| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 900 | NA (NA) | 26274 (1.420) | 132/134 | 0.0 | 98.3% | intergenic (‑108/‑111) | aadA/fdh | aminoglycoside adenylyltransferase (Murphy, 1985)/formate dehydrogenase from Pseudomonas sp. 101 with an N‑terminal his‑tag |
| ? | Exported | 906 = | 462 (0.020) | intergenic (‑114/‑105) | aadA/fdh | aminoglycoside adenylyltransferase (Murphy, 1985)/formate dehydrogenase from Pseudomonas sp. 101 with an N‑terminal his‑tag | |||||
Only 100 of 26274 total aligned reads displayed.
ATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Exported/834‑900‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGGCTAAAATGCTATAATTCCACTCAGCAGGACGCACTGACCGAATTCACTAGTTAATAGAAATA > Exported/906‑972 TGTCTCATGAGCGGTTACATATTTGTATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAA > 1:4006682/1‑68 TGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAt > 1:3499801/1‑67 TGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAA > 1:5820152/1‑68 TGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAA > 1:829748/1‑68 ctaTCATTAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAAG < 1:5715101/65‑1 TCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAAGG > 1:5431769/1‑68 CATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAAGGCTA > 1:2548016/1‑68 TGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAATAATAAACAAATCTCGAGACCTATTGAAAAGGCTAAA > 1:6152661/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |