| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 883,553 | IS30 (+) +2 bp | intergenic (‑165/‑119) | ybjG ← / → mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 270541 = | NA (NA) | 53 (1.330) | 28/128 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 883554 | 0 (0.000) | intergenic (‑166/‑119) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter | |||||
| * | ? | NC_000913 | 883553 = | 0 (0.000) | 49 (1.230) | 20/128 | 0.3 | 100% | intergenic (‑165/‑120) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
TCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270602‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGC < NC_000913/883554‑883496 TCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACG < 1:2764212/65‑1 CAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGC < 1:403284/65‑1 CAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGC < 1:1439722/65‑1 AAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTT > 1:909298/1‑65 TCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAA < 1:2850658/65‑1 CGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGT < 1:800933/65‑1 CGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGT < 1:1841982/65‑1 GCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTT > 1:625090/1‑65 GCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTT > 1:1848754/1‑65 CAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTT > 1:2764452/1‑65 AACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTT < 1:1054327/65‑1 AACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTT < 1:166775/65‑1 cagCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:1013487/62‑1 ACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:1499502/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2911924/65‑1 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC > 1:100892/1‑65 TTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTA > 1:1319311/1‑65 TTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTA > 1:2032180/1‑65 CATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCC > 1:89328/1‑65 CATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCC < 1:3249777/65‑1 ATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:1217078/65‑1 ATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:1430143/65‑1 ATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:2639279/65‑1 ACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTA > 1:1190696/1‑65 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTAC < 1:1990335/65‑1 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTAC > 1:743291/1‑65 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:388838/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:3170341/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:1963635/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:3136650/65‑1 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACca > 1:2491519/1‑63 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAA > 1:811696/1‑65 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAA > 1:1562334/1‑65 TTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAAT < 1:771507/65‑1 GCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA < 1:884921/65‑1 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:1264564/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:1279679/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:2404121/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:1262072/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:2288071/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:687788/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:1969258/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:1916024/1‑65 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:172975/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:2590839/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:344757/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:379334/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:2373990/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:150668/65‑1 ACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACC < 1:2256973/65‑1 ATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAA < 1:288857/65‑1 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAAC > 1:1005329/1‑65 TCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATATAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGC > 1:3002202/1‑65 TCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270602‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGC < NC_000913/883554‑883496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |