=255) tAAATCAAACAACGTTTGCGGTGTGAAGTGCTGCTTTTTGGCGATTTCCGCATAGCCCCAGGAAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATATATTACCGCCGCCGCCATACCCGGGATCTTTTGGTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCATAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGCCATAGGAGGGc < 1:371446/275‑1 (MQ=255) cGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAAt > 2:225927/1‑129 (MQ=255) cGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATtg > 2:691070/1‑131 (MQ=255) tccggccctcctatggcgggccgttttgtatggaaaccagaccctatgttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGt < 2:50924‑M1/51‑1 (MQ=255) tgcggtttgtagggTTGCTTTGTGGGTATGTACGCATAGCCCTAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGCCATAGGAGGGCCGGATTTACATTGGCg < 1:319609/264‑1 (MQ=255) tGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATtgtg < 1:225932/129‑1 (MQ=255) tGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCg < 1:691079/131‑1 (MQ=255) gccctcctatggcgggccgttttgtatggaaaccagaccctatgttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGctc < 2:107835‑M1/39‑1 (MQ=255) gccctcctatggcgggccgttttgtatggaaaccagaccctatgttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAAtt > 1:50924‑M1/71‑125 (MQ=255) tcctatggcgggccgttttgtatggaaaccagaccctatgttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCtata > 1:107836‑M1/67‑109 (MQ=255) gtgACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATaa > 1:321002/1‑109 (MQ=255) cGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCgg < 2:320996/109‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAAt > 2:695990/1‑113 (MQ=255) ggccgttttgtatggcaaccagaccctatgttcaaaacgacgctctgcgccttattaatt < 1:92300‑M1/4‑1 (MQ=255) gctTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATtgtg < 1:695999/113‑1 (MQ=255) gttttgtatggaaaccagaccctatgttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTaccg > 2:92299‑M1/53‑60 (MQ=255) aaaccagaccctatgttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGt < 1:511981‑M1/51‑1 (MQ=255) cagaccctatgttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAAtt > 2:511974‑M1/38‑92 (MQ=255) ccccAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATtg > 1:207202/1‑88 (MQ=255) tatgttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTac < 2:254122‑M1/6‑1 (MQ=255) aGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCg < 2:207198/88‑1 (MQ=255) ttcaaaacgacgctctgcgccttattAATTaccgcc > 1:254127‑M1/27‑36 (MQ=255) aGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGTGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAACACGGCCCGCCATAGGAGGGCCGGATTTACATTGGCGAANTGTTAGAGTGTAAAGACAACAATCAGCTTTACAAccttcactatta > 2:439154/1‑264 (MQ=255) taaGGTTTACCCTGATAAATTACCGCTACCGCCAGACCCGGGAGCTTTTGTTGct > 1:474734/1‑55 (MQ=255) taaGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCtt > 2:672139/1‑47 (MQ=255) taaGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGa > 2:598962/1‑119 (MQ=255) aaGGTTTACCCGGTAAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATTTTTTGTTGGTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGAACAATATCGTGGATTTGTGGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGCCATAGGAGGGCCGGATTTACATTGGCGATGCGTTAGATTGTAACGACACCAATCAGCGTGACAACTGTCAGGATAGCAGCCa < 2:612203/275‑1 (MQ=255) gTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTttgt < 1:672148/47‑1 (MQ=255) gTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCtat < 2:474727/55‑1 (MQ=255) gTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCaa < 1:598971/119‑1 (MQ=255) ttACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGa > 1:73486/1‑72 (MQ=255) tACCCTGATAAATTACGGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATtg > 1:525488/1‑66 (MQ=255) tACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAat > 1:288882/1‑79 (MQ=255) tACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGCCATAGGAGGGCCGGATTTACATTGGCGAt > 1:59081/1‑216 (MQ=255) tACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGCCATAGGAGGGCCGGATTTACATTGGCGATg > 2:466532/1‑217 (MQ=255) tACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTAGTTTTGAACATAgg > 2:76199/1‑160 (MQ=255) tACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTCGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCNCGCCATAGGAGGGCCGGATTTACATTGGCGATGCGTTAGATTGTAACGACACCAATCAGCGTGACAACTGTCAGGATAGCAGCCAGACCg > 1:522593/1‑274 (MQ=255) ccTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGca < 2:73485/72‑1 (MQ=255) cTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCg < 2:525481/66‑1 (MQ=255) cTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCg < 2:288877/79‑1 (MQ=255) cTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCt < 1:76200/160‑1 (MQ=255) cTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGCCATAGGAGGGCCGGATTTACATTGGCGATGCGt < 2:59080/216‑1 (MQ=255) cTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGACATAGGAGGGCCGGATTTACATTGGCGATGCGtt < 1:466539/217‑1 (MQ=255) aTAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCta > 2:238771/1‑44 (MQ=255) aTAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATATGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTGCCATACaaaa > 2:705652/1‑172 (MQ=255) | GCAATGGCAGGCCGCCAGCAGTGTAGGTTGCGAGATGTAATAGTGTGATCCCATTCCACTGTTTAGCGGTAAGTTCAGGCCAGTATTTTGTTGTGGGATCGCTTAACTTGATTTCCCCTCGAGCAATAGCGTCGCCACCAAGCACGCCAGTAAATGTTTTGCTGACCGAACCTAACTCAAACAACGTTTGCTGTGTGACGGGCTGCTTTTTGGCGATGTCCGCATAGCCCCAGGTAAAGTAATAAGGTTTACCCTGATAAATTACCGCCACCGCCATACCCGGGATCTTTTGTTGCTCTATAAGCGGGGTAATTGTGCGATGCACAATATCGTTGATTTGTTGAGGGGCAGCAAATGTGGAGCAAGAGGCGGTAATTAATAAGGCGCAGAGCGTCGTTTTGAACATAGGGTCTGGTTTCCATACAAAACGGCCCGCCATAGGCGGGCCGGATTTACATTGGCGATGCGTTAGATTGTAACGACACCAATCAGCGTGACAACTGTCAGGATAGCAGCCAGACCG > CP009273/4368356‑4368878 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |