New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1873039 | 0 (0.000) | 65 (1.430) | 45/374 | 0.1 | 100% | coding (999/1491 nt) | dgcJ | putative diguanylate cyclase DgcJ |
? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
TGTCGCCGGGAAGCCCCGGTAAAAAATAATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAAT‑GGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT‑CCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGTTCACCGAATACGTG > NC_000913/1978254‑1978805 | tGTCGCCGGGAAGCCCCGGTAAAAAATAATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAAT‑GGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg‑t < 1:596553/277‑1 (MQ=255) aaaaaaTAATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAAT‑GGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑‑GGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑‑TTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATg > 1:596560/1‑290 (MQ=255) ataatTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAAT‑GGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATACGAACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACACAAAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGt < 1:1055180/229‑1 (MQ=255) aGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAATGGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATa > 1:596565/1‑231 (MQ=255) accaccTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAAT‑GGGTCTTTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTcc > 1:596566/1‑252 (MQ=255) ttAATATGTCCTTACAAATAGAAAT‑GGGTCTTTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 1:596568/1‑192 (MQ=255) tAATATGTCCTTACAAATAGAAAT‑GGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAATTCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGt > 1:140674/1‑170 (MQ=255) tGTCCTTACAAATAGAAAT‑GGGTCTTTTACACTTATCTAAGATTTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAAT‑ATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑‑GGTAATg > 1:1044086/1‑168 (MQ=255) cTTAC‑AATAGAAAT‑GGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TGCCCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGa < 1:596567/244‑1 (MQ=255) gAAAT‑GGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCAT‑CAGCTCCAccatttgacgaa > 1:140677/1‑219 (MQ=255) t‑GGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑‑TTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TCAAATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTc < 1:140675/273‑1 (MQ=255) gggTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑‑TTGTCATGCAGCTCCACCGA‑TTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCa > 1:140678/1‑244 (MQ=255) tttACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TCAAATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑g < 1:140676/177‑1 (MQ=255) ttACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCATGATAC‑TG‑‑CCGATGAC‑tt > 1:596570/1‑192 (MQ=255) aaGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg > 1:140681/1‑149 (MQ=255) aGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑ttt > 1:596571/1‑153 (MQ=255) ttttCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGAGGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACACAAAAACAC‑TCAAATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:1104834/143‑1 (MQ=255) ttttCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACACAAAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:987410/141‑1 (MQ=255) aaa‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAAc < 1:140680/197‑1 (MQ=255) gACGCAACTGTACTCGATCACTACACGC‑ACATAC‑AAC‑GA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACACAAAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TGCCCCGATGACTTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGTCCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATaa < 1:596572/375‑1 (MQ=18) aaCTGTACTCG‑TCACTACACGCGACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TCAAATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT‑CCCTTCAGGCGGGATTCa < 1:596573/306‑1 (MQ=255) g‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTaa > 1:140683/1‑97 (MQ=255) cacGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAACTG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTc > 1:596575/1‑155 (MQ=255) cacGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GAT‑A‑TG‑CCCg > 1:596576/1‑133 (MQ=255) gcgacaTAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACACAAAAACAC‑TCAAATTACTTAACATAAAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTTATGTTCA‑GATAA‑TGCCCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGAt < 1:1108592/161‑1 (MQ=25) c‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCaa > 1:596578/1‑89 (MQ=255) gggCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GAt < 1:596577/106‑1 (MQ=255) gCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AA‑TACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTc > 1:1033329/1‑128 (MQ=255) cGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑Gaa > 1:596579/1‑143 (MQ=255) aTTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑gg > 1:596580/1‑58 (MQ=255) ttCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TCAAATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGAt < 1:140684/131‑1 (MQ=255) aataatGCGTAGATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGTCCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCg < 1:596581/208‑1 (MQ=255) t‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TGCCCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGACGAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTC‑ATTCGCGTGCGTATATCGCTTGc > 1:596583/1‑211 (MQ=17) gCAGATCACAC‑AAAACAC‑TCAAATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGcc < 1:999192/151‑1 (MQ=255) cagaaTCACAC‑AAAACAC‑TC‑AA‑TACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT‑CCCTTCAGGCGGGATTc < 1:993843/234‑1 (MQ=255) aTCACAC‑AAAACAC‑TCAAATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTc < 1:1025894/179‑1 (MQ=255) tCACAC‑AAAACACATC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGT‑ATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATg > 1:1240098/1‑67 (MQ=25) acac‑aAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGTCCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTg < 1:596582/201‑1 (MQ=255) aaaaCAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑ccc > 1:140685/1‑75 (MQ=255) c‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑‑TTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT‑CCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGgccagcca > 1:596587/1‑235 (MQ=255) aTTACTTAACATAAAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCttt < 1:596585/202‑1 (MQ=25) ttACTTAACAT‑‑AAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGACTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGAt < 1:596584/186‑1 (MQ=25) aCTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTg < 1:990868/183‑1 (MQ=38) ttAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT‑CCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGc < 1:596586/286‑1 (MQ=34) tAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT‑CCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGAcagc < 1:1091074/264‑1 (MQ=34) aaCAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGACTTTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT‑CCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCAt > 1:140686/1‑236 (MQ=21) aaCAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTg > 1:596590/1‑179 (MQ=35) cAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg < 1:1228139/88‑1 (MQ=40) aaaT‑GGGCAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT‑CCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGTTCACCGAATACGTg > 1:596591/1‑308 (MQ=14) | TGTCGCCGGGAAGCCCCGGTAAAAAATAATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAAT‑GGGTC‑TTTACACTTATCTAAGA‑TTTTTCCTAAA‑TCGACGCAACTGTACTCG‑TCACTACACGC‑ACATAC‑AACGGA‑GGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGT‑GATGCAGATCACAC‑AAAACAC‑TC‑AATTACTTAACAT‑AAAT‑GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCA‑GATAA‑TG‑CCCGATGAC‑TTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA‑GAACGACAGCGAC‑TTCCGT‑CCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC‑TGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT‑CCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGTTCACCGAATACGTG > NC_000913/1978254‑1978805 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |