New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4378533 = | 52 (1.350) | 9 (0.250) | 7/292 | NT | 16.5% | coding (655/3324 nt) | mscM | mechanosensitive channel protein, miniconductance |
? | CP009273 | 4378844 = | 43 (1.200) | coding (344/3324 nt) | mscM | mechanosensitive channel protein, miniconductance |
GTTCACGCAGCGTATTCAACGCCTGCCGGACCTGTAACGTCTGGCTGGCAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAGCGGAGTATTGCCGGTAAGCGTTCCCAGGCGGCGCTCGATCTCATTTAACTGACGGCGGGCGTCGGTTTGCTGTTGCGGCAGTTGATTCAGCGAATCGGCAATCTCGCGGGCGCGC > CP009273/4378272‑4378801 | gttcagcgagggTATTCAACGCCTGCCGGACCTGTAACGTCTGGCTGGCAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGCTTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGctc < 1:405280/264‑1 (MQ=255) cAACGCCTGCCGGACCTGTAACGTCTGGCTGGCAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTGGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTGTCGGCAAAGCGGCGCTGTTGTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGct < 1:413449/275‑1 (MQ=255) gCCTGCCGGACCTGTAACGTCGGGCTGGCAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCACGGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTGTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAACTCGGAGCTGTTTTCTGCCAGCATTTCGGTCCTTTCCCGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGGTTAATTGATTACGAAAGCCCTACAAATACGCATCCAGTGGCTAGCCGCCCTTNCTCGCCAGctctaa > 2:535155/1‑273 (MQ=255) cTGCCGGACCTGTAACGTCTGGCTGGCAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCTGCACCGCCTCAAGCTGACGTTGTCTGTCTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCCCTCTTTTTCCGCAAGCTCTGAGc > 1:154089/1‑275 (MQ=255) ggACCTGTAACGTCTGGCTGGCAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCAAAGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCNCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCGCTCTTTTTCCGACAGCTCTGAGCGTAAg < 1:535163/275‑1 (MQ=255) tggctggcAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTTAGCGTAAGCGCGCTAATTc > 1:278314/1‑272 (MQ=255) gcgggcAGCCTGCCGCTGTGTTGTGGCAACGAGTGCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTTCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTgg < 2:154086/271‑1 (MQ=255) ggcAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGt < 1:261688/275‑1 (MQ=255) cAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCAGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGCCTCTCTTTTTCCCCCAGCCCTGATNTTAAGCTCACTCATCCCttctctatt > 2:466660/1‑267 (MQ=255) gACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCa < 1:55128/275‑1 (MQ=255) gACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAACTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCa < 1:713030/275‑1 (MQ=255) cgagaatccctccGGTGCTCCGGTTGGTTTAAAGCCGCCGTTAGTTCGGGGTTAATTTTGGATTGCGGGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCGAGCAATTCGGTACTTTCCCGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTAAGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTc < 2:4215/270‑1 (MQ=255) gagaTCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCa < 1:626276/275‑1 (MQ=255) agaTCCATCGGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCa < 1:202940/274‑1 (MQ=255) gCTGCGCCTGTTGCTTCAAAGCCGACGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTACTTGATTACGCAAGGCCTGCAACTACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTTTGAGCGTACGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACACCTGCGACAGcccccttttttttt > 2:593307/1‑263 (MQ=255) ccTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGACTGCAAATACGCATCCATTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCCCGCAAATTCCTGGGGGTTCTTGGAGGGCCGCGGCTCCCGCTCCAGttacccaacccc > 2:645526/1‑261 (MQ=255) ccgATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAGATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGc > 1:324128/1‑236 (MQ=255) tAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAGATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCa < 2:324122/236‑1 (MQ=255) ttCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAAGTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTgcgc > 1:672594/1‑225 (MQ=255) cgGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGc < 2:672585/225‑1 (MQ=255) atcagcaagttatcgataattatccgaaactctccgctactctgcgcgcacaattaaacaacatgcgtgacgagccgcgcagcgtgtcgccgggaatgtctaccgacgcgctgaatcaggaaattctccaggtcagcagCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCCCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGaa < 2:88787‑M1/136‑1 (MQ=255) tAATTTTTAATTGCTCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAACTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGaaa < 1:593316/275‑1 (MQ=255) tAATTTTGAATTGCGCGACAATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGATCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGGTCATCAACGAGAGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGaaa > 1:571631/1‑275 (MQ=255) gtgtGAATGGCGCGACGATCTCTTTCGGCAAAGCCGCGCTGTTTTCTGCCCGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGCTTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAAtt < 2:142364/271‑1 (MQ=255) cgcgACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGNCGTTGGCTNTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGGAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGa < 1:468594/274‑1 (MQ=255) cgcgACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTNTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGa < 1:518792/274‑1 (MQ=255) atttttttCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACGTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAATGCCTGCAAATACGCNTCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACTTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAGCgg < 1:669701/270‑1 (MQ=255) atatCTTTCGGCAAATCGGCGCTTTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGCTGCTGTCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAGCgg < 1:645535/275‑1 (MQ=255) ttCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCCGCCCCAGTTCCTCAAc > 2:470516/1‑209 (MQ=255) gCAAATCGGCGCTGTTNTCTGCCAGNAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAgc < 1:470523/209‑1 (MQ=255) tCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACNCAAGGCCTNCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAGCGGAGTATTGCCGGTAAg < 1:466667/275‑1 (MQ=255) gCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTtcatca > 1:458711/1‑179 (MQ=255) ttCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCTCCCCAATCTGACGTTGGCTTTTTTATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAATCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGa < 2:458704/179‑1 (MQ=255) cgtgacgagccgcgcagcgtgtcgccgtgaatgtctaccgacgcgctgaatcaggaaattctccaggtcagcagcc > 1:43847‑M1/75‑76 (MQ=255) cccGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTg > 1:524388/1‑139 (MQ=255) cccGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCa > 2:315929/1‑144 (MQ=255) ccGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGcc > 2:428797/1‑88 (MQ=255) cTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGcc < 2:524381/139‑1 (MQ=255) cTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTc < 1:315935/144‑1 (MQ=255) tCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGct < 1:428804/88‑1 (MQ=255) ccTCAAGCTGACGCTGGCTGTTTGATTGATTCCGCAAGCCCTACAAATACGCATCCAGTCGCTGGCTCCCTGTTACCGCCAGCTCTGAGCGTAACTGCGCTAACCCCTGGCGGTTATTGACAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTGCATCAACGAGCGCCCTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGCTTGAGCGGAGTATTGCCGGTAAGCGTTCCCAGGCGGCGCGCGATCTCATTAAACTGAcgctcggcggacgtt > 2:127112/1‑262 (MQ=255) gCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCaa > 2:441032/1‑144 (MQ=255) ggaatgtctaccgacgcgctgaatcaggaaattctccaggtcagcagCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGc < 2:675183‑M1/83‑1 (MQ=255) aCGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAg < 1:441039/144‑1 (MQ=255) tgtctaccgacgcgctgaatcaggaaattctccaggtcagcagCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCa > 1:675192‑M1/44‑130 (MQ=255) gCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTtcatca > 2:506825/1‑133 (MQ=255) gCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGa > 2:703351/1‑191 (MQ=255) tttAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGTCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAGCGGAGTATTGACGGTAAGCGTTCCCAGGCGGCGCACGATCTCATTTAACTGACGGCGGCCGTCGGTTTGCTGTTGCGGCatctggtt > 1:320774/1‑268 (MQ=255) tttAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTc > 2:517350/1‑86 (MQ=255) tttAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGa < 1:506832/133‑1 (MQ=255) tttAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTGCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAGCgg < 1:703360/191‑1 (MQ=255) gcgcgctgaatcaggaaattctccaggtcagcagCCAg < 1:25187‑M1/4‑1 (MQ=255) gcgctgaatcaggaaattctccaggtcagcagCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTtcatca < 1:687145‑M1/95‑1 (MQ=255) gctgaatcaggaaattctccaggtcagcagCCAGTTGc > 2:25187‑M1/31‑38 (MQ=255) aTTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTgg < 1:517357/86‑1 (MQ=255) tgaatcaggaaattctccaggtcagcagCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGa > 2:687136‑M1/29‑127 (MQ=255) aTTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTgg > 2:535624/1‑82 (MQ=255) cGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGt < 1:535632/82‑1 (MQ=255) aattctccaggtcagcagCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGc < 1:307760‑M1/83‑1 (MQ=255) gCCGGCATATACGCATCCAGTTGCGGGCTCGCTTTTTCCGCCAGCTCTCCGACTAAGCGCGCAAATTCCTGGCGCGTATTGGACGACAGCTGCGCCAGCACCAGCTCACCAACGCGCGCATTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAGCGCGAAAttt > 2:579967/1‑156 (MQ=255) ctccaggtcagcagCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGc < 1:540849‑M1/83‑1 (MQ=255) ctccaggtcagcagCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCa > 2:307754‑M1/15‑101 (MQ=255) gCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTtgtg < 1:579976/156‑1 (MQ=255) aggtcagcagCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCa > 2:540841‑M1/11‑97 (MQ=255) cGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGa > 2:437661/1‑115 (MQ=255) cGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGAt > 1:126041/1‑155 (MQ=255) cGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAGCGGAGTATTGc > 2:392491/1‑170 (MQ=255) cGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGGAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCCGCTCCAGTTAATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGCGTCAGACTGCAACGCGAACTTATGTGCCTGATTGAGCGGAGTATTGCCGGTAAGCGATCCCAGGCGGCGCTCGATCTCATTTAACTGACGGCGGGCGTCGGTTTGCCGACGCGGCAGTTGATTCAGCGAATCTGCACTCGCTCGGgcgccc > 2:628401/1‑272 (MQ=255) tCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAgcgc > 2:496989/1‑45 (MQ=255) tCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTg < 1:437668/115‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAg < 2:126040/155‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAGCGGAGTATTGCCGGt < 1:392497/170‑1 (MQ=255) | GTTCACGCAGCGTATTCAACGCCTGCCGGACCTGTAACGTCTGGCTGGCAGCCTGACGCTGTTGCGAGGCAACGAGATCCATCCGCTGCGCCTGTTGATTCAAAGCCGCCGATAGTTCGCGGTTAATTTTGAATTGCGCGACGATATCTTTCGGCAAATCGGCGCTGTTTTCTGCCAGCAATTCGGTACTTTCCAGCGCCCGCTCCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGCAACGCGAAATTTTGTGCCTGATTGAGCGGAGTATTGCCGGTAAGCGTTCCCAGGCGGCGCTCGATCTCATTTAACTGACGGCGGGCGTCGGTTTGCTGTTGCGGCAGTTGATTCAGCGAATCGGCAATCTCGCGGGCGCGC > CP009273/4378272‑4378801 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |