| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 883,553 | IS30 (+) +2 bp | intergenic (‑165/‑119) | ybjG ← / → mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 270541 = | NA (NA) | 148 (3.280) | 44/134 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 883554 | 0 (0.000) | intergenic (‑166/‑119) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter | |||||
| * | ? | NC_000913 | 883553 = | 0 (0.000) | 154 (3.420) | 42/134 | 0.0 | 100% | intergenic (‑165/‑120) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270607‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGCTTGAG < NC_000913/883554‑883488 CTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAA > 1:2686125/1‑68CTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAA > 1:525880/1‑68CTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGATTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAA > 1:2076563/1‑68 TCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAC < 1:112739/68‑1 ATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGC < 1:846654/68‑1 CAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTT < 1:983850/68‑1 AAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCT < 1:1386348/68‑1 CCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAG > 1:70403/1‑68 CCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAG > 1:1014455/1‑68 CTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGT < 1:1007543/68‑1 CTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGT < 1:2180451/68‑1 CTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGGTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGT < 1:2675123/68‑1 GCAACCCCATTTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:830071/68‑1 GCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:1293944/68‑1 GCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:441424/68‑1 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAA < 1:3169897/68‑1 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAA > 1:3108600/1‑68 CCCATGTTTTCACATAACTGTTCCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATCTAA > 1:2348185/1‑68 CCATGTTTTCACATGACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:506011/68‑1 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGGATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:1680865/68‑1 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:66739/68‑1 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2641475/68‑1 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:583428/68‑1 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:60215/68‑1 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:131359/68‑1 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:1283277/68‑1 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:1235546/68‑1 CATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC < 1:3454539/68‑1 CATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC < 1:2395497/68‑1 CATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC < 1:1780079/68‑1 CATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC < 1:3027057/68‑1 CATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC < 1:138139/68‑1 ATGTTTTCACATAACTGTTGCGCTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTATCCT < 1:2541622/68‑1 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTAT > 1:3425411/1‑68 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTAT > 1:3276599/1‑68 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTAT > 1:2981909/1‑68 TTTCACATTACTGTTGCGGTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGC < 1:1605886/68‑1 TTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTCACCTATGC > 1:271770/1‑68 TTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGC > 1:515722/1‑68 CACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:604144/68‑1 ACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGT < 1:688692/68‑1 CATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTT < 1:3539569/68‑1 TAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTAC < 1:258611/68‑1 AACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTGTGCCCGTTACA < 1:2159961/68‑1 AACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:1074913/68‑1 AACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA > 1:93650/1‑68 AACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:2131229/68‑1 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAAT < 1:2298912/68‑1 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAAT < 1:1198712/68‑1 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCCATGCCCGTTACAAT < 1:2853078/68‑1 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA > 1:2206610/1‑68 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA < 1:3559432/68‑1 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA > 1:322731/1‑68 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA < 1:2761539/68‑1 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA > 1:1670814/1‑68 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA < 1:762138/68‑1 TGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC < 1:3179834/68‑1 CGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCA > 1:3042101/1‑68 gtcGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:3151655/65‑1 GTTGACCAGTTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC > 1:2043652/1‑68 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCct > 1:2455440/1‑66 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:1924816/68‑1 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC > 1:2262370/1‑68 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC > 1:3486851/1‑68 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:155107/68‑1 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:1981643/68‑1 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:40467/68‑1 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC > 1:1354758/1‑68 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:945788/68‑1 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:1908522/68‑1 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC > 1:3065403/1‑68 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC > 1:1309222/1‑68 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:2495033/68‑1 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC > 1:1824655/1‑68 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC > 1:1763953/1‑68 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:174591/68‑1 TTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACC < 1:155963/68‑1 TTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACC < 1:3353000/68‑1 TTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACC < 1:1953544/68‑1 TGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCG < 1:1997776/68‑1 TGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCG < 1:577906/68‑1 ACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTA < 1:1011097/68‑1 CCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAA > 1:2722366/1‑68 CAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAA > 1:535503/1‑68 ATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACA < 1:1164316/68‑1 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGG > 1:111083/1‑68 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGG < 1:908765/68‑1 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGG < 1:1038828/68‑1 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGG > 1:104850/1‑68 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGG > 1:725061/1‑68 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGG < 1:1830229/68‑1 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGG > 1:3516592/1‑68 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTCACAATCACCCACCGTAAACAGG > 1:2940892/1‑68 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGGTTTATTTAACCGATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGG < 1:2181152/68‑1 AATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAACGTAAACAGGCC < 1:2192429/68‑1 CTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGCT > 1:757613/1‑68 CTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGCT > 1:166034/1‑68 CTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGCT > 1:1964413/1‑68 CTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGCAAACAGGCCGCT > 1:3384470/1‑68 AACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGCTTGAG > 1:1545715/1‑68 CTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270607‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGCTTGAG < NC_000913/883554‑883488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |