| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 486,025 | IS1 (+) +9 bp | coding (265‑273/648 nt) | acrR → | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 486025 = | 0 (0.000) | 78 (1.730) | 38/134 | 0.0 | 100% | coding (265/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| ? | NC_000913 | = 4519239 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 486033 | 0 (0.000) | 52 (1.150) | 22/134 | 0.3 | 100% | coding (273/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| ? | NC_000913 | 4518472 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CCATCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/486091‑486025‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAAC < NC_000913/4519239‑4519173 CCATCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAG < 1:1422135/68‑1 CATCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:2336620/68‑1 CATCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:2663369/68‑1 CATCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:1813026/68‑1 CATCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:32971/68‑1 CATCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:1296023/68‑1 CATCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGG < 1:1024445/68‑1 CAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAA < 1:1185302/68‑1 TAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:402805/68‑1 TAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:3403935/68‑1 TAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:1095809/68‑1 TAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:321868/68‑1 TAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:3167515/68‑1 TAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGA < 1:2564852/68‑1 AATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGAC < 1:3568435/68‑1 AATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGAC < 1:673750/68‑1 ATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACT > 1:1320875/1‑68 ATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACT < 1:3035855/68‑1 ATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACT < 1:2852639/68‑1 ATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACT > 1:803537/1‑68 ATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACT < 1:2551595/68‑1 CGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCC > 1:2783111/1‑68 ACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAA < 1:1317667/68‑1 ACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAA < 1:2449115/68‑1 GCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACT < 1:827727/68‑1 GCCGGTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACT < 1:3449184/68‑1 CGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTA < 1:2305108/68‑1 CGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTA < 1:2339943/68‑1 TCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATA > 1:682771/1‑68 TCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATA > 1:1989292/1‑68 TCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATA > 1:909761/1‑68 TGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGT < 1:1683504/68‑1 GTCACCGTGGATTCAAGAGCATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTG < 1:3170430/68‑1 GTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTG < 1:1327212/68‑1 TCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGT < 1:2025870/68‑1 TCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGT < 1:1791144/68‑1 CCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGCGTTTT > 1:1071608/1‑68 GGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGT < 1:1205645/68‑1 GATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTT < 1:206701/68‑1 ATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTC > 1:3333266/1‑68 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTTCTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:2445203/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:328338/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:955798/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:3460014/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:3524805/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:3544274/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:866076/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:1917285/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:1594909/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:1818952/68‑1 CAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:1004954/68‑1 AGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:1898611/1‑68 AGAACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:2448323/1‑68 ACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 1:3315609/68‑1 ACATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 1:58935/68‑1 ATGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:3071370/68‑1 TGAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 1:2335913/68‑1 GAATTAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:1438624/68‑1 TAATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 1:1138816/1‑68 AATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:3419418/68‑1 AATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:3060086/68‑1 ATATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACC > 1:901043/1‑68 TATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCT > 1:1462032/1‑68 ATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTT > 1:657283/1‑68 ATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTT > 1:870441/1‑68 ATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTT < 1:264126/68‑1 ATCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTT > 1:54045/1‑68 TCTCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTG > 1:204603/1‑68 gCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTC < 1:2786725/67‑1 TCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTC > 1:534683/1‑68 TCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTC < 1:3299004/68‑1 TCTCTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTC < 1:3415269/68‑1 CTTAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATG < 1:3432396/68‑1 TAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCA < 1:2523096/68‑1 TAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCA > 1:2178123/1‑68 TAAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGAGAATGCCCGATGACCTTGTCATGCA < 1:444911/68‑1 AGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAAC < 1:2776855/68‑1 AGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGCGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAAC < 1:2873257/68‑1 CCATCAATAATCGACGCCGTTCTTCTGTCACCGTGGATTCAAGAACATGAATTAATATCTCTCTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/486091‑486025‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAAC < NC_000913/4519239‑4519173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |