New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 159805 | 43 (1.120) | 4 (0.110) | 4/298 | NT | 7.5% | coding (1214/2430 nt) | hrpB | putative ATP‑dependent helicase |
? | CP009273 | = 160166 | 58 (1.590) | coding (1575/2430 nt) | hrpB | putative ATP‑dependent helicase |
TCTCGAAGAGCCGCCACGGATGGGCAATAGTGACCTGGGCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGTACAGCAGTCTGACACTGTGGAGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTACAAATCGGTCAGTTGACGGTGAAAGTGCAGCCGCTGGCGAAACCGTCAGAAG > CP009273/159917‑160407 | ttgcGAAGAGCCGCCACGGATGGGCAATAGTGACCTGGGCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAATGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCg < 1:402176/272‑1 (MQ=255) tAGTGACCTGGGCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTACCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCg > 1:360751/1‑253 (MQ=255) aGTGACCTGGGCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTg > 1:301594/1‑243 (MQ=255) gTGACCTGGGCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGCCGCTATCAACTGGCAACCGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCCGGGCAGCGCCCCg > 1:56075/1‑275 (MQ=255) aCCTGGGCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCg > 2:35156/1‑243 (MQ=255) aCCTGGGCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGcc > 1:96664/1‑274 (MQ=255) gggCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGGTTAAACGTAGGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGaa < 1:134740/229‑1 (MQ=255) gggCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGaa < 1:292585/229‑1 (MQ=255) gggCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCAcc < 1:35156/243‑1 (MQ=255) ggcttTTTCGCGCATTCGACCGGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAGCGTACGTGGCGGTGAGGCAGACCGTTCGNTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGATCCGCGCCACGCCGGATGCGCGGa < 1:488974/275‑1 (MQ=255) ggcgtTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGTAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATGAACTGGCAAACGGCATGGGNGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTACGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTAGTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGAAGCGCgg > 1:544975/1‑274 (MQ=255) ggcgtTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCCCCg > 1:592500/1‑238 (MQ=255) ccAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTTTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGNCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGt < 1:618153/275‑1 (MQ=255) tGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCCTGGGCGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAAAGGTTGAGCGCACCGGTATTATTGCAGGGCAGCGGCTCGCAGGCTGGGCGGATGTTACTGGCTCTGTGGGTcttttt > 2:618144/1‑270 (MQ=255) gcagcaACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCCTGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGCTGCGCGGCTTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATAtt > 1:81156/1‑274 (MQ=255) gcagcaACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCg > 1:406054/1‑206 (MQ=255) cagcaACGTAGTCAGCAACTGTTAAGCCGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGCTCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATtga < 1:362097/275‑1 (MQ=255) caACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCAcc < 2:406047/206‑1 (MQ=255) ggTAGTCAGCAACTGTTACAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGTACGCTCTCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGTACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGt < 1:622131/273‑1 (MQ=255) ggCTGAAACANAAGTGGCGGGGGGGTAGACAGTTCGCTTATCGTGCCGCGCCCTGCCGGGGCCTTTGCCGAGCGCATTGCTCGTCGACGTGGGCACGAGAGACGGCATCAACCGGCAAACCGCAAGGGGGCGGTGCTCGACGGCAACGGCGGGCTAAGCCGCCAAGAACGGTGGATCGAACCGTTATTAGTGCAGGGCAGCGCCTCGCCAGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGc < 2:56075/273‑1 (MQ=255) cTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTAATTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTg > 1:678082/1‑274 (MQ=255) tAAACGTACGTGGCGATGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGGTGATCGCACCGTTATNATTGCAGGTCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGt > 1:499736/1‑274 (MQ=255) gTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGACGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGTACAGCAGTCGGacac > 1:264582/1‑274 (MQ=255) gACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTAGTTGTCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGNATGCGCGGATTGTACTGGCGctgctg > 1:490452/1‑210 (MQ=255) gcgcCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGa > 1:621158/1‑133 (MQ=255) gCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAgccgc > 1:153820/1‑108 (MQ=255) cGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGCTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGTACAGCAGTCTGACACTGTGGAGTGGGATGACGCGCCAGGTACGCtctgtcgc > 1:95039/1‑267 (MQ=255) gggCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg < 2:153817/108‑1 (MQ=255) gggCGTTTGCAGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGctaagccgttcaccctccagtgcccccagcatttgtaac < 1:721294‑M2/134‑40 (MQ=255) cGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGctgctg > 1:249800/1‑176 (MQ=255) gTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGctaagccgttcaccctccagtgcccccagcatttgtaacagac > 2:721284‑M2/1‑91 (MQ=255) tGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTg > 2:661900/1‑109 (MQ=255) tGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCg < 2:249795/176‑1 (MQ=255) gATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCg < 1:661909/109‑1 (MQ=255) tCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGTACAGCAGTCTGACACTGTGGAGGGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTACaaa > 1:323747/1‑275 (MQ=255) cATTGCTCGGCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGTAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATtga < 2:233164/174‑1 (MQ=255) ttGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATgcg > 2:640457/1‑140 (MQ=255) tGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGACAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGctaagccgttcaccctccagtgcccccagcatttgtaacagacgtttcgcggccagtagattcact < 2:638056‑M2/142‑67 (MQ=255) tcgtcgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGa < 1:640466/140‑1 (MQ=255) cgtcgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGa > 1:385086/1‑131 (MQ=255) cgtcgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGACAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGctaagccgttcaccctccagtgcccccagcatttgtaacagacgtttcgcggccagtagattcactactg > 1:638065‑M2/1‑72 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCCCGGATTTTACTGGCgctgc > 1:385168/1‑151 (MQ=255) gCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATgcg < 2:385080/131‑1 (MQ=255) gTGGGCAAGATGGACGCGATCAACTGGCAAACGGGATGGGAGCGATGGTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGt < 2:385162/151‑1 (MQ=255) tGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCAGGTCGcta > 1:632760/1‑155 (MQ=255) cacgagggACGGTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGAGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATtga < 2:632751/149‑1 (MQ=255) aTCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCg > 1:281003/1‑72 (MQ=255) aCTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCAcc < 2:280998/72‑1 (MQ=255) cTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCa < 1:73273/161‑1 (MQ=255) cAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCg > 2:227411/1‑63 (MQ=255) cAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCg > 2:129685/1‑63 (MQ=255) cAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGgc > 1:288610/1‑115 (MQ=255) aaCGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTg > 2:275770/1‑159 (MQ=255) gggagttggAGCGATGCTTGATGCTAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCNCATCGCCGNATGCGCGGATTTGACTGGCGCTGCTGGTCGATAGTGATGAGTTAGTACGACGCTGCCCGCAGCTGGTACAGCAGTCTGACACTGTGGAGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTACAAATCGGTCAGTTGACTGTGAAAGTGCAGCCGCTGGAGAAACCGTCagaag < 1:482674/268‑1 (MQ=255) cGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCAcc < 1:129686/63‑1 (MQ=255) cGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCAcc < 1:227416/63‑1 (MQ=255) cGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCgctg < 2:288605/115‑1 (MQ=255) gCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGTAc < 1:275775/159‑1 (MQ=255) aTGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGgc > 2:247253/1‑98 (MQ=255) aTGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCgctgc > 1:587736/1‑103 (MQ=255) tCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCgctg < 1:247258/98‑1 (MQ=255) tCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGt < 2:587727/103‑1 (MQ=255) tGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGTAcagcag > 2:392158/1‑145 (MQ=255) aaCGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGTACAGCAGTCTg < 1:392164/145‑1 (MQ=255) gcgcTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGTACAGCAGTCTGACACTGTGGAGTGAGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTACaag > 1:680844/1‑195 (MQ=255) gcgcTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGAGTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCCGGt > 2:426027/1‑128 (MQ=255) | TCTCGAAGAGCCGCCACGGATGGGCAATAGTGACCTGGGCGTGGCGTTTTCGCGCAATCAACCAGCCTGGCAGCAACGTAGTCAGCAACTGTTAAAACGCTTAAACGTACGTGGCGGTGAGGCAGACAGTTCGCTTATCGCGCCGCTACTTGCCGGGGCGTTTGCCGATCGCATTGCTCGTCGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACGAATGGTTGATCGCACCGTTATTATTGCAGGGCAGCGCCTCGCCGGATGCGCGGATTTTACTGGCGCTGCTGGTCGATATTGATGAGTTAGTACAACGCTGCCCGCAGCTGGTACAGCAGTCTGACACTGTGGAGTGGGATGACGCGCAAGGTACGCTGAAAGCCTGGCGTCGGCTACAAATCGGTCAGTTGACGGTGAAAGTGCAGCCGCTGGCGAAACCGTCAGAAG > CP009273/159917‑160407 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |