New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4504265 | 33 (0.730) | 16 (0.350) | 14/374 | 2.4 | 32.6% | coding (208/1218 nt) | yjhB | putative sialic acid transporter |
? | NC_000913 | 4504269 = | 33 (0.730) | coding (212/1218 nt) | yjhB | putative sialic acid transporter |
CACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGC‑ATGGC‑TTGGATATGTATTTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑AAAG‑TTGGCCT‑AAAAATCTTCAA‑TCTAAAGCTAGTGCTTTTTTGGTAAGTGGTTTTTCTGTTGGAAATA‑TTATTG‑CGGCACAAATAATCCCTCAGTTTGCTGAAGTATATGGATGG > NC_000913/4504044‑4504561 | cacaGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGC‑ATGGC‑TTGGATATGTATTTGATGGC‑‑TTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTc > 1:920324/1‑284 (MQ=255) aaatatggcaacagcatggtataaacaagttaatccaccacaacggaaagctcttttttttccgcatggcttggatatgtatttgatggctttgatttttatgatgatattttacattcttcatatttataaaagcagatcttggcattacggattatttcaggctactttaatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggtttttgtttgcctgg > 1:1215721‑M2/219‑220 (MQ=255) agattAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGC‑ATGGC‑TTGGATATGTATTTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCA‑GGCTGAT‑AAATA‑GGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCa < 1:318626/238‑1 (MQ=255) ataaacaagttaatccaccacaacggaaagctcttttttttccgcatggcttggatatgtatttgatggctttgattttatgatgatattttacattcttcatattataaaagcagatcttggcattacggatattcaggctactttaatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggtttttGTTGCCTGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AATTTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCCTTTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑aa > 1:1001159‑M2/195‑289 (MQ=255) aaCGGAAAGCTCTTTTTTCCGC‑ATGGC‑TTGGATATGTATTTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTAC‑TTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑ttt > 1:920329/1‑223 (MQ=255) ctctTTTTTCCGCGATGGC‑TTGGATATGTATTTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAa‑tg < 1:1115239/201‑1 (MQ=255) gaagctctttttccttgcatggcttggatatgtatttgatggctttgattttatgatgatatttttacattcttcatattataaaaagcagatcttggcattacggatattcaggctactttaatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑gg > 1:318629‑M2/171‑306 (MQ=255) ccGC‑ATGGCTTTGGATATGTATTTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGcc < 1:318627/188‑1 (MQ=255) ttttttccgcatggcttggatatgtatttgatggctttgattttatgatgatattttacattcttcatattataaaagcagatcttggcattacggatattcaggctactttaatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggtttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTc > 1:318631‑M2/160‑220 (MQ=255) aTGGCTTTGGATATGTATTTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAt < 1:920330/167‑1 (MQ=255) ggC‑TTGGATATGTATTTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATgg < 1:920332/159‑1 (MQ=255) atatGTA‑TTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAgg < 1:920333/214‑1 (MQ=255) gTATTTGATGGCTTTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGCAGGTAG‑AAAG‑TTGGCCT‑‑AAAATCTTCAA‑TCT‑AAGCTAGTGCTTTTTTGGTAAGTGGTTTTTCTGTTGGa < 1:920334/381‑1 (MQ=255) aTTTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGATAAAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑a < 1:920335/206‑1 (MQ=255) ttGATGGCTTTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGGTAACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTCGCCTG‑TTTTAttg‑tt > 1:920336/1‑265 (MQ=255) ttgatggctttgattttatgatgatattttaacattcttcatattataaaagcagatcttggcattacggatattcaggctactttaatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAa‑tgatgat > 1:318632‑M2/135‑174 (MQ=255) tgatggctttgattttatgatgatattttacattcttcatattataaaagcagatcttggcattacggatattcaggctactttaatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑a > 1:318633‑M2/133‑216 (MQ=255) ttttATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑tt < 1:1253802/177‑1 (MQ=255) atgattatTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGTACGTAAGCCAa‑tgat < 1:1133776/149‑1 (MQ=255) tttACAATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTATCGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTACAAAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGc < 1:920338/264‑1 (MQ=255) ttttacattcttcatattataaaagcagatcttggcattacggatattcaggctactttaatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggtttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAatat > 1:318634‑M2/107‑258 (MQ=255) ttacattcttcatattataaaagcagatcttggcattacggatattcaggctactttaatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACA‑GCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑Ttatata > 1:920339‑M2/106‑206 (MQ=255) atatTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑‑TTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGc > 1:920341/1‑203 (MQ=255) ttatAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGGTTTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAa‑tgatg < 1:1181276/132‑1 (MQ=255) tataAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTAC‑TTAATAGGGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGTGGGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTAGGGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑AAAG‑TTGGCCT‑AAAAATCTTCAA‑TCTa > 1:920342/1‑297 (MQ=255) ataAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGGTTTTTTTTGGTGCCATGGCTGATAAAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGCAAA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTACAAAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑GTTTTTATTG‑TTGGC‑t < 1:1091172/228‑1 (MQ=255) ataAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGG‑CTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGTACGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCt < 1:920340/233‑1 (MQ=255) gCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑G‑CAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTTATG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑‑AAG‑TTGGCCT‑‑AAAATCTTCAA‑TCTAAAGCTAGTGCtt < 1:920343/288‑1 (MQ=255) ttA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑‑AATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑Tta < 1:920344/168‑1 (MQ=255) cAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑aaa < 1:1259001/78‑1 (MQ=255) aGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGTTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCt > 1:1098422/1‑220 (MQ=255) tttAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTT‑GTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCATTTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑ATTTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑GTTTTTATTGTTTGGC‑TAG‑GGTATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑AAAG‑TTGGCCT‑aa > 1:318635/1‑246 (MQ=255) ttaatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGTGGGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAGTTTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑AAAG‑TTGGCCT‑AAAAATCTTCAA‑TCTAAAGCTAGTGC‑TTTTTGGT‑AGTGG‑TTTTCTGTTGGAAATA‑TTATTG‑CGGCAC‑AATAATCCCTCAGTTTg > 1:920347‑M2/51‑324 (MQ=255) taatagggacagtggccttcatagccagacctattggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAGTTTTGCC‑GTTTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAGAAAAG‑TTGGCCT‑AAAAATCTTCAA‑TCTAAAGCTAGTGCTTTTTTGGTAAGTGGtt > 1:318636‑M2/50‑283 (MQ=255) ggACAGTGG‑CTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑‑AATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑aaa < 1:920345/222‑1 (MQ=255) aCAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTT‑GTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTAttcgttg > 1:318637/1‑167 (MQ=255) aGTGGCCTTCATATGCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGATAAAATATGGT‑CGTAAGCCAATTGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑AAAG‑TTGGCCT‑AAAAATCTTCAA‑TCTAAAGCTAGTGCTTTTTTGGTAAGTGGTTTTTCTGTTGGaaa < 1:920346/288‑1 (MQ=255) ctccattA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGaa < 1:920348/179‑1 (MQ=255) cTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACt < 1:998994/95‑1 (MQ=255) ggccttcatagccagacctattggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑AAAG‑TTGGcc > 1:318638‑M2/37‑223 (MQ=255) atagccagacctattggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGc > 1:920351‑M2/30‑145 (MQ=255) aCCTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATg < 1:920349/175‑1 (MQ=255) ccTATTGGAGGTGG‑‑TTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑t < 1:920350/153‑1 (MQ=255) ttggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑AAAGTTTGGCCT‑AAAAATCTTCAA‑TCTAAAGCTAGTGC‑TTTTTGGTAAGTGGTTTTTCTGTTGGAAATATTTATTGTCGGCAC‑AATAAT‑CCTCAGTTTGCTG‑AGTATatggatgg > 1:318639‑M2/17‑308 (MQ=255) ggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGTGGGGC‑AA‑TTTTCATTTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑AAAG‑TTGGCCT‑AAAAATCTTCAATTCTAAAGCTAGTGCtttt > 1:920352‑M2/15‑235 (MQ=255) ggaggtggttttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AATTTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCCTTTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAACTTTATATATGCTCGc > 1:1033854‑M2/15‑126 (MQ=255) ggtttttGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AATTTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAACTTTATATATGCTc > 1:970712‑M2/8‑116 (MQ=255) tGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGTAA‑TTGCTAC‑AAAC‑Ttatat < 1:1195931/104‑1 (MQ=255) ggTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑‑TTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑‑AAG‑TTGGCCT‑AAAAATCTTCAA‑TCTAAAGCTAGTGCTTTTTTGGTAAGTGGtttt < 1:318640/232‑1 (MQ=255) gTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTACAAAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGCGTTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCATTGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑‑AAG‑TTGGCCTAAAAAATCTTCAA‑TCTAAAGCt < 1:1160870/212‑1 (MQ=255) | CACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGC‑ATGGC‑TTGGATATGTATTTGATGGC‑TTTGATTTTATGATGATATTTTAC‑ATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTA‑CGGATATTCAGGCTACTTTAATA‑GGGACAGTGGCCTTCATA‑GCCAGACCTATTGGAGGTGG‑TTTTTTTGGTGCCATGGCTGAT‑AAATATGGT‑CGTAAGCCAA‑TGATGATGT‑GGGC‑AA‑TTTTCA‑TTTACTCAGTCGG‑AACAGGCC‑TTAGCGGT‑A‑TTGCTAC‑AAAC‑TTATATATGCTCGCAG‑TTTGCC‑G‑TTTTATTG‑TTGGC‑TTA‑GGGATGTCTGGTGAATATGCA‑TGTGCTTCAACTTATGC‑GGTAG‑AAAG‑TTGGCCT‑AAAAATCTTCAA‑TCTAAAGCTAGTGCTTTTTTGGTAAGTGGTTTTTCTGTTGGAAATA‑TTATTG‑CGGCACAAATAATCCCTCAGTTTGCTGAAGTATATGGATGG > NC_000913/4504044‑4504561 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |