New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 197680 | 40 (1.000) | 5 (0.130) | 4/292 | NT | 9.4% | coding (223/1026 nt) | lpxD | UDP‑3‑O‑(3‑hydroxymyristoyl)‑glucosamine N‑acyltransferase |
? | CP009273 | = 197761 | 59 (1.560) | coding (304/1026 nt) | lpxD | UDP‑3‑O‑(3‑hydroxymyristoyl)‑glucosamine N‑acyltransferase |
TGGCGATATCGTCATCACCGGCGTTGCGTCCATGCAATCTGCACAAACAGGTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGAGATCCAGATCGGTCAGAATTGCCTGATCCAGTCCGGAACAGTGGTAGGCGCAGACGGCTTTGGTTATGCCAACGATCGTGGTAA > CP009273/197517‑198029 | tGGCAATACCGTCNCCCCCGGCGTTGCGTCGATGCAATCTGCACCAACGGGTCACATTACGTTACTGGTTACCCCAACATACCGTGTGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCACGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTTCAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATGCCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAg < 2:539242/274‑1 (MQ=255) gCGATAGCGTCATCACCGGCGTTGCGTCCATGCAATCTGCACAAGCAGGTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGANTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCt > 1:539252/1‑274 (MQ=255) tGCACAAACAGGTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCCGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCCCAGAACATTGCTCCCCGTCCGGCAACCTACGCCACGGCGAAGCTGGGTAACACCGTAACGACTGGCCCTAACGCgggcgtt > 2:707358/1‑269 (MQ=255) ctaaCAGGTCCATTTACGTTCTTGGTTACCCCAAACTACCGTGAGCATTTCGGCTTGTGCCAGTCGTCCGCGGTTGGCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAATAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATGTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTc < 1:326922/273‑1 (MQ=255) aCAGGTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGAGGTGATCGACGCCACCCCGAAGCTGGGGAACAACGCAACGATNTGTGCCAActcgcgtatttaattct > 2:493320/1‑261 (MQ=255) gTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCNGTTGTCATNACCCAGGACGATATTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGACGCTGGGTCACAACGTATCGATTGGCGCTAAcgcg < 1:493329/257‑1 (MQ=255) tCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACcca > 1:200579‑M2/1‑183 (MQ=255) aaaTACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGc > 2:604017/1‑199 (MQ=255) gccGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGGCCGGGGTTGTCATGACCAGGGACGAGCTTCCGTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGGAGTGAAGAATCCCTACATGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGCACATTGCACCCAGTGCGGTGGTCGACGCGACGGCGAAGCTggg < 1:607079/198‑1 (MQ=255) aCCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTggg < 1:604030/199‑1 (MQ=255) cGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGt > 2:606143/1‑227 (MQ=255) aGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGAtt < 1:606156/227‑1 (MQ=255) gtgCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTaa > 1:320597/1‑204 (MQ=255) gtgCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGACGGTTGCTTCGTAGGGaaaa > 1:366038/1‑275 (MQ=255) tgCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGc > 2:155631/1‑170 (MQ=255) cAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAAcgcg < 2:320591/204‑1 (MQ=255) aGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAg < 1:155633/170‑1 (MQ=255) ggCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGCTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGGAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATGGAg > 2:704672/1‑211 (MQ=255) ggCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAACTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACCTTGCACACAGTGCGGTGACCGACGCGACGGc > 1:708786/1‑165 (MQ=255) tCCGCGGTTGTCATGTCCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGATGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCg < 1:704686/211‑1 (MQ=255) agagacagcGATATGCCGTTCGCGAAAAGTGCCGCACCGGTAGTAAAGAATCCCTTCCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTCGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATTGGCGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTcgc < 2:133546/266‑1 (MQ=255) aGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCt > 2:297068/1‑148 (MQ=255) ggACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCCAGGTAACAACGNATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGGTGAACTGGGCGATAAAGTGATTATAGGGTCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATAGGTGCAGGGTAGCGTctct > 1:663129/1‑275 (MQ=255) cGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGt < 1:297073/148‑1 (MQ=255) tCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTggg > 2:619721/1‑144 (MQ=255) ccTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTaac < 1:619734/144‑1 (MQ=255) tCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCCTGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACCGCAAAATCGGTGCAGGGTCGCGTCACTGGGCgctggcactt > 1:133547/1‑266 (MQ=255) gcgAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCACGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAAGGTATCGATTGGTGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATAGGTACCGGTTCGCGTCTCTGGACGAAAGTAACAAt > 1:697987/1‑275 (MQ=255) gggtAGTGATGCTTCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACccagtgcggcacatttcgcgaaaggaagatcgtcctgggtcatgacaaccgcggacgcctgggacaatcctagatgctcacggtattttgggttaaccatgaacgtaatgtgacctgtttgtgcagattgcatggacgcaacgccggtgatgacgatatcgccatcaccgtgtagttctgcatccaactgc > 1:178889‑M2/2‑84 (MQ=255) gttgtgtAGAATCCCGACCGGCCTTCCGCGCGCATGGCGCACATTTTTGTGCCCACGCCGCAGGCCGCGAAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACGACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGGTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGAGCTCCAGa < 2:224465/271‑1 (MQ=255) aagaaTCCCTACCTGGCTTACGCCCGCAAGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTNCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGGTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGAGATCCAGATCGGTCa > 1:507335/1‑275 (MQ=255) aTCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCTGCGCAGACCATTGCACccagtgcggcacatttcgcgaaaggaagatcgccctgggtcatgaccaccgcggacgcctggccccagcctacatcctcaaggtcgtttgggttaaccatgaacgtaatgtgacatgtttgtgcagatggcatggacgcaacgccggtgagaacgatatagccagcacggagtagtgcggcatccaactgctaggcgaaatc < 2:178887‑M2/274‑203 (MQ=255) aTCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACccagtgcggcacttttcgcgaaaggaagatcgtcctgggtcatgacaaccgcggacgcctggcacaagcctaaacgctcaaggtattttgggttaaccatgaacgtaatgtgacctgtt < 1:646642‑M2/191‑120 (MQ=255) aTCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGc > 2:621644/1‑188 (MQ=255) 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cTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACTCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACccagggcggcacttttcgcgaaaggaagatcgtcctgggtcatgacaaccgcggacgcctggcacaagcctaaatgctcacggtattttgggttaaccatgaacgtaatgtgacctgtttgtgcagattgcatggacgcaacgccggtgatg > 1:418203‑M2/1‑68 (MQ=255) cTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACccagtgcggcacttttcgcgaaaggaagatcgtcctgggtcatgacaaccgcggacgcctggcacaagcctaaatgctcacggtattttgggttaaccatgaacgtaatgtgacctgtttgtg > 2:646628‑M2/1‑68 (MQ=255) cTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCg < 1:621658/188‑1 (MQ=255) tACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAAcg < 2:329564/127‑1 (MQ=255) 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tGACTTACGCGGGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGAGATCCAGATCGGTCAGAATTGCCTGATc < 1:429346/275‑1 (MQ=255) aCTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGt > 1:274790/1‑96 (MQ=255) aCGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTaaca < 2:274786/96‑1 (MQ=255) gcgcAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGCTTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTcc > 1:110863/1‑120 (MQ=255) gcgcAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTg < 1:236312/144‑1 (MQ=255) aaaTTTGGGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCGAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCg < 2:110862/120‑1 (MQ=255) ttAGATCTCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATCGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGAGATCCAGATCGGTCAGAATTGCCTGATCCAGTCCGGAACAGTGGTAGGCGCAGa < 1:458373/275‑1 (MQ=255) tccgttcccgccgcGGGCCGCGCAGGACAGTGCGCCCATTGCGGTGATCGCCGCGAGGTCGAAGTGGGTTAGCAACGTAGCGATTGGCGCTTAAGCGGTGATTGAGTCCGGCGGTGAACTGTGCGAGAACGGGATTAGCGGTGCCGGTTGCTTCGTTGTTAAAAACAGCAAACTCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGTCGAACGTAACCATTTACCATGAGATCCAGATCGGTCAGAATTGCCTGATCCAGTCCGGAACAGTGGTAGGCGCAGAc < 2:123579/266‑1 (MQ=255) cACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGaa > 2:328231/1‑195 (MQ=255) gccgcAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTg > 1:736223/1‑107 (MQ=255) ccgcAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGAACGTa < 1:328237/195‑1 (MQ=255) cggaGCCCGCGCAGAACTGTGCCCCCAGTGCGGGGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGAGTGGCGCTAACGCGGTGAGTGAGTGCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCGTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGGTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCAGTTACCATGAGATCCAGATCGGTCAGAATTGCCAGGTCCAGTCCGGAACAGTGGTAGGCGCAGACGGCTTTGGtt < 2:238403/270‑1 (MQ=255) cgcAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATcg > 1:161536/1‑39 (MQ=255) cAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACt < 2:736209/107‑1 (MQ=255) gCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATcgacgc < 2:161534/39‑1 (MQ=255) cccGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGAGATCCAGATCGGTCAGAATTGCCTGATCCAGTCCGGAACAGTGGTAGGCGCAGACGGCttt > 1:238406/1‑264 (MQ=255) cgcAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTACCAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGAGATCCAGATCGGTCAGCATTGCCTGATCCAGTCCGGAACAGTGGTAGGCGCAGGCGGCTTTGGTTATGCCAACGAt > 1:187934/1‑275 (MQ=255) aaCATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGc > 1:395665/1‑35 (MQ=255) aTTGCCACCAGGGCGGGGATAGAAGCGACGGCGACGCTGGGTAAAAACGTATCGATTGGCGCTTACTCTGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGAGATAAAGTGATTATCGGGGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGTTTCACGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGGGATCCGGAGCGGTCAGAAGTGCCTGATCCAGTCCGGAACAGTGGTAGGCGCAGACGGCTTTGGTTATGGCAACGATCGTGGTaa < 2:187932/275‑1 (MQ=255) ttGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAg < 2:395658/35‑1 (MQ=255) tGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGc > 2:343072/1‑121 (MQ=255) cccAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCg < 1:343078/121‑1 (MQ=255) | TGGCGATATCGTCATCACCGGCGTTGCGTCCATGCAATCTGCACAAACAGGTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGAGATCCAGATCGGTCAGAATTGCCTGATCCAGTCCGGAACAGTGGTAGGCGCAGACGGCTTTGGTTATGCCAACGATCGTGGTAA > CP009273/197517‑198029 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |