New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1434336 | 26 (0.420) | 13 (0.210) | 13/388 | 2.8 | 30.9% | coding (71/114 nt) | ynaM | Rac prophage; protein YnaM |
? | NC_000913 | = 1632955 | 32 (0.520) | coding (66/114 nt) | ynfT | Qin prophage; protein YnfT |
GTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCAT‑CCCCTAGGATAATTCTTACTTCAGGAAGCTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTT‑AAAGTTCGT‑AGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAA > NC_000913/1434096‑1434612 | gTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCAT‑CCCCTAGGATAATTCTTACTTCAGGAAGCTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTagag < 1:937209/253‑1 (MQ=11) tCCACTACAGCAT‑CCCCTAGGATAATTCTTACTTCAGGAAGCTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATGTTTGAC‑TTAT‑ACATCGGTTTTT‑‑GTCTGGGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AATTTTTATTAGAGCATGACTA‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCa < 1:937216/266‑1 (MQ=11) aCAGCATCCCCCTAGGATAATTCTTACTTCAGG‑AGCTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TTAAAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACTAAAAAAATGCTGAATATG‑ATAAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt > 1:172016/1‑279 (MQ=11) cAGCAT‑CCCCTAGGATAATTCTTACTTCAGG‑AGCTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TTAAAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑aaaaaat > 1:172017/1‑209 (MQ=9) cTTACTTCAGGAAGCTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TT‑‑AAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGG‑TATTGGATATGCCAA‑CT‑C‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaatgtgtatatatgatatagttgacattttatctttgggtgttcttaaagttcgtagataaaca < 1:326680‑M1/309‑147 (MQ=255) ttCAGGAAGCTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACTA‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCat < 1:937219/231‑1 (MQ=18) gatgCTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCAtata < 1:937222/225‑1 (MQ=21) cTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCCTTT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATGTTTGACTTTATAACATCGG‑TTTTTGGTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACTA‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAg < 1:937220/216‑1 (MQ=11) aCCACTTTAGGGTGTC‑TTTGATTT‑ATGAAGATATTCC‑TT‑AAAAATATATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑‑TTT‑‑G‑CT‑GGG‑TATTGGATATGCCAA‑CT‑C‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaaatgtgtatatatgatatagttgacaatttttatctt < 1:326688‑M1/258‑124 (MQ=255) tgtctttttgatttCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑CT‑A‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaatgtgttatatatgatatagttgacaattttatcttgggtgttcttaaagttcgtagata < 1:326682‑M1/267‑144 (MQ=255) tgtCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑a > 1:937224/1‑148 (MQ=32) ttttGATTTCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑ttt > 1:937225/1‑241 (MQ=33) tCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACTA‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAAGTTCGT‑AGATAAACATTGTCGTTTCAgg < 1:937223/283‑1 (MQ=21) attccttaaaaaaTATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑‑AAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACa > 1:172022/10‑220 (MQ=255) ttCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑CCTA‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaatgct < 1:326701‑M1/130‑25 (MQ=255) taaaaataTTATTGATTTTTCATTTGCGATATTG‑ATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑‑TTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑CT‑A‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcag < 1:326697‑M1/153‑55 (MQ=255) aaaaTATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTTATCCTgg > 1:937230/1‑226 (MQ=25) aaTATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACTA‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGat > 1:937231/1‑201 (MQ=21) attGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTCTTGATTCAGGATATGTTTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GG‑‑TATTGGATATGCCAA‑CT‑A‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagt < 1:326696‑M1/173‑83 (MQ=255) cA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAACTA‑C‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaaatgtgttatatatgatatagtttgacaaatttttatcttgggtgttcttaaaagttcgtagataaacttgcgtttcaggtatacaggaatgctaacaggtggcagcaaaaatcaggcggttttatggcgcaagctgaagcggcaactgcaaactatcttatgta < 1:326669‑M1/331‑249 (MQ=255) tGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑CT‑C‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaatgtgttatatatgatatagttgacaatttttatcttgggtgttcttaaaagtttcgtagataaacattgtcgtttcaggtatacaggaatgctaacaggtggcagcaaaaatcaggcggtttatggcgcaagctga < 1:326673‑M1/299‑221 (MQ=255) gCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AATTTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGt < 1:937229/128‑1 (MQ=255) gCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑G‑CT‑GGGTTATTGGATATGCCAACTA‑C‑‑CTAAtattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaatgtgttatatatgatatagttgacaaatttttatctttgggtgtttctttaaaagtttcgtagataaacattgtcgtttcaggatacaggaatgctaacaggtggcagcaaaaatcaggcggttttaggcgcaagctgaagcggcaactgcaaactatcttatgtagagactcta < 1:326665‑M1/338‑260 (MQ=255) atTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGA‑‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGGTATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTg > 1:937233/1‑101 (MQ=255) tATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTg > 1:937234/1‑179 (MQ=35) tatG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑‑TTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑CT‑A‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaatgtgttatatatgatatagttgacaattttatcttgggtgttcttaagttcgtagataaacattgtcgtttcaggtatacaggaatgctaacaggtggca < 1:326677‑M1/236‑185 (MQ=255) g‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑‑AAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTatatat > 1:172024/1‑149 (MQ=37) at‑aCATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGG‑TATTGGATATGCCAACTC‑C‑‑TA‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaatgtgttatatatga < 1:326693‑M1/140‑99 (MQ=255) aCATCGGTTTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑CT‑C‑‑CT‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaaatgtgt < 1:326694‑M1/131‑91 (MQ=255) cATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑CTACT‑Atattagggcatgactaaaaatgctgaatatgataaggagagatgtgattatcagtatgctgttcatatagcctcgaattagtaatgtgtttatatatgatatagttgacaattttatctttgggtgttcttaaagttcgtagataaacattgcgtttcaggatacaggaatgctaacaggtggcagcaaaaatcaggcggtttaggcgcaagctgaagcggcaactgcaaactatcttatgtagagactctacacggattgggtttaaaagtatacatagat < 1:326663‑M1/323‑283 (MQ=255) tt‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACTA‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAAGTTCGT‑AGATAAACATTGTc > 1:172025/1‑190 (MQ=255) ggATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑‑AAAATGCTGAATATG‑AT‑AA‑GAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATAT‑ATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTT‑aa > 1:937241/1‑150 (MQ=14) ccAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTT‑AAAGTTCGT‑AGATAAACATTG‑CGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACg < 1:937244/271‑1 (MQ=38) cAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTT‑AAAGTTCGT‑AGATAAACATTG‑CGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACg < 1:937243/270‑1 (MQ=39) aa‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTT‑‑AAGTTCGT‑AGATAAACATTG‑CGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCt < 1:937237/249‑1 (MQ=255) c‑c‑‑cT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACTAAAAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGcc > 1:172027/1‑83 (MQ=14) c‑c‑‑cT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATGAAT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTT‑AAAGTTCGTAAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTaaaa > 1:937246/1‑283 (MQ=255) cT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTT‑AAAGTTCGT‑AGATAAACATTG‑CGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTa < 1:937239/275‑1 (MQ=38) t‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTatatat > 1:937247/1‑102 (MQ=40) | GTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCAT‑CCCCTAGGATAATTCTTACTTCAGGAAGCTGCGCAGGGAACCACTTTAGGGTGTCTTTTGATTTCATGAAGATATTCC‑TT‑AAAATATTATTGA‑TTTTCA‑TTGCGATATTGTATGTC‑TGATTCAGGATATG‑TTGAC‑TTAT‑ACATCGG‑TTTT‑‑GTCT‑GGGTTATTGGATATGCCAA‑TC‑C‑‑CT‑AA‑TTTTATTAGAGCATGACT‑‑AAAAATGCTGAATATG‑AT‑AAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAA‑TTTTTATCCTGGGTGTTCTT‑AAAGTTCGT‑AGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAA > NC_000913/1434096‑1434612 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |