New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009273 | 4432006 = | 52 (1.030) | 6 (0.000) | 3/214 | 4.5 | 0.059% | intergenic (‑13/‑193) | msrA/tamA | methionine sulfoxide reductase A/translocation and assembly module for autotransporter export, outer membrane subunit |
? | Exported | = 1103 | 20142 (0.960) | coding (93/1224 nt) | fdh | formate dehydrogenase from Pseudomonas sp. 101 with an N‑terminal his‑tag | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1592 total aligned reads displayed.
ATTCACGGTGGTTATTGTGTGCAAATACGCCTCTTGTTACAACCTTAACCCCAATGACCGATTTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4432073‑4432006 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgattttcggCAGGTCGTCACGAGCGTAGGTTTTCGGGTAACCGTCAACCGGGTCGTCGTACAGAACGCACAGAACTTTAGCGTGGTGATGGTGATGATGCATCTCAGTACCTCCTCATTTTGTTTAAAGTTAAACAAAATTATTTCT < Exported/1103‑966 gCCGATTGTCGGCAAGTCGTCACGAGCGTAGGCTTTCGTGTAACCTTCAAACGGTCCGTCGTACAGGACGCACAGAACTTTAGCGTGGTGATGGTGATGATGCATCTCAGTACCTCCTCATTTTGTTTAAAGTTAAACA > 1:2474246/2‑139 CGATTTTCGGCAGGTCGTCACGAGCGTAGGTTTTCGGGTAACCGTCAACCGGGTCGTCGTACAGAACGCACAGAACTTTAGCGTGGTGATGGTGATGATGCATCTCAGTACCTCCTCATTTTGTTTAAAGTTAAACAAA < 1:2071498/139‑1 CGATTTTCGGCAGGTCGTCACGAGCGTAGGTTTTCGGGTAACCGTCAACCGGGTCGTCGTACAGAACGCACAGAACTTTAGCGTGGTGATGGTGATGATGCATCTCAGTACCTCCTCATTTTGTTTAAAGTTAAACAAA < 1:372737/139‑1 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |