New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 4626358 | 61 (1.520) | 5 (0.130) | 4/288 | NT | 8.8% | coding (535/690 nt) | creB | response regulator in two‑component regulatory system with CreC |
? | CP009273 | = 4626652 | 47 (1.260) | coding (140/1425 nt) | creC | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon |
GTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTGCTGGGCTATTTTTTACTGGTGGCGGTGGCAGCCTGGTTCGTACTGGCCATTTTTGTCAAAGAAGTTAAACCGGGCGTGCGAAGAGCAACGGA > CP009273/4626085‑4626628 | ggcGATCGCCTGCCGGGCTTGGAAATTTCTGCTGAGGACTACGAGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGGAGTGTGCGCCAGGGTGCGCGACTCACTGCGTCGCGTGAAGCTGTTCTCGACGCCGTCCCCCGTCATCCGTCTAGGACATTTTTAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGACCAGCTGGTTTGACACGCAATTATCGCTGACTCGGCACGCGAGTGTCATGTTGCAGACTGTACTCAAGTCACAGGTCCCGGTCTGGCCCTGCCCGCACCt > 2:254975/3‑275 (MQ=255) gCCTGCTTTGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCANCTTACTGCNTCGGGTGAAGAACTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCAACGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGa < 1:480482/274‑1 (MQ=255) ggCTGGAATTTGGTGCTGACGACTACTTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATg < 1:70475/274‑1 (MQ=255) ttGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCNACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATgcg < 1:535687/275‑1 (MQ=255) tgggtcTGACGACTACGTGGCTAAGCGGTTTGCCCCCCGCGAAGTGGGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATgcgc < 2:3351/270‑1 (MQ=255) ttttCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAGGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCCACTGATGGATAGCGTATGGGAAGCAGAGCAGGCCACCTACGATCGCACCGTCGAt > 1:273373/1‑273 (MQ=255) tttCACGCCGGTAAGTGTTCGACAGTGTGCGCTCCTTACTGCGTCGTGTGCAGTAGTTGTCGACGCCGTCTTCCGTCATCCGTATTGGACATTTTTCATTGAATGAACACGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATAcc < 1:156046/275‑1 (MQ=255) gcgAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATgg > 2:35895/1‑227 (MQ=255) aGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAg < 1:35896/227‑1 (MQ=255) tGCGCATCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTGTTATTGTTGACGCCGTTACTCAAGTCACCGAGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCCACTgc > 2:438163/1‑194 (MQ=255) ccccTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGa < 1:438170/193‑1 (MQ=255) gaCTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGNTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATc < 1:554766/274‑1 (MQ=255) ttcGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCTTCTCCCGGTTTCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGGGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACgttgcggtgtcgatcaacgtcccctccgttgctcttcgcacgcccggtttaacttctttgacaaaaatggccagtacgaaccaggctgccaccgcc < 2:333461‑M1/272‑97 (MQ=255) cGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACgttgcggtgtcgatcaacgtcccctccgttgctcttcgcacgcccggtttaacttctttgacaaaaatggccagtacgaaccaggctgccaccgccac > 1:333467‑M1/1‑175 (MQ=255) cGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACGAAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCACCTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACCCCTACGATAGCACCGTCGa > 1:258074/1‑227 (MQ=255) ggTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGTCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCCACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGTACACCTCCGATCTCACCGTCGATACCCACATAAAACAGCTGCGCGCCCAGCTGCGCGCCCTCCAcccccct > 2:260028/1‑271 (MQ=255) agaagTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCa < 1:260031/275‑1 (MQ=255) cttctcccGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCNAGTCACCGGGACGCGCCAGCT‑CCGCCAGCAACgttgcggtgtcgatcaacgtcccctccgttgctcttcgcacgcccggtttaacttctttgacaaaaatggccagtacgaaccaggctgccaccgccaccagtaaaaaatagcccagcaac < 1:625232‑M1/270‑121 (MQ=255) tctcCCGTTTTCTGTTTTTGACATTTTGATTTGAATGAACCCGCGGCGCAGTTCAGCTGGTTTGACATGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTCGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCAt < 1:254978/273‑1 (MQ=255) cccGTCAGTCGTATTGGCCATTTTGAATTGAATGAGCCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTGTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGACGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATcgcg < 1:465119/274‑1 (MQ=255) gggtgcagtngtGGACCTGTTGAATGGCAGCAACCGGCGCGGCTGTTCTGCTGGTTTGTCACGCCATTAGCGTTGACTAGGGATGATGTGGTAGTGTTGAAGACGTTACGCAAGTCCCCGGGCCGCGTCAGGTCCCGATAGCAACTGGTGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGTATACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAACCGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCAGCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATCCTCATCGCGGCAt < 2:273369/264‑1 (MQ=255) cATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACgttgcggtgtcgatcaacgtcccctccgttgctcttcgcacgcccggtttaacttctttgacaaaaatggccagtacgaaccaggctgccaccg > 1:328199‑M1/1‑143 (MQ=255) cATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGACGCGCCAGCT‑CCGCCAGCAACgttgcggtgtcgatcaacgtcccctccgttgctcttcgcacgcccggtttaacttctttgacaaaaatggccagtacgaaccaggctgccaccgcccacaggaaaaaatagcccagcaacaaccgcacccccc > 2:625218‑M1/1‑142 (MQ=255) tATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATc > 1:222725/1‑179 (MQ=255) tATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGAtata > 1:49715/1‑275 (MQ=255) tGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATa > 1:585860/1‑143 (MQ=255) ggACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCAc < 2:222723/179‑1 (MQ=255) tcATTTTGAAGTGAATTAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGATTTTTTATTGTTGAAGGCGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGa < 1:276806/274‑1 (MQ=255) cATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGt < 2:585847/143‑1 (MQ=255) tgtttGAATGTAATGAACCGGCGGGGCAGATCAGCTGGTTTGACAAGCCATTAGCGCTGGGTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGCAGACGTTAATCAAGTCACCGGGCCGAGTCGGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAg < 2:694680/272‑1 (MQ=255) tttGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGa > 1:445709/1‑130 (MQ=255) tttGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCTCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAggg > 1:694694/1‑274 (MQ=255) tttGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCAt > 1:28868/1‑257 (MQ=255) tttGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCAt < 2:28867/257‑1 (MQ=255) tttGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGAAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCCAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACAGATTAATACTCACCACGGCATGGGATAAAGCCTAAggg > 1:77097/1‑274 (MQ=255) aattgaatGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGa < 2:445702/130‑1 (MQ=255) attgaatGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCt > 1:48159/1‑225 (MQ=255) attgaatGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCAGTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCCGCCACTGATGTATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGTACCGTCGATCCCCCCCTNACAACGCTTCg > 1:575615/1‑195 (MQ=255) 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tATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACTGGGCCGCGTCTGGTCCCTCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAATCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTCTCACCCTTTCACACTCATCTCGCCATGCGCTAAAGCCCGCAGGTCCTGTCACCCGTATCGGCATGCGGATGCTGTTGGGCGATTTTCTCCGGGTGGTGGTGGCATCCTAGtgtttgg > 2:6194/1‑269 (MQ=255) gttgAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATg > 2:441367/1‑181 (MQ=255) aaGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGat < 1:441374/181‑1 (MQ=255) tACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATcgcg > 1:681838/1‑165 (MQ=255) tACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGCGGGGCCGGTAATGCGTATCGGTATGCGGTTGTTGCTGGGCTCTTTTTTACTGGTGGCGGTGGCAGCCTGGGTCGTACTGGCCCTTTTTTTct > 2:691392/1‑274 (MQ=255) cAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCAt < 2:681824/165‑1 (MQ=255) ccggCCGCGTATGGTTCAACCAGCAACTGATGGACAGCGTATGCGAAGATGAGCAGTACACCTACGATCGCACCGTCGATATCCGCATCAAAACGCTGCGTGCCAAGATCCGCGCCATCAACCCCACTATTTAACCGCTTAATACCCATCGCGGCCGGGGATACAGCATGCGGGGCCGGTTATGCGGATCGCCATGCGGTCGTTTAGGCGCTTGTTTTTACTGATGGCGGTGGCAGCCGGGGGCGCACCGGCCATTTTGGTTAACGACGTaaaaa > 2:176310/3‑274 (MQ=255) cGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTGCTGGGCTATTTTTTACTGGTGGCGGGGGCAGGCTGGGTCGTACTGTGCCTTTTTGTCTAAGCAGGTAAAc > 2:112948/1‑275 (MQ=255) ggcgTCTGGTCCCGGCAGGAACTGGTGGATAGCGTATGGGAAGGTGCGCACGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTGTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTGCTGGGCTATTTTTTACTGGTGGCGGTGGCAGCCTGGTTCGTACTGGCCATTTTTGTCAAAGAAGTTAAACCGGGc < 1:6194/274‑1 (MQ=255) gggcccGCCAGTCTCTGATGGATAGCGTCTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTGCTGGGCTATTTTTTACTGGTGGCGGTGGCAGCCTGGTTCGTACTGGCCATTTTTGTCAAAGAAGTTAAACCGGGCGTGCGaa < 2:49714/272‑1 (MQ=255) ccAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAg > 2:299230/1‑37 (MQ=255) gCAACTTATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTGCTGGGCTATTTTTTACTGGTGGCGGTGGCAGCCTGGTTCGTACTGGCCATTTTTGTCAAAGAAGTTAAACCGGGCGTGCGAAGAGCAACGGa < 1:112949/275‑1 (MQ=255) cAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGaca < 1:299235/37‑1 (MQ=255) | GTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTGCTGGGCTATTTTTTACTGGTGGCGGTGGCAGCCTGGTTCGTACTGGCCATTTTTGTCAAAGAAGTTAAACCGGGCGTGCGAAGAGCAACGGA > CP009273/4626085‑4626628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |