| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 883,553 | IS30 (+) +2 bp | intergenic (‑165/‑119) | ybjG ← / → mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 270541 = | NA (NA) | 62 (1.490) | 30/128 | 0.1 | 98.4% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 883554 | 1 (0.020) | intergenic (‑166/‑119) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter | |||||
| * | ? | NC_000913 | 883553 = | 1 (0.020) | 62 (1.490) | 25/128 | 0.1 | 98.4% | intergenic (‑165/‑120) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
| ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
ATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270604‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGC < NC_000913/883554‑883493 ATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAA < 1:855417/65‑1 AACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCT < 1:439790/65‑1 AACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCT < 1:723303/65‑1 CCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTT > 1:1049976/1‑65 CCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTT > 1:302056/1‑65 TCCGCAACCCCATGTCTGCGCATACCTGTTGCGTTGGCCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAA < 1:2607719/65‑1 GCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTT > 1:192820/1‑65 GCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTT > 1:2530166/1‑65 AACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTT < 1:406221/65‑1 cagCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTA < 1:472918/62‑1 CCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTAT < 1:747227/65‑1 CCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTAT < 1:2683182/65‑1 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATT > 1:1636132/1‑65 ATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAA < 1:2446357/65‑1 TGTTTTCGCATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:3048225/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:1379408/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2753860/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:1587248/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:129001/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2463161/65‑1 TGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:62547/65‑1 TGTTTGCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAAC < 1:2850462/65‑1 TGTTGTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTGTATTTAAC < 1:1898149/65‑1 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC > 1:1145937/1‑65 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC < 1:6528/65‑1 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACC > 1:2402893/1‑65 TTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCT > 1:2727913/1‑65 ATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCGTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCG < 1:101033/65‑1 AACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTT < 1:2279697/65‑1 ACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTA > 1:492028/1‑65 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTAC > 1:752274/1‑65 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:2272433/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:3200171/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA > 1:265956/1‑65 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACA < 1:1899708/65‑1 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATGTAACCTATGCCCGTTACA < 1:2177119/65‑1 GTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAA > 1:2636592/1‑65 TTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAAT < 1:3356847/65‑1 TTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAAT < 1:904787/65‑1 TGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATC > 1:753999/1‑65 TGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATC > 1:315838/1‑65 TGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATC > 1:1693686/1‑65 TGCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATC > 1:1899672/1‑65 GCGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCA < 1:1583559/65‑1 CGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCAC > 1:868890/1‑65 CGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCAC > 1:505328/1‑65 CGTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCAC > 1:981950/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:2751120/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:1310678/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:1497457/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:256102/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACC > 1:291332/1‑65 GTTGACCAATTGAATCTACAACGCTTTATTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTCCAATAACC > 1:2439498/1‑65 TGACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTACGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCA > 1:2772203/1‑65 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:2096124/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:2677160/65‑1 GACCAATTGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCAC < 1:1142244/65‑1 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAAC > 1:276789/1‑65 TGAATCTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAAC > 1:1547171/1‑65 CTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCC < 1:1464185/65‑1 CTACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAACCACCCACCGTAAACAGGCC > 1:1702215/1‑65 ACAACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTCCAATCACCCACCGTAAACAGGCCGC < 1:2161972/65‑1 ATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270604‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGCTTTCTTTAAGTTTTATTTAACCTATGCCCGTTACAATCACCCACCGTAAACAGGCCGC < NC_000913/883554‑883493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |