| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 486,025 | IS1 (+) +9 bp | coding (265‑273/648 nt) | acrR → | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 486025 = | 0 (0.000) | 78 (1.730) | 38/134 | 0.0 | 100% | coding (265/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| ? | NC_000913 | = 4519239 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 486033 | 0 (0.000) | 52 (1.150) | 22/134 | 0.3 | 100% | coding (273/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| ? | NC_000913 | 4518472 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/485967‑486033‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCA > NC_000913/4518472‑4518536 TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCATTATTAAGAGAGG < 1:2227512/68‑1TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:1006339/68‑1TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:569131/68‑1TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:621233/68‑1TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:2520266/68‑1TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:2017229/68‑1TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:1768818/68‑1TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGG < 1:1711069/68‑1 ATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTCTTAAGAGAGGG > 1:2400928/1‑68 GAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGC < 1:721163/68‑1 GAACTAGAGCGTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGC < 1:323647/68‑1 TAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCC > 1:1243484/1‑68 GAGTTTGAGTATCAGGAAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAA < 1:1690858/68‑1 GCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACT < 1:1742416/68‑1 GCTTAAGAATCAGGCAAAATCCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTACCAACT < 1:2131797/68‑1 CTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTT > 1:478984/1‑68 TTGAGTATCAGGCAAAATTCCCGGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTA < 1:3214660/68‑1 ggGTATCAGGCAAAATCCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACT < 1:732775/66‑1 GTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGA < 1:1046084/68‑1 GGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:1516714/68‑1 GGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:1903818/68‑1 GGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:1438320/68‑1 GGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:1188339/68‑1 GGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:1162679/68‑1 GCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCACCTTACTGATTTAGTG > 1:3147821/1‑68 GCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:1694696/1‑68 CAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:3465253/68‑1 CAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:808877/68‑1 GGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGAT > 1:1272440/1‑68 CACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAcg > 1:2998239/1‑66 ACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTNTGATGGTGATTTTAAGGT < 1:2705120/68‑1 ACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGT < 1:2911864/68‑1 ACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGT < 1:2413812/68‑1 ACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGT < 1:1251942/68‑1 ACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGT < 1:464946/68‑1 ACTCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGT < 1:429850/68‑1 TCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGC < 1:763138/68‑1 TCTCAGTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGC > 1:3215940/1‑68 GTATTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCG > 1:279142/1‑68 TTAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGG > 1:1012259/1‑68 TAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC < 1:3439364/68‑1 TAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC < 1:2611612/68‑1 TAAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGC < 1:829244/68‑1 AAGAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCT > 1:3182814/1‑68 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTC > 1:2857613/1‑68 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTC > 1:2852202/1‑68 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTC > 1:1506349/1‑68 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTC > 1:1077240/1‑68 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTC > 1:766619/1‑68 GAGAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTC > 1:1066807/1‑68 GAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCA > 1:376013/1‑68 GAGGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCA > 1:3364928/1‑68 TATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/485967‑486033‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCA > NC_000913/4518472‑4518536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |