New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 158043 | 45 (1.120) | 4 (0.110) | 3/294 | NT | 8.0% | coding (476/531 nt) | ligT | 2'‑5' RNA ligase |
? | CP009273 | = 158600 | 49 (1.290) | coding (9/2430 nt) | hrpB | putative ATP‑dependent helicase |
AGAAAGCGCCTTCTCTTTCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGAAGTGTGTGGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATAC > CP009273/158336‑158872 | aggcaGCGCCTTCTCTTTCTCTGCGCTCGCTTTGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGAAGTGTGTGGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTtg < 1:56068/271‑1 (MQ=255) aaGCGCCTTCTCTTTCTCGGCGCTCACTGCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGAAGTGTGTGGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATCGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGNGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTtgctg > 1:551861/1‑275 (MQ=255) tctcGGCGTGCACTTCGCTGAAAAATGCCAGATTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGAAGTGTTTGGCNCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGTATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGaa < 1:556691/275‑1 (MQ=255) gcTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGAAGTGTGTGGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAAttactta < 1:442498/275‑1 (MQ=255) cAGAGTCAGATGCGAATTATCTGCGGCTACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGAAGTGTGTGGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCACGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTTCCCGTTGCTTCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGcgccgc < 1:386397/275‑1 (MQ=255) ggtgcaaatgagaaTTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGGCTCGGGTGGGAAGTGTGTGGCGGGGCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTGTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAg < 2:92535/263‑1 (MQ=255) gaggaaGATGCAAATGAGCGGCGGCGACCGGACGGCCCGCTTCAGGTGGGAAGTGTGTGGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAg < 2:651411/270‑1 (MQ=255) agcttgATGCAAATTGTCGGAGTCTACCTGACGTCCCGCCTCTGGTGGGGAGTGTGTGGCGCGCCAATTGATAATCTGTTCNCGGATTTCNGCAGGTAAGTCGTTAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACATGAATTAGTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAg < 1:490911/269‑1 (MQ=255) aGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGAAGTGTGTGGCNCGCCAATGNATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTAGCCCGTTCCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTAcc < 1:494061/249‑1 (MQ=255) aaTTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGAAGTGTGTGGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGcgcc > 1:354054/1‑259 (MQ=255) ggTGGGAAGTGTGTGGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGACGCTACAATGTGGCTCGAAGAATGTCGACCCTCTGGANCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTgc > 1:665250/1‑224 (MQ=255) tgtgGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCACGTTTCTGCCGTCTTACCTCAATTACTTACCGCTCTCGATTGGTAGCTGCCGGTCTTCTTAAGTGAGCCGACAGGGGGCGGGGAATGCACATGGGTGCCggcgcca > 2:685912/1‑268 (MQ=255) cgcgcCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTCAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGCCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTGACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGACTGCCGGTGCAAcggctg > 1:387312/1‑275 (MQ=255) ggttagtCTGTTCNGGTGTTTCGGTAGGTAAGTCGATAGCAAAGATCGGACGTTGCGGTTCAGTCATGTTAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATTTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATcc < 2:551850/268‑1 (MQ=255) tCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTgcgc > 1:657198/1‑216 (MQ=255) ttCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGAc < 2:657184/216‑1 (MQ=255) tCGCGGATTTCTGCAGGTAAGCCGGTAGCCAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATNGTgcg > 1:502737/1‑189 (MQ=255) gctcggagtgcggCAGGGAGGTCGATAGCAAAGGGCAGACGTTGCTGGTAAGACTTTGGCGGCACTCGGTGATGACTTACTGTGAGTGTATATTGTGGGTCGCAGAACGTCTACCCTCTGGAGTGTTTTGTGTCGTCCTTGCACGTTGCTGCCGTCTTACCTGAAGTACTTACCACTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTGTTATTAAGAGCGACGACCGGTGCCGAGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACgg < 2:94656/263‑1 (MQ=255) ggATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGcgccgc < 2:502728/189‑1 (MQ=255) gTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTgcg > 1:341959/1‑173 (MQ=255) gTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGcgccgc < 2:341953/173‑1 (MQ=255) aGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGttgcccgtggacgcacacgctacacgccgctaaaacgctgggcgctaacgcaataacaaggattgtcgcaatggaattttctccccctctacagcgcgcgacgctaattcagcgttacaaacgttttttcgccgatgtgatcccacccgatggtctcgaatacacgc < 2:641264‑M2/274‑168 (MQ=255) aGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGttgcccgtggacgcacacgctacacgccgctaaaacgctgggcgctaacgcaataacaaggattgtcgcaatggaattttctccccctctacagcgcgcgacgctaattcagcgttacaaacgtttgttagccgatgtgatcaccaccgatggtcgcgaattaatgct < 2:328043‑M2/275‑169 (MQ=255) gAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGTACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACATTGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTgg < 1:173289/275‑1 (MQ=255) aGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGttgcccgtggacgcacacgctacacgccgctaaaacgctgggcgctaacgcaataacaaggattgtcgcaatggaattttctccccctctacagcgcgcgacgctaattcagcgttacaaacgttttttagccgatgtgatcacacccgatggtcgcgaattaacgctacact > 1:328049‑M2/1‑102 (MQ=255) aCGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGCGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGtt > 2:342832/1‑109 (MQ=255) aCGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTgcg > 2:337530/1‑151 (MQ=255) aCGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGgcggcg > 1:147452/1‑274 (MQ=255) tGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTtgctg < 1:342838/109‑1 (MQ=255) tGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGcgccgc < 1:337536/151‑1 (MQ=255) gCGGTTCAGACATGTGAGGCACTGGGTTGTGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGANATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGt > 1:505435/1‑272 (MQ=255) tgAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGATCGGTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGACGTc > 2:397898/1‑99 (MQ=255) tgAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCg > 1:48477/1‑97 (MQ=255) gCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCtt < 2:48476/97‑1 (MQ=255) gCACTCGGTTATGAAGTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCTAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTAc < 1:397905/99‑1 (MQ=255) cTCGGTTATGAATTACCGCGAGGCGACATGGTGGCGCGAAGAATGTCAACCCTCTGGAGCGTTTCGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGCAttact > 1:505703/1‑106 (MQ=255) tATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCt > 2:290237/1‑92 (MQ=255) tGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGttgcccgtggacgcacacgctacacgccgctaaaacgctgggcgctaacgcaataacaaggactgtcgcaatggaattttctccccctctacagcgcgcgacgctaattcagcgttacaaacgttttttagccgatgtgatcacacccgatggtcgcgaattaacgctacactgcccgaatacgggtgcgatgaccggttgtgcaacgc > 1:641278‑M2/1‑66 (MQ=255) aaTTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAAt < 1:290242/92‑1 (MQ=255) tgtgGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTgc > 1:71043/1‑95 (MQ=255) tgGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAAtta > 1:223323/1‑73 (MQ=255) tgGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTACTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTAGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGATGGCGGAGCGGCTTAACGAAAAGACAGCGAATACAGTTg > 1:713998/1‑275 (MQ=255) gcgcGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTtgctg > 2:705243/1‑54 (MQ=255) gcgcGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGcgccg < 2:71042/95‑1 (MQ=255) gcgcGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGATGCAACTGCTGgcgc > 1:654865/1‑162 (MQ=255) gcgAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAAttactta < 2:223321/73‑1 (MQ=255) gaagaaTGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGt < 1:705257/54‑1 (MQ=255) gaagaaTGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATcc < 2:654851/162‑1 (MQ=255) aCCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGcgcc > 2:604500/1‑79 (MQ=255) ctctGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGGACCGTCGCGCAACGGCAGGCGGAGCGGCGTAACGAAAAGCCAGGGGACACCCTGGGCTGCCCGGTGCGGGCCCa > 2:573971/1‑274 (MQ=255) ctctGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGAGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGACAGGCGATACCGTTAGCTACCGGAGGCGGGCGCaa > 1:713976/1‑275 (MQ=255) tctGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAg < 1:604513/79‑1 (MQ=255) ctGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTgg > 2:88075/1‑120 (MQ=255) aGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGc < 1:88076/120‑1 (MQ=255) gTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGTCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTGAAc > 2:739384/1‑224 (MQ=255) ttttGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGcgcc > 2:152314/1‑66 (MQ=255) tgtgTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCGTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCTGACAGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTTCTTAACGaaa < 1:739398/224‑1 (MQ=255) gtgtCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAg < 1:152315/66‑1 (MQ=255) cgtTGCACGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATAc < 1:126376/274‑1 (MQ=255) | AGAAAGCGCCTTCTCTTTCTCGGCGCTCACTTCGCCTAAAAATGCCAGAGTCAGATGCAAATTATCGGCGGCGACCGGACGTCCCGCCTCAGGTGGGAAGTGTGTGGCGCGCCAATGGATAATCTGTTCGCGGATTTCTGCAGGTAAGTCGATAGCAAAGAACAGACGTTGCGGTTCAGACATGTGAGGCACTCGGTTATGAATTACCGCGATGCTACAATGTGGCGCGAAGAATGTTAACCCTCTGGAGCGTTTTGTGTCGTCGTTGCCCGTTGCTGCCGTCTTACCTGAATTACTTACCGCTCTCGATTGTGCGCCGCAGGTATTATTAAGTGCGCCGACCGGGGCCGGGAAATCAACCTGGCTGCCGCTGCAACTGCTGGCGCATCCCGGCATTAACGGGAAAATTATCCTGCTGGAGCCGCGTCGTCTGGCGGCGCGTAACGTCGCGCAACGGCTGGCGGAGCTGCTTAACGAAAAGCCAGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATAC > CP009273/158336‑158872 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |