| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009273 | = 2946067 | 76 (1.890) | 4 (0.100) | 4/296 | NT | 5.4% | coding (3296/3543 nt) | recB | exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit |
| ? | CP009273 | = 2946203 | 68 (1.770) | coding (3160/3543 nt) | recB | exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit | |||||
TACCGGCAAACATCTCATCCATCAGGGCAATCAACCCGGCGTTGGGTCGGGTTGTGTAAATCCCCTGTTGCGGATGTTCTTTATCAACGCCACGCAGGAACAGATAAATAACGCCGCCAAAGTGGTGCTCATAGTCGTAATCAGCAATGCGATGGCGCAGATAACGATGCAGCGCCAGGGTATAAAGCTGATATTGCAGATCATAGCGGTGT‑GCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGCAGCCTGCGGATAGCGGGTCAAACTGGCGGATTAACGTATCAAGCTGACTGGCGATAAGCGGTTCACTAATCGGCAGATAAAACTCCATCTCCACCTGTTTATTGCGGGCGGAAAGT > CP009273/2945840‑2946330 | tACCGGCAAACATCTCATCCATCAGGGCAATCAACCCGGCGTTGGGTCGGGTTGTGTAAATCCCCTGTTGCGGATGTTCTTTATCAACGCCACGCAGGAACAGATAAATAACGCCGCCAAAGTGGTGCTCATAGTCGTAATCAGCAATGCGATGGCGCAGATAACGATGCAGCGCCAGGGTATAAAGCTGATATTGCAGATCATAGCGGTGT‑GCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGtt > 1:4323/1‑240 (MQ=255) 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atcTGGGCAATCAACCGGGCGTTGGGTCGGGTTGTGTAAATCCCCTGTTGCGGATGTTCTTTATCAACGCCACGCAGGAACAGATAAATAACTCCGCCAAAGTGGTGCTCATAGTCGTAATCAGCAATGCGATGGCGCAGATAACGATGCAGCGCCAGGGTATAAAGCTGATATTGCAGATCATAGCGGTGT‑GCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGc < 1:416694/270‑1 (MQ=255) ccGGCGTTGGGTCGGGTTGTGTAAATCCCCTGTTGCGGATGTTCTTTATCAACGCCACGCAGGAACAGATAAATAACGCCGCCAAAGTGGTGCTCATAGTCGTAATCAGCAATGCGATGGCGCAGATAACGATGCAGCGCCAGGGTATAAAGCTGATATTGCAGATCATAGCGGTGT‑GCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGgtg > 1:422820/1‑210 (MQ=255) cGTTGGGTCGGGTTGTGTAAATCCCCTGTTGCGGATGTTCTTTATCAACGCCACGCAGGAACAGATAAATAACGCCGCCAAAGTGGTGCTCATAGTCGTAATCAGCAATGCGATGGCGCAGATAACGATGCAGCGCCAGGGTATAAAGCTGATATTGCAGATCATAGCGGTGT‑GCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAg < 2:422813/210‑1 (MQ=255) tGGGTCGGGTTGTGTAAATCCCCTGTTGCGGATGTTCTTTATCAACGCCACGCAGGAACAGATAAATAACGCCGCCAAAGTGGTGCTCATAGTCGTAATCAGCAATGCGATGGCGCAGATAACGATGCAGCGCCAGGGTATAAAGCTGATATTGCAGATCATAGCGGTGT‑GCCTGCATTGCCGCTGcc < 2:33272/188‑1 (MQ=255) 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cAGATCATAGCGGTGT‑GCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGCAGCCTGCGGATAGCGGGTCAAACTGGCGGATTAACGTATCAAGCTGACTGGCGATAAGCGGTTCACTAATCGGCAg > 1:430201/1‑255 (MQ=255) gCGGTTT‑GCCTGCATTGCCGCTGCCATAGGCTGGTGTGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGCTTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATGAAGCCTGTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGCAGCCTGCGGATAGCGGGTCAAACTGGCGGATTAACGTATCAAGCTGACTGGCGATAAGCGGTTCACTAATCGGCAGATAAAACTCCATCTCCACCTGTTTATTg < 1:445576/274‑1 (MQ=255) gCGGTGT‑GCCTGCACTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGgt < 1:523507/39‑1 (MQ=255) gtgt‑GCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCcagcggc < 2:574740‑M2/163‑8 (MQ=255) tgt‑gCCTGCATTTCTGCTGCCATAGCCTGTTGGGAGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCTAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACTTCCCACGAACCTGCATGAACTCCACCGGCGGgccgcc > 2:553229/1‑170 (MQ=255) t‑gCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAacac > 2:504094/1‑108 (MQ=255) t‑gCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTAcc > 2:642480/1‑142 (MQ=255) t‑gCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGCAGCCTGCGGATAGCGGGTCAAACTGGCGGAGAAACGTAACAAGCTGACTGGCGATAAGCGGTTCACTAATCGGCAGATAAAACTACAACTCCACCTGTTTATTacgggcg > 1:687196/1‑274 (MQ=255) gtcacttccttcccGCTGCCATAGCCTTTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCCTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGGCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCCCGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGCAGCCTGCGGATAGCGGGTCAAACTGGCGGATTAACGTATCAAGCTGACTGGCGATAAGCGGTTCACTAATCGGCAGATAAAACTCCATCTCCACCTGTTTATTgcgggc < 2:687182/262‑1 (MQ=255) gCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGc < 1:574753/163‑1 (MQ=255) ccTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGCAGCCTGCGGATAGCGGGTCAAACTGGCGGATTAACGTATCAAGCTGACTGGCGATAAGCGGTTCACTAATCGGCAGATAAAACACCACCCCAACCTGGTTATTGCGGGGGGaa > 2:717126/1‑275 (MQ=255) ccTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTCCATGAACTCCACCGGCGGGCAGCCTGCg < 1:553240/170‑1 (MQ=255) tGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTNTCTTCA‑CCNAACCAGTTGGATCTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGCAGCCTGCGGATAGCGGGTCAAACTGGCGGATTAACGTATGAAGCTGACTGGCGATAAGCGGTTCACTAATCGGc < 1:486286/234‑1 (MQ=255) tGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAgg < 1:504103/108‑1 (MQ=255) tGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCa < 1:642494/142‑1 (MQ=255) cATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTACTAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGCAGCCTGCGGATAGCGGGTCAAACTGGCGGATTAACGTATCAAGCTGACTGGCGATAAGCGGTTCACTAATCGGCAGATAAAACTCCATCTCCACCTGTTTATTGCGGGCGGAAAGt < 1:717140/274‑1 (MQ=255) gCCGCTGgagttcatgcaggtacgtggcatgttaaaaggctttatcgacctggtgttccgccacgaagggcgttattacctgctcgactataaatccaactggttgggtgaagacagttcggcttacacccaacaggctatggcagcggcaatgcaggcacac < 2:574740‑M1/163‑157 (MQ=255) gCCGCTGgagttcatgcaggtacgtggcatgttaaaaggctttatcgacctggtgttccgccacgaagggcgttattacctgctcgactataaatccaactggttgggtgaagacagttcggcttac < 1:697104‑M1/127‑121 (MQ=255) ccGCTGgagttcatgcaggtacgtggcatgttaaaaggctttatcgacctggtgttccgccacgaagggcgttattacctgctcgactataaatcc < 2:233849‑M1/96‑91 (MQ=255) | TACCGGCAAACATCTCATCCATCAGGGCAATCAACCCGGCGTTGGGTCGGGTTGTGTAAATCCCCTGTTGCGGATGTTCTTTATCAACGCCACGCAGGAACAGATAAATAACGCCGCCAAAGTGGTGCTCATAGTCGTAATCAGCAATGCGATGGCGCAGATAACGATGCAGCGCCAGGGTATAAAGCTGATATTGCAGATCATAGCGGTGT‑GCCTGCATTGCCGCTGCCATAGCCTGTTGGGTGTAAGCCGAACTGTCTTCA‑CCCAACCAGTTGGATTTATAGTCGAGCAGGTAATAACGCCCTTCGTGGCGGAACACCAGGTCGATAAAGCCTTTTAACATGCCACGTACCTGCATGAACTCCAGCGGCGGGCAGCCTGCGGATAGCGGGTCAAACTGGCGGATTAACGTATCAAGCTGACTGGCGATAAGCGGTTCACTAATCGGCAGATAAAACTCCATCTCCACCTGTTTATTGCGGGCGGAAAGT > CP009273/2945840‑2946330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |