New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 1336344 | 31 (0.810) | 4 (0.110) | 4/300 | NT | 13.4% | coding (167/738 nt) | pyrF | orotidine‑5'‑phosphate decarboxylase |
? | CP009273 | = 1336657 | 22 (0.600) | coding (480/738 nt) | pyrF | orotidine‑5'‑phosphate decarboxylase |
TCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTTGATTATATGGTGATTGGTCGCCCGGTAACGCAATCGGTAGATCCAGCGCAGACGCTGAAAGCGATCAACGCCTCTTTACAGCGGAG > CP009273/1336384‑1336908 | tCTTGTCCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGATGACTTAGGCGTGTGGATGCTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGTCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAAt > 1:714001‑M2/1‑274 (MQ=255) cccAACTCTGCTGTGTCCGCTGTCGCTGCGGCAGCTGGCTTAGGCGTGTGGTTGGGGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCAGTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGtt < 1:585676/274‑1 (MQ=255) tGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCt > 1:322278/1‑275 (MQ=255) gtgcAGGTNTCTTTGGCGGGTGGGTGGGGGATTTTCATTCCTTGGGTGGGGCGGGTATTATGACCTCAGCGCGTGAGGTACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCCGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTaaa < 2:72093/271‑1 (MQ=255) aaTGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTCTCACCTGCAGANTATGCAGAACGTCTGGCGGTACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAg > 1:651457/1‑229 (MQ=255) tGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACTCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCa > 1:401442/1‑275 (MQ=255) cAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTCAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGAc > 1:92396/1‑275 (MQ=255) gcgTGTGTCACTGTGTCCGTTTTGCTAAGATGCATCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAgc < 1:329563/275‑1 (MQ=255) gggtgcGTTTGGCAAGGATGACATGGTTTTGTTTGCTTGGAGAGGGTTTACCAGAATTGAAGCAAGGGAACTGGTCGAGCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACTGATGGGGGCACGGACGAAAAAATGTGGACTTGATGGTGTGGTGTGTTCAGCGCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTAt < 2:706929/268‑1 (MQ=255) ttCCGTTTGGAAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAAGTATGCGGTCAGTAGTTCAAACTGGTTACGCCGTGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGcgccgaa > 1:706939/1‑265 (MQ=255) aTTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGgtgt < 2:322272/272‑1 (MQ=255) tgtTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAg > 2:167564/1‑132 (MQ=255) gACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCtgt < 1:167567/132‑1 (MQ=255) cATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAAtgtggcccaaacaatgtaaacatctctttgccgaccttcagacgacaatcgcgtgggtcgatcttgtcgacaaaggccagcgcgtcatcacgattatgataatcaagggcaacaaccacaggagaattcgtaaca < 2:655739‑M2/220‑136 (MQ=255) gAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAAtgtggcccaaacaatgtaaacatctctttgccgaccttcagacgacaatcgcgtgggtcgatcttgtcgacaaaggccagcgcgtcatcacgattatgataatcaagggcaacaaccacaggagaattcgtaacagcgc > 1:655748‑M2/1‑81 (MQ=255) aGCGACCTGGTCGATCTTGGCATAACACTCTCACCTGCAGATTATGCCGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAACAATGTGGCCTTGATGGAGCGGCGAGTTCTGCTCAGGAAGCTGTTCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCCGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTAGTGACCAGCGCCGCAATATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCCGGTGGTGATTATATGGTGGTGTGGCGTCCGGTAACGCCATc > 2:248948/1‑275 (MQ=255) ccTGGTCGATCTTGGCCTGACACTGTCATCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTg > 1:527736/1‑179 (MQ=255) gTCGATCTTTGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTTGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGc < 2:527728/179‑1 (MQ=255) gCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAAtgtggcccaaacaatgtaaacatctctttgccgaccttcagacgacaatcgcgtgggtcgatcttgtcgacaaaggccagcgcgtcatcacgattatgataatcaagggcaacaaccac < 2:250837‑M2/175‑120 (MQ=255) gACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAAtgtggcccaaacaatgtaaacatctctttgccgaccttcagacgacaatcgcgtgggtcgatcttgtcgacaaaggccagcgcgtcatcacgattatgataatcaagggcaacaaccacagga > 1:250842‑M2/1‑52 (MQ=255) cTGCAGATTATGCATAACGTCGTGCGGCACTTACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTANACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGACGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTTGATTATATGGTGATTGGTCGCCCGGTAACGCAATCGGTAGATCCAGCGCAGTCGCTGAAAGGGATCaa < 1:529392/274‑1 (MQ=255) tGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTTGATTATCTGGTGATTGGTCGCCCGGTAACGCACGCGGTCGATCCAGCGCAGACGCGGAAAGCGATCAACg > 2:289290/1‑275 (MQ=255) gtaGATTATGAAGAAGGTCTGGCGGCACTGAGGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTTGATTATATGGTGATTGGTCGCCCGGTAACGCAATCGGTAGATCCAGCGCAGACGCTGAAAGCGATCAACg < 1:413648/272‑1 (MQ=255) tGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGACGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTCTAAACAGGTATCCGGTCAGGAGTTCAAAATGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTCTGACGCAAAAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTGGATTATATGGGGATTGGTGGCCCGGACACGGAGACGGGAGATGGAGCGAAGCAGGTGAAAGCGATCaaggaatacagac > 2:111067/1‑264 (MQ=255) gTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTTGATTATATGGTGATTGGTCGCCCGGTAACGCAATCGGTAGATCCAGCGCAGACGCTGAAAGCGATCAACGCCTCTTTACAGCGGAg < 1:289296/274‑1 (MQ=255) aCTGACGCCAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGtt > 1:4879/1‑178 (MQ=255) aCGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCGGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTTGAtt < 2:4879/178‑1 (MQ=255) | TCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAAATGTGGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTTGATTATATGGTGATTGGTCGCCCGGTAACGCAATCGGTAGATCCAGCGCAGACGCTGAAAGCGATCAACGCCTCTTTACAGCGGAG > CP009273/1336384‑1336908 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |