New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 351197 | 32 (0.800) | 4 (0.100) | 4/296 | NT | 11.8% | coding (565/1260 nt) | codB | cytosine transporter |
? | CP009273 | = 351248 | 29 (0.760) | coding (616/1260 nt) | codB | cytosine transporter |
ACTGGGCGGAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTGGGGCTGAATATCTGGA > CP009273/350932‑351464 | aCTGGGCGGAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCCTGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTa > 1:438942/1‑274 (MQ=255) cgtgtGGCTGGTTTCGCGTATGTGNGCCTTTGTTTGCCGTTCCGGTAGGTTAGGCAATCGGGCTGGTTATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCTGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCGGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGAACAACCGTTAGATTTCAAAGTcgcg < 2:438935/271‑1 (MQ=255) ttGGTTTGTTTGTCGTCTGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCgcgct < 1:437631/274‑1 (MQ=255) gtaaCCGGGCTTGTTATTTGTTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCAACGTCTTTGTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTTTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTTCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACt < 1:316893/272‑1 (MQ=255) gCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCGGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGtt < 1:314296/226‑1 (MQ=255) atTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGTTCATTTATCCGTGCGGGTACGCCCACCGCTGAATTTTTCCTGttttggg > 1:81170/1‑270 (MQ=255) ctgTTTCCGGTTTACTTATGACCGTCACCGTCTTTTTTTGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGGGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCGGCCTGGGAGGTTATTCAGGGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCGGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCg < 1:385308/273‑1 (MQ=255) ccGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTNTTTGGCATTTTTGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCgcgct < 1:679724/193‑1 (MQ=255) aCTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTtgt > 1:38696/1‑192 (MQ=255) atgaCCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTgggg < 2:38695/192‑1 (MQ=255) cgtcaccgtcTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCCTTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGCCTTTGTCCGGGTTGGTCGCAATGCCAAACTGGGGGGGCgggttcgggtggtttcc > 2:611690/1‑261 (MQ=255) ttttttGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGCGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAANGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGATGACTTTGTCCGGTTTGGGCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGTCGGCG‑TGGTGGCCTTTTTTCTCgt > 1:610593/1‑274 (MQ=255) tCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACtgataaatgaccccacaaccagcgccagcgcgaca > 2:631114‑M1/1‑110 (MQ=255) tCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACtgataaatgaccccacaaccagcgccagcgcgacattga < 1:631128‑M1/145‑40 (MQ=255) gTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTa > 1:171637/1‑154 (MQ=255) ttCCGGCTAGCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTtgtg < 1:461875/131‑1 (MQ=255) cGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCt < 2:171635/154‑1 (MQ=255) cGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGCTGTTTATTTTCTGTGCAGCGGGCGCGGCGGGACTg > 1:225593/1‑275 (MQ=255) gtgGGGGGTTAGTCCGTGTGGCTTGCTGTGAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAAGGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCTGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGatat < 2:225591/274‑1 (MQ=255) aCGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTAGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGTAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCctgctg < 1:707946/275‑1 (MQ=255) gCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACtgataaatgaccccacaaccagcgccagcgcgacatt > 1:375022‑M1/1‑42 (MQ=255) cATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACt > 2:131579/1‑185 (MQ=255) cATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGATGGTtgt > 1:51315/1‑78 (MQ=255) gggCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACtgataaatgaccccacaaccagcgccagcgcgacattgaaa < 2:375015‑M1/79‑42 (MQ=255) ggcggcCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTgggg < 2:51314/78‑1 (MQ=255) ggcggcCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGtt < 1:131580/185‑1 (MQ=255) gcggcCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGACTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGctgcctgc < 1:387859/274‑1 (MQ=255) gcCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGATATCTCTGATGTGATTATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCg > 1:442883/1‑272 (MQ=255) aTTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTc > 2:55431/1‑160 (MQ=255) aaaGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCa < 1:55432/160‑1 (MQ=255) aaGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGNCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTGGGGCTg < 1:611703/275‑1 (MQ=255) gTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGc > 2:17292/1‑191 (MQ=255) gTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGCTATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTGGGGCTGAatat > 1:214590/1‑275 (MQ=255) gTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCCCACCGCCGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCACACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGGGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGGTGATGGTTCTTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGATAGCTCTGATGTGATGATTGCTGAGGGCATGCTGCGGCCTGGGATGGTGGTGGGGGGGCGGagttt > 2:166420/1‑271 (MQ=255) ttCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCa < 1:17292/191‑1 (MQ=255) tCCCGCTCAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGTTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCGCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTGGTGCTGAATATCTGGa < 1:154643/275‑1 (MQ=255) cGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGTCGCTGGtt > 1:398629/1‑40 (MQ=255) caACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTgg < 2:398622/40‑1 (MQ=255) | ACTGGGCGGAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAAGCGGTCGTTCCCGCACAACCGTTAGATTTCAATGTCGCGCTGGCGCTGGTTGTGGGGTCATTTATCAGTGCGGGTACGCTCACCGCTGACTTTGTCCGGTTTGGTCGCAATGCCAAACTGGCGGTGCTGGT‑GGCGATGGTGGCCTTTTTCCTCGGCAACTCGTTGATGTTTATTTTCGGTGCAGCGGGCGCTGCGGCACTGGGCATGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTGGGGCTGAATATCTGGA > CP009273/350932‑351464 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |