New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 843477 = | 28 (0.700) | 7 (0.180) | 5/296 | NT | 16.3% | intergenic (‑17/+387) | glnH/dps | glutamine transporter subunit/Fe‑binding and storage protein; stress‑inducible DNA‑binding protetin |
? | CP009273 | 843724 = | 45 (1.170) | intergenic (‑264/+140) | glnH/dps | glutamine transporter subunit/Fe‑binding and storage protein; stress‑inducible DNA‑binding protetin |
CCTTTTTTCTATCCACGGGACGATCCCCTGCGTGACATTCACATATATGAAAAAATCGTGCCAGTTTTGCAACTCCTTGATTTTTCGAGATGCGGCAAAAACGTGATGCACGATTTATAGGGCAATACCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCACAGG > CP009273/843468‑843894 | ccTTTTTTCTATCCACGGGACGATCCCCTGCGTAACATTCACATATATGAAAAAATCGTGCCAGTCTTGCAACTCCTTGCTTTTTCGAGATACGGCAAAAACGTCATGCACGATTTATAGGGCAATCCCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAACATTGTGGACTCAAAACAGTGACTATTTACCGTAAACCCGAATGAAAAAACAAACTTTATGTACCTATTTTGTTATGATGTTGATACAAAAAATTTACTTATTCa > 2:7925/1‑275 (MQ=255) tGACATTCACATATATGAAAAAATCGTGCTAGTTTTGCAACTCCTTGATTTTTCGAGATGCGGCAAAAACGTGATGCACGATTTATAGGGCAATACCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGACTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATaa < 1:7925/274‑1 (MQ=255) aggttttacgctaaataatcactgtgttgagtgcacaattttagcgcaccagattggtgccccagaatggtgcatcttcagggtattgccctataaatcgtgcatcacgtttttgccgcatctcgaaaaatcaaggagttgcaaaactggcacgattttttcatatatgtgaatgtcacgcaggggatcgtcccgtggataAAAAAAATTTACTTAATAAGCTGGAGATAGCAGAAGGATGCACTAAATAAGTACGTTGAGGGGGGATGcaaaac > 1:156860‑M2/202‑275 (MQ=255) aggttttacgctaaacaatcactgtgttgagtgcacaattttagcgcaccagattggtgccccagaatggtgcatcttcagggtattgccctataaatcgtgcatcacgtttttgccgcatctcgaaaaatcaaggagttgcaaaactggcacgattttttcatatatgtgaatgtcacgcagnggatcgtcccgtggataCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCGGca > 1:521851‑M2/202‑271 (MQ=255) tttacgctaaataatcactgtgttgagtgcacaattttagcgcaccagattggtgccccagaatggtgcatcttcagggtattgccctataaatcgtgcatcacgtttttgccgcatctcgaaaaatcaaggagttgcaaaactggcacgattttttcatatatgtgaatgtcacgcaggggatcgtcccgtggataCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTg < 1:356081‑M2/53‑1 (MQ=255) ngcanaataagcgctgtgttggctgaacaattttagcgccccctattggtgccccacaatgatgcatcttcagggtattgccctatcaatcgtgcatcccgtttttgccgcatctcgaaaaatcaaggagttgcaaaactggcacgattttttcatatatgtgaatgtcacgcaggggatcgtcccgtggataCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGc < 2:156858‑M2/82‑1 (MQ=255) ttttGCAACTCCTTGATTTTTCGAGATGCGGCAAAAACGTGATGCACGATTTATAGGGCAATACCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGc > 1:71421/1‑274 (MQ=255) gagtgactaattttggcgcaccagtttggtgccccagaatggtgcatcttcagggtattgccctataaatcgtgcatcacgtttttgccgcatctcgaaaaatcaaggagttgcaaaactggcacgattttttcatatatgtgaatgtcacgcaggggatcgtcccgtggataCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCtt < 2:521842‑M2/102‑1 (MQ=255) acaattttagcgcaccagattggtgccccagaatggtgcatcttcagggtattgccctataaatcgtgcatcacgtttttgccgcatctcgaaaaatcaaggagttgcaaaactggcacgattttttcatatatgtgaatgtcacgcaggggatcgtcccgtggataCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATACCAGCTGGATGCACTAAATAATTGCGTTGTGGTGGGCTGCAAAAAAAAACGACCTCCTGTCAGGAAGCTGCTTTTTtct > 2:254080‑M2/168‑274 (MQ=255) ttttagcgcaccagattggtgccccagaatggtgcatcttcagggtattgccctataaatcgtgcatcacgtttttgccgcatctcgaaaaatcaaggagttgcaaaactggcacgattttttcatatatgtgaatgtcacgcaggggatcgtcccgtggataCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCtt < 1:254083‑M2/102‑1 (MQ=255) cGATTTATAGGGCAATACCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGc > 2:651047/1‑167 (MQ=255) ttATAGGGCAATACCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGga < 1:651061/167‑1 (MQ=255) aaTACCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTgg > 2:148333/1‑197 (MQ=255) tACCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTACTCAGCTGGAGANAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTAAt > 1:679928/1‑275 (MQ=255) tACCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGcctcct > 2:628182/1‑218 (MQ=255) cccTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTg < 1:148334/197‑1 (MQ=255) cccTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAAACTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCAt < 1:379216/258‑1 (MQ=255) cTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCa < 1:628196/218‑1 (MQ=255) caaactgaacanttCTGGGGAACCAATCTGGTTCGCTAAAATTTTGCACTCAACATAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCCCTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAGACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATg < 2:71420/263‑1 (MQ=255) ttCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTa > 2:617160/1‑124 (MQ=255) ggggCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTa < 1:617173/124‑1 (MQ=255) gggCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTc > 1:134975/1‑266 (MQ=255) ccAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGCTGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGAAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCAAAgg > 1:728579/1‑274 (MQ=255) cAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGAt > 2:130116/1‑130 (MQ=255) cTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCa < 1:130117/130‑1 (MQ=255) cTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGgag > 1:341046/1‑116 (MQ=255) cTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGcaaaacaaaa > 2:508752/1‑168 (MQ=255) aaTTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAg < 2:341040/116‑1 (MQ=255) aaTTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGTGTTTCGATGGGCTGCAAAACAAAACGGc < 1:508761/168‑1 (MQ=255) tgCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAga > 1:623052/1‑115 (MQ=255) tgCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGt > 2:664724/1‑137 (MQ=255) cTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAgatgga < 2:623038/115‑1 (MQ=255) cTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAg < 1:664738/137‑1 (MQ=255) gATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATc > 1:543553/1‑196 (MQ=255) ttattTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAga > 1:442235/1‑98 (MQ=255) attTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTg > 2:692329/1‑85 (MQ=255) attTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAgatgga > 1:137675/1‑100 (MQ=255) attTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCg < 2:543542/196‑1 (MQ=255) ttAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAgatgga < 2:442228/98‑1 (MQ=255) tAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACaa > 1:218503/1‑62 (MQ=255) aGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGgaga < 1:692343/85‑1 (MQ=255) aGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCa < 2:137674/100‑1 (MQ=255) gCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACaa > 2:565332/1‑60 (MQ=255) gTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACaaaaaa < 2:218501/62‑1 (MQ=255) gTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAgatg > 2:506281/1‑91 (MQ=255) aaaaCCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACaaaaaa < 1:565344/60‑1 (MQ=255) aaCCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTGCTTAGTCCGCTGGTGATAGCAgatggatg < 1:506290/91‑1 (MQ=255) aaCCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCCGCTGGAGATAGCAgatgga < 1:589233/89‑1 (MQ=255) aaCCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAga > 1:75850/1‑85 (MQ=255) tgatgaAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAgatgga < 2:75849/85‑1 (MQ=255) aaTCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACt > 1:323532/1‑48 (MQ=255) tttATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAAt < 2:323526/48‑1 (MQ=255) tATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTg > 2:198572/1‑52 (MQ=255) tAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGgaga < 1:198574/52‑1 (MQ=255) aCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAgatg > 2:344229‑M2/2‑37 (MQ=255) | CCTTTTTTCTATCCACGGGACGATCCCCTGCGTGACATTCACATATATGAAAAAATCGTGCCAGTTTTGCAACTCCTTGATTTTTCGAGATGCGGCAAAAACGTGATGCACGATTTATAGGGCAATACCCTGAAGATGCACCATTCTGGGGCACCAATCTGGTGCGCTAAAATTGTGCACTCAACACAGTGATTATTTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCACAGG > CP009273/843468‑843894 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |