| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 18493 = | 61 (1.590) | 8 (0.210) | 6/304 | NT | 12.5% | coding (1005/1167 nt) | nhaA | sodium‑proton antiporter |
| ? | CP009273 | 18830 = | 53 (1.420) | coding (116/906 nt) | nhaR | transcriptional activator of nhaA | |||||
CTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTGCACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACGGTTTACCGGGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTCATTGTTATCAGGGAGAGAAATGAGCATGTCTCATATCAATTACAACCACTTGTATTACTTCTGGCATGT > CP009273/18225‑18764 | ctcCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTGCACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTTACTTGCTGATTNGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACCTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTTCGGTa > 1:664780/1‑273 (MQ=255) gctgagtggggactgtgTTGCAACCNTGGGTGTCGTATTTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCTCTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTAc < 2:467250/261‑1 (MQ=255) gggaCTGGGGCATGTGTTGCCCGCGGGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACCTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACt < 2:664771/272‑1 (MQ=255) taccactgcggcgttaagtacgctactgaccaggcgtttggaaagtgcatcagccacgccaacgtcaaacaataaattggattctttgcgatagttcacaatatccagcatttcctggcttaaggtgaacattttatcggcatagcgatagaccagttctcccagctcgctgggttcgagaccacgtcccttgcgtttaaataatttgccttgcaggcgctcttccagcgctcgaatctgtcCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGc < 1:131739‑M1/33‑1 (MQ=255) tGCACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAACTTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGcc > 1:139397/1‑275 (MQ=255) gagtgggtgcAGTATATGTTTTTGCTGCTGTTTGGATTTATGAATGCTGGGGTTTAAATGCAAGGAGTGTCGATGGTTGGCTTGACCTCCATTCTGCGATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGTAAAGCCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGAATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGcc < 2:673041/272‑1 (MQ=255) tATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTa > 1:295586/1‑238 (MQ=255) tGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTAt < 2:295580/238‑1 (MQ=255) tGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGttt > 1:631618/1‑220 (MQ=255) tGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACt < 2:631609/220‑1 (MQ=255) tGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACC‑CCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGcc > 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ttgatggCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTACTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGt < 1:368048/269‑1 (MQ=255) cGTCACGCTGGATGGCTTGGCCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGATGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTCCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAAAGACTTATCAGCAAATAATGGGGGTGTGGATTCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATg > 1:586262/1‑190 (MQ=255) cGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATTTCTATCTTTATTGCCCGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAAATGATTAACTTGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATctct > 1:288267/1‑275 (MQ=255) cTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCg > 2:158166/1‑158 (MQ=255) ttGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAAt > 1:160967/1‑275 (MQ=255) aCCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTAt < 1:158169/158‑1 (MQ=255) tGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCttt > 1:196136/1‑170 (MQ=255) ccATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGGTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATGATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTGTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTAGCATGGTCGGTTCTATAGATTCGGCGGTAATTGGATActgtgagat > 2:86538/1‑267 (MQ=255) 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atcGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCT‑GCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATctct > 1:548805/1‑236 (MQ=255) gcttaaggtgaacattttatcggcatagcgatagaccagttctcccagctcgctgggttcgagaccacgtcccttgcgtttaaataatttgccttgcaggcgctcttccagcgctcgaatctgtcCGGTa > 1:112638‑M1/126‑130 (MQ=255) cTGGCTTGCTGTTTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCT‑GCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTcgg < 2:548796/236‑1 (MQ=255) cTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGttttttt > 2:608717/1‑271 (MQ=255) 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tGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGt > 1:154290/1‑270 (MQ=255) gtgCAAACCGTGGGGGATTTGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGa < 2:154287/272‑1 (MQ=255) aCCGCTGGGGTTTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTANGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACg < 1:608726/275‑1 (MQ=255) catagcgatagaccagttctcccagctcgctgggttcgagaccacgtcccttgcgtttaaataatttgccttgcaggcgctcttccagcgctcgaatctgtcCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTa < 1:712386‑M1/50‑1 (MQ=255) catagcgatagaccagttctcccagctcgctgggttcgagaccacgtcccttgcgtttaaataatttgccttgcaggcgctcttccagcgctcgaatctgtcCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCt < 2:316855‑M1/93‑1 (MQ=255) catagcgatagaccagttctcccagctcgctgggttcgagaccacgtcccttgcgtttaaataatttgccttgcaggcgctcttccagcgctcgaatctgtcCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGGGTGGGTTTGTGTCCATCATTTTGCCaggactttt < 2:620367‑M1/173‑5 (MQ=255) catagcgatagaccagttctcccagctcgctgggttcgagaccacgtcccttgcgtttaaataatttgccttgcaggcgctcgtccagcgctcgaatctgtcCGGTATCGGTTTTACTANGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACg > 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gcATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACa < 1:501961/182‑1 (MQ=255) cATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTCTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACGGTTTACCGGGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTCATTGTTATCAGGGAGAGaa < 1:393494/275‑1 (MQ=255) cTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATTGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTNACTGGGCGAAATTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACGGTTTACCGGGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTCATTGTTATCAGGGAGAGAAATGAGCa < 1:646321/275‑1 (MQ=255) gggAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCg > 2:482610/1‑44 (MQ=255) atttgccttgcaggcgctcttccagcgctcgaatctgtcCgg < 2:700205‑M1/3‑1 (MQ=255) aCGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTAt < 1:482617/44‑1 (MQ=255) cGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCgg > 2:381033/1‑136 (MQ=255) ttATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCt < 1:381039/136‑1 (MQ=255) aTCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTa > 1:358402/1‑81 (MQ=255) agtaaaTTATGGTGGTGTGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGAGTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACGGTTTACCGGGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTCATTGTTATCAGGGAGAGAAATGAGCATGTCTCATATCAATTAc < 1:399350/271‑1 (MQ=255) gCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGt < 2:358396/81‑1 (MQ=255) cAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTa > 2:146258/1‑76 (MQ=255) aaaTTATGGTGGTGGGGTTGCTGTGTGGTATCTGTTTTACTATGTCTATTTTTATTGCTAGCCTGGCCTTTGGTATGGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACGCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCTGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACGGTTTACCGGGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTCATTGTTATCAGGGAGAGAAATGAGCATGTCTCATATCAATTACAAc < 2:288262/274‑1 (MQ=255) aTTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATAGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTNGACAGGACGGTTTACCGGGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTCATTGTTATCAGGGAGAGAAATGAGCATGTCTCATATCAATTACAACCAc > 1:491481/1‑275 (MQ=255) ttATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGt < 1:146259/76‑1 (MQ=255) tggtggGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGAt > 2:199218/1‑74 (MQ=255) ggggATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAg < 1:199221/74‑1 (MQ=255) ggggATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGaaa > 1:22871/1‑94 (MQ=255) aTCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCg < 2:22871/94‑1 (MQ=255) tgtgCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACGGTTTACCGGGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTAATTGTTATCAGGGAGAGAAATTAGCAGGTCGCATATCAAATTCAACCCCTTTTATTTCttttttcctt > 2:553975/1‑267 (MQ=255) gCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTa > 2:365164/1‑51 (MQ=255) gCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACGGTTTACCGTGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTCATTGTTATCAGGGAGAGAAATGAGCATGTCTAATATCAATTACAACCACTTGTATTNTTTCTGTCATGt > 2:536294/1‑273 (MQ=255) CGGTATTGTTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCATAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGNTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACGGTTTACCGGGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTCATTGTTATCAGGGAGAGAAATGAGCATGTCTCATATCAATTACAACCACTTGTATTACTTCTGGCAt > 1:553984‑M1/1‑270 (MQ=255) | CTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTGCACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTGTTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAGCAAATTATGGTGGTGGGGATCCTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCCAGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTGGTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCATCAGTTTGACAGGACGGTTTACCGGGGAGCCATAAACGGCTCCCTTTTCATTGTTATCAGGGAGAGAAATGAGCATGTCTCATATCAATTACAACCACTTGTATTACTTCTGGCATGT > CP009273/18225‑18764 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |