New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 2697456 = | 25 (0.620) | 8 (0.220) | 4/284 | NT | 20.5% | intergenic (‑34/+238) | rnc/lepB | RNase III/leader peptidase (signal peptidase I) |
? | CP009273 | 2697550 = | 39 (1.060) | intergenic (‑128/+144) | rnc/lepB | RNase III/leader peptidase (signal peptidase I) |
TGCCACGGACCAGCGTGGCGCGCATCCGGCTCATATCGCCTTCATCCACACGAGGGAAACGGTGATAAAGCGCATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTC > CP009273/2697188‑2697651 | tGCCACGGACCAGCGTGGCGCGCATCCGGCTCATATCGCCTTCATCCACACGAGGGAAACGGTGATAAAGCGCATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTAAACAATACAGCACACg > 1:10624/1‑275 (MQ=255) cgagTGGGGGGCATCCCGCTCAAAGCGCCTTCATCCACACGAGGGAAACGGTGATAAAGCGAATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTg < 2:10624/272‑1 (MQ=255) gCGTGGCGCGCATCCGGCTCATATCGCCTTCATCCACACGAGGGAAACGGTGATAAAGCGCATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTg > 1:253817/1‑274 (MQ=255) cGTGGCGCGCATCCGGCTCATATCGCCTTCATCCACACGAGGGAAACGGTGATAAAGCGCATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGcaca > 1:649307/1‑260 (MQ=255) cGTGGCGCGCATCCGGCTCATATCGCCTTCACCCACACGAGGGAAACGGTGATAAAGCGCATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGcaca < 2:649293/260‑1 (MQ=255) aggccgtCCGGCCTATCTCGCCTTCATCCACATGAGGGAAACGGTGATAATGCGCATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTCAATGTTCTAAACTCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGCTTAAAAGTGTAGCCCATCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCCACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACa < 2:740169/269‑1 (MQ=255) cacGAGGGAAACGGTGATAAAGCGCATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAg > 1:64805/1‑221 (MQ=255) aGGGAAACGGTGATAAAGCGCATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGcaca < 2:64804/221‑1 (MQ=255) aagcaagaaggctaatggccgactggtctgcgcttaagtcgcattggaggcatccattaatagccatcttcgttcacgttgtcgccgttatngcgacaacgtgaattatttatgagataaatctcccgtggctaacgacatcccccgtcgttgtgtatagaatattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTACGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATg > 1:551702‑M1/205‑275 (MQ=255) aagcaagaaggcgaatggccgactggtctgcgcttaagtcgcattggcggcatccattaatagccatcttcgttcacgttgtcgccgttatggcgacaacgtgaattatttatgagataaatctcccgtggctaacgacatcccccgtcgttgtgtatagaatattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATg > 1:338698‑M1/205‑275 (MQ=255) gcATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGCTGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATCAAGCACAGGAAACAGACCTGATATACATGCTTCTGCTAACTCCTTCGCTGCAGTTTAAGTTAACCTGTATATGGCGACCa > 1:161917/1‑275 (MQ=255) cTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGcgg > 1:362534/1‑273 (MQ=255) gAACAGAGTTACCTTATAATTCTTACCGCTCAGTATGTTTACTGGTGGCAAGACGATGAGTTAATTCCTGCTGCAACAGTTCCTTATGATTAAACGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTgg < 2:293199/274‑1 (MQ=255) agTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGTNTGGGCAACCTg > 2:72569/1‑275 (MQ=255) ttggcggcatccattaatagccatcttcgttcacgttgtcgccgttatggcgacaacgtgaattatttatgagataaatctcccgtggctaacgacatcccccgtcgttgtgtatagaatattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGcaca < 1:642741‑M1/5‑1 (MQ=255) aaaaTTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCa < 2:253814/275‑1 (MQ=255) cggcatccattaatagccatcttcgttcacgttgtcgccgttatggcgacaacgtgaattatttatgagataaatctcccgtggctaacgacatcccccgtcgttgtgtatagaatattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGCACACGaa > 2:642727‑M1/158‑166 (MQ=255) gTTATGTTGACGGATGGCACGACGATGGCTTAATGCCTGCTGCCACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGAGGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCGTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCgggg < 2:627043/275‑1 (MQ=255) aCGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAAc > 1:239423/1‑134 (MQ=255) tGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGAc < 2:239420/134‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGtt < 1:72570/275‑1 (MQ=255) tgctgcAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCacac > 2:17635/1‑113 (MQ=255) gcAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGaaa < 1:17635/113‑1 (MQ=255) tatgagataaatctcccgtggctaacgacatcccccgtcgttgtgtatagaatattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGta < 2:329490‑M1/67‑1 (MQ=255) agataaatctcccgtggctaacgacatcccccgtcgttgtgtatagaatattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATg > 1:329496‑M1/91‑161 (MQ=255) ttAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGGCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTAGGGGGAATATTGTAGACACAAAGACGGGGGATATCGGTAGCCGGGGGGGATTTTtctaaaaa > 2:6227/1‑270 (MQ=255) ggtAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACAGGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTc < 1:447629/274‑1 (MQ=255) tAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCtt > 1:338219/1‑120 (MQ=255) ctaacgacatcccccgtcgttgtgtatagaatattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGta < 1:225357‑M1/67‑1 (MQ=255) ccAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCt < 2:338213/120‑1 (MQ=255) cgacatcccccgtcgttgtgtatagaatattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATg > 2:225355‑M1/70‑140 (MQ=255) cTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTa > 1:150633/1‑105 (MQ=255) cGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTg < 2:150632/105‑1 (MQ=255) cgttgtgtatagaatattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGta < 1:623465‑M1/67‑1 (MQ=255) gtgtatagaagattcccccgaagtttaaggttggcacctccaggttgccacgGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATg > 2:623451‑M1/53‑123 (MQ=255) cATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAg > 1:643533/1‑37 (MQ=255) cGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGcaca < 2:643519/37‑1 (MQ=255) aTACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACAt > 2:724207/1‑56 (MQ=255) cAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGtt < 1:724221/56‑1 (MQ=255) tGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGata > 2:205473/1‑36 (MQ=255) tCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACa < 1:205475/36‑1 (MQ=255) | TGCCACGGACCAGCGTGGCGCGCATCCGGCTCATATCGCCTTCATCCACACGAGGGAAACGGTGATAAAGCGCATTGGCGATAACGTAGCTCAGAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTC > CP009273/2697188‑2697651 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |