New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 20563 | NA (NA) | 971 (0.050) | 162/230 | 0.0 | 25.3% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | Exported | 899 = | 2873 (0.070) | intergenic (‑107/‑112) | aadA/fdh | aminoglycoside adenylyltransferase (Murphy, 1985)/formate dehydrogenase from Pseudomonas sp. 101 with an N‑terminal his‑tag |
Only 100 of 971 total aligned reads displayed.
TGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/20426‑20563 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCATCACCATCACCACGCT > Exported/899‑1034 TGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGGGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGGTGGCAGCATCACCGACA > 1:2704130/1‑139 CGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTA < 1:2280545/139‑1 CGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCGGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATAAGACACTAAATCAGTAAGTTGGCAACATCACCGACAATTAAAG > 1:3825657/1‑139 TTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAA < 1:1037873/139‑1 TTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAA < 1:2140186/139‑1 TTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAA < 1:337378/139‑1 TTTGCCGGTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAA < 1:3125080/139‑1 GCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGC < 1:834911/139‑1 ACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCA < 1:1592695/139‑1 ACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCA < 1:599622/139‑1 CCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAG > 1:127682/1‑115 CCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAG > 1:865457/1‑139 CGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCA > 1:645602/1‑139 CGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCA > 1:2094044/1‑139 GTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAG < 1:400353/139‑1 TCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAA < 1:1465819/109‑1 CAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGA < 1:1708212/139‑1 CAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGG < 1:4180929/138‑1 TAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAA < 1:3088072/121‑1 AGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCA < 1:1308590/139‑1 GCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCA > 1:2881632/1‑138 TGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCAC < 1:521143/137‑1 AACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATG > 1:3636774/1‑109 AGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGA < 1:163786/88‑1 GGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAA > 1:1095150/1‑139 GAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCA < 1:692247/119‑1 GAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGA < 1:1518452/86‑1 AGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCCCCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCCCCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGATCGAA < 1:4267065/137‑1 GACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATTCCCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCA < 1:1823648/138‑1 GCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGT > 1:1002742/1‑139 AGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCA < 1:3874736/128‑1 AGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACT > 1:1562523/1‑117 AGAAACAGAAGCCACTGGAGCACATCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAG > 1:1852678/1‑139 GAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGA > 1:220778/1‑139 AAGCCACTGGCGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTCAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCCCTCAGCAGGCCGCCCTGCCCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATT > 1:497110/1‑139 AAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAA > 1:881998/1‑79 AAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGC > 1:1745092/1‑75 AGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAA < 1:460951/136‑1 GCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTT > 1:2621329/1‑139 GCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATT > 1:2752631/1‑88 GCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAA > 1:2540251/1‑78 CACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATT < 1:4095354/135‑1 CACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCA < 1:1227367/116‑1 ACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATGCACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTT < 1:346217/139‑1 ACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTT < 1:2482665/139‑1 ACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATA > 1:2669807/1‑82 TGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTA > 1:3895289/1‑139 CCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAA > 1:2326576/1‑139 CCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTA > 1:3739042/1‑109 CTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGA < 1:3584656/100‑1 CCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGG < 1:303279/139‑1 CCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGG < 1:3266838/139‑1 CCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGG < 1:1383467/139‑1 CCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGG < 1:1941364/139‑1 CCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGG > 1:1190246/1‑139 CATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGA > 1:1353611/1‑139 TCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGG < 1:1873997/136‑1 TCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATA > 1:2449144/1‑102 TCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCA > 1:2021686/1‑79 TCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCA < 1:556921/65‑1 TCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATT < 1:403683/62‑1 ACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGG < 1:3200505/132‑1 ACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGG < 1:3783390/70‑1 ACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGC < 1:3965671/51‑1 CACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTG > 1:2996346/1‑139 ACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAA < 1:2406777/46‑1 TAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGA > 1:141520/1‑139 TAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGG < 1:1129351/128‑1 AAATCAGTAAGTTGGCAGCCTCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGAT < 1:3916208/139‑1 AAATCAGTAAGTTGGCAGCATCCCCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGAT < 1:2114168/139‑1 AATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATG < 1:3501379/139‑1 AATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATG < 1:3428053/139‑1 AATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAG > 1:4316943/1‑136 AATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTT > 1:1773913/1‑88 AATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATT > 1:315586/1‑80 AATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCA > 1:2576390/1‑62 ATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGC > 1:225494/1‑139 ATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGC > 1:1066738/1‑139 ATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATT > 1:2044528/1‑100 ATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAAT > 1:367773/1‑78 TCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGG < 1:738172/124‑1 TCAGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAA > 1:2175674/1‑119 AGTAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAA < 1:1541432/74‑1 TAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCA > 1:2784351/1‑138 TAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCA > 1:3717292/1‑138 TAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGA > 1:2360139/1‑129 TAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTA > 1:2969480/1‑79 TAAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCAATAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCA > 1:3319876/1‑138 AAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCA < 1:1982469/137‑1 AAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATC < 1:3541043/136‑1 AAGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATT < 1:1670003/73‑1 AGTTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCATC > 1:3243792/1‑138 TTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCAC > 1:919515/1‑73 TTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCA < 1:761775/72‑1 TTGGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACGCAGCAGGACGCACTGACCGAA < 1:4134443/68‑1 GGCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAG > 1:789256/1‑124 GCAGCATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATC < 1:4231747/130‑1 ATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCATCACCATCAC < 1:2847883/136‑1 ATCACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCA < 1:4295220/64‑1 CACCGACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATA > 1:2933953/1‑72 TGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/20426‑20563 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GACAATTAAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAACAAAATGAGGAGGTACTGAGATGCATCATCACCATCACCACGCT > Exported/899‑1034 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |