New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 3516478 = | 24 (0.600) | 3 (0.080) | 3/294 | NT | 8.6% | coding (249/2553 nt) | mrcA | fused penicillin‑binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase |
? | CP009273 | 3516913 = | 41 (1.080) | coding (684/2553 nt) | mrcA | fused penicillin‑binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase |
GATTAAGGAAGTCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCATTTACACCACCATCACCCGCAAAGTGCAGCAGGCCGCGCAGCAGGCGGT > CP009273/3516649‑3517137 | gATTAAGGAAGTCTTCCTCGCCATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGCCGAGCTCCTCGATCTTTATCTGACCAAGCTTTACCTTAGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATg < 1:686980/275‑1 (MQ=255) tgatcgAAGTGTTCCTCTGGATTCGCATTGAACCGCTGTTGCCCTAAGACGAGCTCCTCTGGCTTTATCTTATCAAGTTTTCCCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGACCGATATGGCGGTGATGGCCGGGCTGCCGAACGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGaa < 2:133823/270‑1 (MQ=255) aaGGAAGTATTAGTTGAGATTAGCATTGACCAGCTGCTGACGAAAGACGGGTTCCTCGAGCTTTTTCTGGACAAGATTTGCCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGAGCGTGCCGGCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAgg < 2:559907/275‑1 (MQ=255) aGGAAGTCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAATTGACGATGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAggg > 1:639923/1‑275 (MQ=255) gTCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTNTGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTCCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTatat < 1:515648/275‑1 (MQ=255) gTCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGGGCTGCGGCACACGTCTATTTCGGAAAAGCGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATCGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGAGCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGCGCTGGCGCGGAGGCTGGCTGCAGGGtagtt > 2:193649/1‑272 (MQ=255) cttttCCACGCGAGTCGCATTGCACAGCGGCGCACGTCAGACGAGTTCCTCTGGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGAACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTatat < 2:635503/272‑1 (MQ=255) tCTTCCTCGCGATTCGCATTGCACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAGCGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCAGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGc > 1:293666/1‑258 (MQ=255) tCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGGGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAGCGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGc < 2:293661/258‑1 (MQ=255) cTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGNAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCa > 1:635517/1‑275 (MQ=255) ggtaTTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGTTCCTTGGTCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCcaaca < 2:620736/272‑1 (MQ=255) taaaCAGCTGGTCACGAAAGACGGGTGCCGCGGGTTTTATCTGAAAAAGTTTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGGGCTGCGGCACAAGTCGATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGAt < 2:639909/272‑1 (MQ=255) acttgctCCTCGTGCTTTATCTGAACTAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGAtt < 1:193651/269‑1 (MQ=255) aaCAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTAACACGCGCCgg > 1:106726/1‑274 (MQ=255) ggTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGCTGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGCCACGCACTGAGGCGATAAACGGTACATATCCCGCCCCGGCGGCTGCTTtctcaac > 2:229812/1‑272 (MQ=255) ccGCGCCTATGGTGTCGGTGCAGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGc < 1:8109/176‑1 (MQ=255) cTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTatat > 2:543284/1‑186 (MQ=255) ggTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTAGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCAcc < 1:543295/186‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAANAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGt > 1:570832/1‑275 (MQ=255) tgctgcGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTtct < 1:33658/248‑1 (MQ=255) gcGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGAATGCTTTCTCTGCGCCGAACCTGAGCGAAATGGGGCGCCa > 1:126186/1‑275 (MQ=255) ggCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAgg < 1:229814/275‑1 (MQ=255) gaaaaagtaaaTTACGGAAAAACGATCGACCAACTTACGCTGAAAGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAgg < 2:570819/264‑1 (MQ=255) tccactCTGTTGCGGAAAAACGGGCAACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGgag < 2:106725/269‑1 (MQ=255) tttCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGtt > 2:368511/1‑171 (MQ=255) tcgccagctgctgggtaatggtacttgccccttgtgacgcgtgaccggagaacagcgccacgcttgctgcacggaagatccccaccgggtcaacgccgtgatgctcgtagaagcggctgtcttctgtcgcgGATGCTGGATGAAGGGTATAACACCCAACAAAAGTTCGATCAGACAAGCACTGGGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATAGCTTTCTCGGCGCAGTACCTGAGAGAAACGGGTCGCCAGGAGATGTATAACCGTTa > 1:356840‑M2/132‑275 (MQ=255) ggAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGAt < 1:368518/171‑1 (MQ=255) aaaCGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGa > 1:655668/1‑136 (MQ=255) ggTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGaa < 2:655654/136‑1 (MQ=255) gtacttgccccttgtgacgcgtgaccggagaacagcgccacgcttgctgcacggaagatccccaccgggtcaacgccgtgatgctcgtagaagcggctgtcttctgtcgcgGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGc > 1:298969‑M2/112‑168 (MQ=255) ttgccccttgtgacgcgtgaccggagaacagcgccacgcttgctgcacggaagatccccaccgggtcaacgccgtgatgctcgtagaagcggctgtcttctgtcgcgGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGAtt < 2:298964‑M2/61‑1 (MQ=255) aaTGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGga > 1:164289/1‑183 (MQ=255) gCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGAtt < 2:164287/183‑1 (MQ=255) gCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGt > 1:77662/1‑98 (MQ=255) ccGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTatat < 2:77661/98‑1 (MQ=255) cTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGa > 1:176301/1‑76 (MQ=255) cTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGATATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGATCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTAGTGCATTTACACCACCATTACCCGCAAAGTgcannnc > 2:208908/1‑271 (MQ=255) cACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGaa < 2:176299/76‑1 (MQ=255) tCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATc > 2:351800/1‑80 (MQ=255) cccGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCAccc < 1:351806/80‑1 (MQ=255) ctctACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCTaa > 2:219687/1‑201 (MQ=255) ctctACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCATTTACACCACCATCACCCGCAAAGTGCAGCAGGCCGCGCAGCAGGCGGt < 1:208910/275‑1 (MQ=255) aCTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTg < 1:219689/201‑1 (MQ=255) aTCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGa > 2:668827/1‑46 (MQ=255) gTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGtt > 1:446768/1‑70 (MQ=255) tGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGaa < 1:668841/46‑1 (MQ=255) cGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGAt < 2:446761/70‑1 (MQ=255) gATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCAtt > 1:346052/1‑178 (MQ=255) | GATTAAGGAAGTCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCATTTACACCACCATCACCCGCAAAGTGCAGCAGGCCGCGCAGCAGGCGGT > CP009273/3516649‑3517137 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |