| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514276 = | NA (NA) | 209 (0.580) | 129/194 | 2.5 | 53.3% | noncoding (4/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3067172 = | 183 (0.510) | coding (2/897 nt) | ygfI | putative LysR‑type DNA‑binding transcriptional regulator YgfI | |||||
Only 100 of 601 total aligned reads displayed.
TGGCGAAGCCGTCATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTTTACAGAA > NC_000913/3067072‑3067272 | tGGCGAAGCCGTCATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCa > 2:5556741/1‑101 (MQ=255) atgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgAtcc < 2:4531572‑M2/4‑1 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgAtccccct > 1:4531576‑M2/94‑101 (MQ=255) gCCGTCATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCAtccccct > 2:31941/1‑101 (MQ=255) agaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgAtccccctccc > 2:4531582‑M2/91‑101 (MQ=255) tCATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGTCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCccc < 2:5556748‑M2/101‑4 (MQ=255) cATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCccca < 1:31972‑M2/101‑5 (MQ=255) atatGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccat < 1:32057‑M2/101‑6 (MQ=255) tatGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccata < 1:31787‑M2/101‑7 (MQ=255) gctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCAt < 1:4531587‑M2/17‑1 (MQ=255) gctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCAt < 1:1142116‑M2/17‑1 (MQ=255) ctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATc < 2:1142118‑M2/18‑1 (MQ=255) gaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCt < 2:29735‑M2/20‑1 (MQ=255) aTTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgc > 1:5556456‑M2/1‑90 (MQ=255) aTTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCt > 1:5556751/1‑101 (MQ=255) accagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCtt < 1:29737‑M2/21‑1 (MQ=255) ccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTg < 1:4531595‑M2/22‑1 (MQ=255) ttttCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaa > 2:5556453‑M2/1‑87 (MQ=255) ttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCg > 2:4531600‑M2/76‑101 (MQ=255) cTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaactta < 1:31458‑M2/101‑19 (MQ=255) cTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaactta > 1:5556611‑M2/1‑83 (MQ=255) cTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGc < 2:5556276/101‑1 (MQ=255) tGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaa > 1:5556312‑M2/1‑82 (MQ=255) tGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaa < 1:31684‑M2/101‑20 (MQ=255) tGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAAGGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCt > 1:5556757/1‑101 (MQ=255) atcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCt < 1:4531604‑M2/28‑1 (MQ=255) gccgccCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCtt < 1:5556561/101‑1 (MQ=255) ccgccCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagg > 2:5556620‑M2/1‑80 (MQ=255) gccCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggt < 2:31707‑M2/101‑24 (MQ=255) cccGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAAcc < 1:5556507/101‑1 (MQ=255) agagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCg < 1:29745‑M2/34‑1 (MQ=255) gggCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaa < 2:31570‑M2/101‑28 (MQ=255) gCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtc < 1:5556478/101‑1 (MQ=255) aattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtca > 2:4531614‑M2/63‑101 (MQ=255) aaTATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccat < 2:31813‑M2/101‑32 (MQ=255) aaTATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtcag > 2:5556767/1‑101 (MQ=255) aaTATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtcag > 1:5556766/1‑101 (MQ=255) atatTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCAtccc > 2:32170/1‑65 (MQ=255) atatTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatc < 2:31605‑M2/101‑33 (MQ=255) atatTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtcagt < 2:5556389/101‑1 (MQ=255) tattatTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatct < 2:31875‑M2/101‑34 (MQ=255) tattatTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatct < 2:31662‑M2/101‑34 (MQ=255) catcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTacagtca < 1:29752‑M2/43‑1 (MQ=255) attattGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctg > 1:5556658‑M2/1‑67 (MQ=255) ttattGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctga < 1:31597‑M2/101‑36 (MQ=255) ttattGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtcagtcag < 1:5556101/101‑1 (MQ=255) cggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGcc > 1:4531620‑M2/56‑101 (MQ=255) tGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTa > 2:5556776/1‑101 (MQ=255) gcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTa > 2:4531622‑M2/54‑101 (MQ=255) gTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatg > 1:5556381‑M2/1‑60 (MQ=255) gTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatg > 1:5556581‑M2/1‑60 (MQ=255) acgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATc < 2:29758‑M2/50‑1 (MQ=255) ttGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCt > 1:5556779/1‑101 (MQ=255) ttGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCt < 2:5556512/101‑1 (MQ=255) gttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCt > 1:5556886‑M2/50‑101 (MQ=255) tGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcga < 1:31899‑M2/101‑45 (MQ=255) atcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAAcc < 1:4532409‑M2/62‑1 (MQ=255) aaaTGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtg > 1:32545‑M2/1‑47 (MQ=255) aaaTGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACcg < 2:5556232/101‑1 (MQ=255) caggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACcgc > 2:5556877‑M2/38‑101 (MQ=255) aaTGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACcgc > 1:5556790/1‑101 (MQ=255) tGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGa > 2:5556793/1‑101 (MQ=255) gcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAg > 1:5556873‑M2/35‑101 (MQ=255) gcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAg < 1:4532246‑M2/67‑1 (MQ=255) gAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctc > 2:32536‑M2/1‑43 (MQ=255) aTTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCaa < 1:5556416/101‑1 (MQ=255) ttGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCaaa < 2:5556339/101‑1 (MQ=255) cgcATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatc > 2:5556413‑M2/1‑36 (MQ=255) gcATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATa > 1:5556802/1‑101 (MQ=255) ccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATa < 2:4532283‑M2/75‑1 (MQ=255) ccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATa < 2:4532504‑M2/75‑1 (MQ=255) cacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAg < 1:4532140‑M2/76‑1 (MQ=255) cATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAg > 2:5556804/1‑101 (MQ=255) aTCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAgg < 2:5556492/101‑1 (MQ=255) tCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgat > 1:32507‑M2/1‑32 (MQ=255) tttttCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtta < 1:31747‑M2/92‑63 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATACTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGa < 2:4532357‑M2/80‑1 (MQ=255) tccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGAt > 1:5556860‑M2/21‑101 (MQ=255) tttCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcct > 2:32497‑M2/1‑28 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAgg > 2:5556865‑M2/20‑96 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGAtt < 1:4532605‑M2/82‑1 (MQ=255) ttCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctc > 1:32493‑M2/1‑27 (MQ=255) tCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTAc < 2:5556573/101‑1 (MQ=255) taagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACg > 2:5556855‑M2/17‑101 (MQ=255) cGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGAt > 1:5556812/1‑97 (MQ=255) aagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGt < 2:4532410‑M2/86‑1 (MQ=255) aaTAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCa > 2:5556817/1‑101 (MQ=255) ttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCAt < 2:4532122‑M2/89‑1 (MQ=255) tagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATg > 2:5556849‑M2/12‑101 (MQ=255) aaaaaTGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttctt < 2:31445‑M2/101‑83 (MQ=255) aaaaaTGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATgg > 1:5556822/1‑101 (MQ=255) aaaaTGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttc > 2:32463‑M2/1‑18 (MQ=255) cgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGtt > 2:5556842‑M2/9‑101 (MQ=255) aaTGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaa < 2:1144390‑M2/101‑86 (MQ=255) aTGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaat > 1:32459‑M2/1‑15 (MQ=255) aTGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaat < 1:1144164‑M2/101‑87 (MQ=255) gTCCATTCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTttac > 2:5556830/1‑101 (MQ=255) tgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTTTACAg > 1:5556837‑M2/3‑101 (MQ=255) ccATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcg < 2:4533845‑M2/101‑91 (MQ=255) aTCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTttacagaa < 2:5556540/101‑1 (MQ=255) | TGGCGAAGCCGTCATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTTTACAGAA > NC_000913/3067072‑3067272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |