| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | KX077536 | 7817 = | 1764 (1.070) | 8 (0.010) | 6/126 | 8.8 | 0.50% | coding (402/660 nt) | unknown | cat |
| ? | KX077536 | 7827 = | 1547 (1.000) | coding (412/660 nt) | unknown | cat | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 411 total aligned reads displayed.
AATCAAAACTGGTGAAACTCACCCAGGGATTGGCTGAGACAAAAAACATATTCTCAATAAACCCTTTAGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < KX077536/7887‑7817‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agggTTTATTGAGAATATGTTTTTTGTCTCAGCCAATCCCTGGGTGAGTTTCACCAGTTTTGATTTAAACG > KX077536/7827‑7893 AATCAAAACTGGTGAAACTCACCCAGGGATTGGCTGAGACAAAAAACATATTCTCAATAAACCCTTTA < 1:4502737/68‑1AATCAAAACTGGTGAAACTCACCCAGGGATTGGCTGAGACAAAAAACATATTCTCAATAAACCCTTTA < 1:2439408/68‑1 ATCAAAACTGGTGAAACTCACCCAGGGATTGGCTGAGACAAAAAACATATTCTCAATAAACCCTTTAG > 1:3783230/1‑68 ATCAAAACTGGTGAAACTCACCCAGGGATTGGCTGAGACAAAAAACATATTCTCAATAAACCCTTTAG > 1:2123577/1‑68 ATCAAAACTGGTGAAACTCACCCAGGGATTGGCTGAGACAAAAAACATATTCTCAATAAACCCTTTAG > 1:3606064/1‑68 ATCAAAACTGGTGAAACTCACCCAGGGATTGGCTGAGACAAAAAACATATTCTCAATAAACCCTTTAG > 1:3811712/1‑68 ATCAAAACTGGTGAAACTCACCCAGGGATTGGCTGAGACAAAAAACATATTCTCAATAAACCCTTTAG > 1:3496757/1‑68 ATCAAAACTGGTGAAACTCACCCAGGGATTGGCTGAGACAAAAAACATATTCTCAATAAACCCTTTAG > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |