Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 284794 | 285103 | 310 | 16 [15] | [15] 16 | yagF | CP4‑6 prophage; D‑xylonate dehydratase |
GCAGACGCACCCGGACCTGCACGCCCACGAC‑‑TTTTTGCCGGACGACACCCGGCTGT‑GGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAACCGTCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAA‑TTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCACACTACATAAGGGTGTAATTCTGATGACGC > NC_000913/285006‑285401 | gcAGACGCACCCGGACCTGCACGCCCACGAC‑‑‑TTTTGCCGGACGACACCCGGCTGT‑GGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑‑AAAAAGCG‑CTCGGAA‑TTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAACCGTCTGc > 1:374743/1‑186 (MQ=255) cGCACCCGGACCTGCACGCCCACGACT‑TTTTTGCCGGACGACACCCGGCTGTGGGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAACCGTCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTG‑TTTTG‑AATTTATTAA‑tta > 1:374744/1‑231 (MQ=255) cGGACCTGCACGCCCACGAC‑‑TTTTTGCCGGACGACACCCGGCTGTGGGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTATTTTTAAG‑A‑GATAAAAACCGTCTGCGGAATATTTT‑CCCG‑CAg > 1:374745/1‑199 (MQ=255) gCACGCCCACGACTTTTTTTGCCGGACGACACCCGGCTGT‑GGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAA‑CGTCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTG‑TTTTGAAATTTATTAATTTTAAACa > 1:374746/1‑225 (MQ=255) gCACGCCCACGAC‑‑TTTTTGCCGGACGACACCCGGCTGTGGGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAA‑TTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAACCGTCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAA‑TTTAAACa > 1:374747/1‑224 (MQ=255) cGAC‑‑TTTTTGCCGGACGACACCCGGCTGT‑GGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAat > 1:1221041/1‑137 (MQ=255) ccGGCTGTGGGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAACC‑TCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTG‑TTTTGAAATTTATTAA‑TTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGt > 1:374749/1‑212 (MQ=255) cGGCTGT‑GGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑Ct > 1:19363/1‑104 (MQ=255) gggCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑ATGAT‑AAAA‑CTACTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTGttt > 1:1082993/1‑164 (MQ=255) gggCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAA‑TTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAA‑CGTCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTGttt > 1:374750/1‑162 (MQ=255) ggcggcACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAACCGTCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAA‑TTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGAcc < 1:19362/251‑1 (MQ=255) gCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAACCGTCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTG‑TTTTGAAAt > 1:374752/1‑160 (MQ=255) ggTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAAC‑‑TCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTG‑TTTTGAAATTTATTAA‑TTTAAACAATTAGtt > 1:966173/1‑174 (MQ=255) ggcACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAA‑TTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑aaa > 1:374754/1‑97 (MQ=255) cACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCGACTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAGTA‑GAT‑AAAACCGTCTGCGGAATA‑TTTCCCCGACAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAA‑TTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGG‑AATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCACACTACATAAGGGTGTAATTCTGATGACGc < 1:374753/315‑1 (MQ=255) gTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAAcc < 1:971325/86‑1 (MQ=255) | GCAGACGCACCCGGACCTGCACGCCCACGAC‑‑TTTTTGCCGGACGACACCCGGCTGT‑GGGCGGCACTGCAGTCGGTGAGCGGCGGCACCTGGAAAGGCTGTATTTATGACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGT‑AAAAAAGCG‑CTCGGAATTTAATTA‑TTTTAAG‑A‑GAT‑AAAACCGTCTGCGGAATA‑TTT‑CCCG‑CAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAA‑TTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCACACTACATAAGGGTGTAATTCTGATGACGC > NC_000913/285006‑285401 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |