| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2697456 = | 25 (0.620) | 8 (0.220) | 4/284 | NT | 20.5% | intergenic (‑34/+238) | rnc/lepB | RNase III/leader peptidase (signal peptidase I) |
| ? | CP009273 | 2697550 = | 39 (1.060) | intergenic (‑128/+144) | rnc/lepB | RNase III/leader peptidase (signal peptidase I) | |||||
GAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGC > CP009273/2697281‑2697824 | gAACAGAGTTACCTTATAATTCTTACCGCTCAGTATGTTTACTGGTGGCAAGACGATGAGTTAATTCCTGCTGCAACAGTTCCTTATGATTAAACGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTgg < 2:293199/274‑1 (MQ=255) agTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGTNTGGGCAACCTg > 2:72569/1‑275 (MQ=255) aaaaTTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCa < 2:253814/275‑1 (MQ=255) gTTATGTTGACGGATGGCACGACGATGGCTTAATGCCTGCTGCCACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGAGGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCGTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCgggg < 2:627043/275‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGtt < 1:72570/275‑1 (MQ=255) ttAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGGCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTAGGGGGAATATTGTAGACACAAAGACGGGGGATATCGGTAGCCGGGGGGGATTTTtctaaaaa > 2:6227/1‑270 (MQ=255) ggtAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACAGGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTc < 1:447629/274‑1 (MQ=255) CACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAg < 2:419444‑M1/108‑1 (MQ=255) CACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAg < 2:605329‑M1/108‑1 (MQ=255) CGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGTCGTGGCAACCTGGAGGTGc > 1:605342‑M1/1‑108 (MQ=255) CGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGTTGc > 1:419451‑M1/1‑108 (MQ=255) acaCCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGcc > 2:540065/3‑84 (MQ=255) ccTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGACGTTAACCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGTCGACAACGTGAAAGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGAAGACCAGTCGGCCATTCgac > 1:650786/1‑273 (MQ=255) cTGATATACATTGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATCGGGACCAACGCAGTTTCGTGTGCCGTgg < 1:540075/84‑1 (MQ=255) catataccggtaaactgaaactgcagcgtagcagttagcagaaccatgtatatcaggtctgtttcgtgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCNATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCTCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTAGCCTTCTTGCtt > 1:551702‑M2/72‑275 (MQ=255) catataccggtaaactgaaactgcagcgaagcagttagcagaaccatgtatatcaggtctgtttcgtgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATCTTCTATacac > 2:623451‑M2/72‑123 (MQ=255) catataccggtaaactgaaactgcagcgaagcagttagcagaaccatgtatatcaggtctgtttcgtgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCg > 2:225355‑M2/72‑140 (MQ=255) catataccggtaaactgaaactgcagcgaagcagttagcagaaccatgtatatcaggtctgtttcgtgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTAtct > 1:329496‑M2/72‑161 (MQ=255) catataccggtaaactgaaactgcagcgaagcagttagcagaaccatgtatatcaggtctgtttcgtgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCtt > 1:338698‑M2/72‑275 (MQ=255) tGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCgg > 2:288393/1‑104 (MQ=255) ggTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCgg > 2:258657/1‑103 (MQ=255) ggTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCta > 1:654962/1‑115 (MQ=255) taccggtaaactgaaactgcagcgaagcagttagcagaaccatgtatatcaggtctgtttcgtgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAacg < 1:623465‑M2/56‑1 (MQ=255) taccggtaaactgaaactgcagcgaagcagttagcagaaccatgtatatcaggtctgtttcgtgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAg < 1:225357‑M2/73‑1 (MQ=255) taccggtaaactgaaactgcagcgaagcagttagcagaaccatgtatatcaggtctgtttcgtgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCata < 2:329490‑M2/94‑1 (MQ=255) ttCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAAc > 1:304660/1‑75 (MQ=255) ttCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAAtt > 2:204758/1‑167 (MQ=255) ttCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCa > 2:614383/1‑169 (MQ=255) ttCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCg > 2:163386/1‑177 (MQ=255) ttCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGACAATTAATGAATGCCGCCAATGGAACTTAAGCGCAGACAAGGCGTCCATGCGCcttctttcggttcaa > 2:577621/1‑266 (MQ=255) tCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGa < 1:288398/104‑1 (MQ=255) cgtataacggggtCGCGGAAGTTTCAAGTGACCGGTATGTGGGGACAGAGTATGTTTTGTGTGGCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAAACATGGAGATCGGGGGAATATTCTACACAAGCCGACGGCGGAAGTCGTGAGCCACTGTAGAGTTAACGCATAAGTAATTGACATAGGCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTACTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTGAGAACAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTATTGCTTATCgt < 2:161915/261‑2 (MQ=255) cTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGaa > 2:43163/1‑104 (MQ=255) cTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGa < 1:258660/103‑1 (MQ=255) cTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATaca < 2:654948/115‑1 (MQ=255) gCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTgg < 2:304655/75‑1 (MQ=255) gCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACg < 1:204760/167‑1 (MQ=255) gCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGtt < 1:614396/169‑1 (MQ=255) gCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCAt < 1:163388/177‑1 (MQ=255) tAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATAtt < 1:43164/104‑1 (MQ=255) atggCTTCGCTGTAGTTTCAGTGTAACGGTATATGGGGACACACGCTTGTTCGTGTGACGTGGCAACCTGAAGGTGACAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGTATTGCGTTAGCCACGTGACATTTATCTCATCAATAATTCATGTTGTCGGCATACCGGCGACAACGTTAACGAAGATTGCTATTAATGGACGCCGCCAATGCGACTTAATCGCATACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTTCTTATCGAAGCTCAt < 2:650772/271‑1 (MQ=255) tGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCa > 1:176838/1‑159 (MQ=255) tCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGtt < 2:176836/159‑1 (MQ=255) cGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAACTAATTAACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCAAGATAg > 1:649019/1‑275 (MQ=255) cagtttcagtttACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATAcaca > 1:160067/1‑99 (MQ=255) ttcagtttACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAacga < 2:160065/99‑1 (MQ=255) aCCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCa > 2:164040/1‑223 (MQ=255) gTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCg < 1:164042/223‑1 (MQ=255) tatGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTc > 2:302340/1‑60 (MQ=255) gggACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCgggg < 1:302345/60‑1 (MQ=255) aCCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGAGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATCAGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCACAGATCATCAAGATAGCCTTTACCCGACCCACCAGATTCGCTcccc > 1:706286/1‑273 (MQ=255) ccAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAGCTTc > 2:487981/1‑52 (MQ=255) ccAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGcc > 1:425766/1‑94 (MQ=255) ccAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTCCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGAt > 1:37246/1‑84 (MQ=255) cGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCg < 2:37245/84‑1 (MQ=255) cGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACgg < 2:425759/94‑1 (MQ=255) cGCTGTTTCGTGTGCCGCGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAGCTTCgggg < 1:487990/52‑1 (MQ=255) ttcgtgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATgccg > 2:642727‑M2/10‑166 (MQ=255) tgtgcCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCaa < 1:642741‑M2/161‑1 (MQ=255) cGTGGCTACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCNTAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGc < 1:577634/275‑1 (MQ=255) cGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCtata > 2:139339/1‑49 (MQ=255) | GAATAGAGTCGCCTAAAAATTCTAAACGCTCGTTATGTTTACTGCTGGCACTACGATGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGC > CP009273/2697281‑2697824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |