New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | CP009273 | = 3609842 | 65 (1.690) | 5 (0.130) | 5/304 | NT | 7.6% | coding (301/834 nt) | nikC | nickel transporter subunit |
? | CP009273 | = 3610234 | 58 (1.560) | coding (693/834 nt) | nikC | nickel transporter subunit |
CATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTACACGGTGTATCGTTAACCCTGCAACGCGGGCGCGTGCTGGCGTTAGTCGGCGGTAGCGGCAGCGGGAAATCATTA > CP009273/3609961‑3610506 | ggggaagttGTTGCAGTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGTTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGAcgcg < 1:334055/266‑1 (MQ=255) tCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCCACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCCGGCAGTCGCGGTGATCCCTCCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGCTATCGGCCATATGCTGCCGCACGTCGCGGGGGTGTCTTTCCTTGGCCTCGGATCGACCGCGCCAACCGGCGAGTGGGGCGTGCTGATTTACGCCGCGct < 2:599551‑M2/274‑3 (MQ=255) cGCCTTGTCGGACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGGTCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGcgcc > 1:401818‑M2/1‑271 (MQ=255) cGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGACCATGTCCGGGTGTTTGTCGATCATCTGCCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCACCGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGCGGATGTCTTTCCTTTGCCTCGGTTTGACCGCGCCGACCCCCGAATGGGGCGTGATGATTCACGACGCGAGCCACGTTATCTGGAccccg > 2:318685/1‑273 (MQ=255) cggccgggTGCGCGGCCTGGGGTGTTCTCTCCGCCAACGGTGGTTTGTGGTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGGCATGGGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGGGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCaa < 2:720481/268‑1 (MQ=255) aCGCATGGTGAGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCt > 1:720491/1‑270 (MQ=255) tGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGt < 1:568796/243‑1 (MQ=255) gcgcAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGACTGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACACAGCCGCTGCAAATGTTCTGGc > 1:168704/1‑275 (MQ=255) ggTGATTTCACTTCGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGACCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTgg < 1:318691/275‑1 (MQ=255) ggTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATAACTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTgg > 1:231112/1‑275 (MQ=255) 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gcgAGTTTGTGCTTGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATg < 1:444703/275‑1 (MQ=255) aCGGCTTTCCGGTGCGGGCCCTGTGCGGGTGGTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGAACCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGGCGCGGTGTTGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACACAGCCGCCGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGGGCTATTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCcggtgcgg > 2:94797/1‑271 (MQ=255) tCCGTTGCGGTCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTGCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACt < 1:574706/275‑1 (MQ=255) 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2:709636/1‑75 (MQ=255) ggTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCgggg > 2:46047/1‑93 (MQ=255) tgtgACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGATCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTACACGGTGTATCGTTAACCCTGGAACGCGGgcg < 1:717701/275‑1 (MQ=255) tgACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTgg < 1:46047/93‑1 (MQ=255) tgACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCACCCGCTGCaaa < 1:709646/75‑1 (MQ=255) cgcCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCt > 2:716425/1‑85 (MQ=255) cgcCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCgcgc > 1:210758/1‑212 (MQ=255) ccGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGTGCACGCACACTAATGCCGCNACAGAt > 1:557601/1‑190 (MQ=255) gACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGgcg < 1:716435/85‑1 (MQ=255) gACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACa < 2:210754/212‑1 (MQ=255) atgatTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGa > 2:197488/1‑139 (MQ=255) ttAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGa < 1:197491/139‑1 (MQ=255) ttAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAggacg > 2:574368/1‑144 (MQ=255) cgacgCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGcaca < 1:574377/144‑1 (MQ=255) cgcgcgCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAgcacgca > 2:144198/1‑139 (MQ=255) cgcgcgCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTACACGGTGTATCGTTAACCCTGCAACGCGGGCGCGGGCTGGCGTTCGTCCGCGGTAGCGGCCGCGGGaaagcgc > 2:82919/1‑270 (MQ=255) cgcgcCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTACACGGTGTATCGTTAACCCTGCAACGCGGGCGCGTGCTGGCGTTAGGCGGCGGTAGCGGCAGAgggcactaagtc > 1:305801/1‑265 (MQ=255) cgcgcCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACACTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTACACGGTGTATCGTTAACCCTGCAACGCGGgcg > 2:181618/1‑231 (MQ=255) | CATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGATGCTGCACGTCGCGGGGATGTCTTTCCTTGGCCTCGGTGTGACCGCGCCGACCGCCGAATGGGGCGTGATGATTAACGACGCGCGCCAGTATATCTGGACCCAGCCGCTGCAAATGTTCTGGCCGGGGCTGGCGCTGTTTATCAGCGTGATGGCCTTTAACCTGGTGGGTGACGCACTGCGCGATCATCTGGACCCTCATCTGGTGACGGAGCACGCACACTAATGCCGCAACAGATTGAACTACGTAATATCGCGCTACAGGCCGCGCAGCCGCTGGTACACGGTGTATCGTTAACCCTGCAACGCGGGCGCGTGCTGGCGTTAGTCGGCGGTAGCGGCAGCGGGAAATCATTA > CP009273/3609961‑3610506 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |