| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 486,025 | IS5 (+) +4 bp | coding (265‑268/648 nt) | acrR → | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 70 (1.710) | 26/132 | 0.1 | 98.5% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 486028 | 1 (0.030) | coding (268/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR | |||||
| * | ? | NC_000913 | 486025 = | 1 (0.030) | 51 (1.230) | 27/134 | 0.1 | 98.0% | coding (265/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| ? | NC_000913 | 574591 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
AATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGA > NC_000913/485960‑486092 | aaTCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTa > 1:2105346/1‑68 (MQ=255)aaTCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTa < 1:367574/68‑1 (MQ=255) aTCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTaa > 1:1678961/1‑68 (MQ=255) tCCAATATTGGTGACCTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAg < 1:322579‑M2/68‑2 (MQ=255) tCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAg > 1:2078960‑M2/1‑67 (MQ=255) tCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCAATCCACTCTCAGTATTAAg < 1:2963410‑M2/68‑2 (MQ=255) aggaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAagaga > 1:2059284‑M1/61‑68 (MQ=255) atatTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaag < 1:2236370‑M2/68‑6 (MQ=255) atatTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaag < 1:156340‑M2/68‑6 (MQ=255) gaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAgagaga > 1:183710‑M1/59‑68 (MQ=255) gaagaaaggaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAgagaga > 1:1499514‑M1/59‑68 (MQ=255) atTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggt < 1:1177572‑M2/68‑8 (MQ=255) atTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggt > 1:2668081‑M2/1‑61 (MQ=255) atTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggt < 1:2594483‑M2/68‑8 (MQ=255) atTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggt < 1:734057‑M2/68‑8 (MQ=255) atTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggt < 1:691142‑M2/68‑8 (MQ=255) atTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAAGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggt < 1:44202‑M2/68‑8 (MQ=255) aagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGat > 1:1821308‑M1/58‑68 (MQ=255) agaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGata < 1:263439‑M1/12‑1 (MQ=255) agaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGata < 1:1167554‑M1/12‑1 (MQ=255) agaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGata < 1:1003327‑M1/12‑1 (MQ=255) gttgaagggacggagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgccccttccTTAAGAGAGATATTa > 1:2316584‑M1/54‑68 (MQ=255) gTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcga > 1:78061‑M2/1‑57 (MQ=255) gTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATCCCCTGCCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcga > 1:2964801‑M2/1‑57 (MQ=255) aatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTa > 1:2078981‑M1/54‑68 (MQ=255) gAACTANAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaac > 1:2161135‑M2/1‑55 (MQ=255) aaCTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaaca > 1:526582‑M2/1‑54 (MQ=255) cTAGATCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaag > 1:1150531‑M2/1‑52 (MQ=255) aatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCa < 1:951644‑M1/20‑1 (MQ=255) aatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCa < 1:2721197‑M1/20‑1 (MQ=255) tAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagt > 1:3132274‑M2/1‑51 (MQ=255) agagCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtc < 1:167029‑M2/68‑19 (MQ=255) agagCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATg > 1:1145840/1‑68 (MQ=255) gactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGt > 1:575049‑M1/46‑68 (MQ=255) agCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccc > 1:182398‑M2/1‑48 (MQ=255) agCTTGAGTAGCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccc > 1:1334185‑M2/1‑48 (MQ=255) gCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccct < 1:382912‑M2/68‑22 (MQ=255) tgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCt > 1:230075‑M1/43‑68 (MQ=255) tgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCt > 1:3249065‑M1/43‑68 (MQ=255) tgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCt < 1:975675‑M1/26‑1 (MQ=255) cTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctg < 1:3202463‑M2/68‑23 (MQ=255) agtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGTGATATTAATTCATGTTCTTg > 1:1916931‑M1/41‑68 (MQ=255) gtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGa < 1:734380‑M1/29‑1 (MQ=255) tcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGaa > 1:2101323‑M1/39‑68 (MQ=255) tcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGaa > 1:2499128‑M1/39‑68 (MQ=255) tcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGaa > 1:2925597‑M1/39‑68 (MQ=255) tcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGaa < 1:2300538‑M1/30‑1 (MQ=255) tcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGaa < 1:526999‑M1/30‑1 (MQ=255) gTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGCTCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatg < 1:2224384‑M2/68‑28 (MQ=255) gTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatg < 1:3162949‑M2/68‑28 (MQ=255) cagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAAt > 1:2132116‑M1/38‑68 (MQ=255) cagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAAt < 1:2935393‑M1/31‑1 (MQ=255) tATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatga > 1:427575‑M2/1‑40 (MQ=255) tATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatga > 1:297261‑M2/1‑40 (MQ=255) tATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatga > 1:2648938‑M2/1‑40 (MQ=255) aTCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgag < 1:2492487‑M2/68‑30 (MQ=255) aTCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgag < 1:1439646‑M2/68‑30 (MQ=255) tCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgaga > 1:253136‑M2/1‑38 (MQ=255) ccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCa < 1:829017‑M1/34‑1 (MQ=255) ccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCa < 1:1278205‑M1/34‑1 (MQ=255) agaggCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgaga > 1:1934526‑M2/3‑38 (MQ=255) cgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCAc < 1:882307‑M1/35‑1 (MQ=255) cgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCAc < 1:2834386‑M1/35‑1 (MQ=255) ggCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatca > 1:3360874‑M2/1‑35 (MQ=255) agaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGtgc < 1:3316578‑M1/40‑2 (MQ=255) agaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGa < 1:2833970‑M1/40‑1 (MQ=255) agaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGa < 1:807518‑M1/40‑1 (MQ=255) agaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGa < 1:893302‑M1/40‑1 (MQ=255) agaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGa < 1:2275419‑M1/40‑1 (MQ=255) agaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGa < 1:1072335‑M1/40‑1 (MQ=255) aaaTTCCCTGGGGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtt > 1:2516470‑M2/1‑31 (MQ=255) tttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACaga > 1:185179‑M1/25‑68 (MQ=255) tttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACaga > 1:2172121‑M1/25‑68 (MQ=255) ttccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACagaa < 1:1175403‑M1/45‑1 (MQ=255) ccccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACagaaga > 1:1374446‑M1/22‑68 (MQ=255) cccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAgaagaa < 1:1986498‑M1/48‑1 (MQ=255) cccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAgaagaa < 1:3122623‑M1/48‑1 (MQ=255) cccgcttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAgaagaa < 1:2643288‑M1/48‑1 (MQ=255) ggCGATCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctg < 1:2462378‑M2/68‑47 (MQ=255) cttattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGc > 1:3233642‑M1/17‑68 (MQ=255) tattcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGt > 1:1557038‑M1/15‑68 (MQ=255) tCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagcc > 1:2777569‑M2/1‑17 (MQ=255) tCCACTCTCAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagcc > 1:1723689‑M2/1‑17 (MQ=255) tcgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAGTCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGa < 1:2802056‑M1/57‑1 (MQ=255) cACTCTCACTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccat < 1:3210399‑M2/68‑54 (MQ=255) cgcaccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGat > 1:101660‑M1/11‑68 (MQ=255) tctcAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccataga > 1:2083079‑M2/1‑12 (MQ=255) tctcAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccataga > 1:1962055‑M2/1‑12 (MQ=255) tctcAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccataga > 1:1571111‑M2/1‑12 (MQ=255) ctcAGTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaa < 1:1111245‑M2/68‑58 (MQ=255) ccttccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGattatt < 1:1346212‑M1/62‑1 (MQ=255) agccTTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGa > 1:1126648‑M1/5‑68 (MQ=255) gTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagg > 1:465313‑M2/1‑7 (MQ=255) gTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagg < 1:3164911‑M2/68‑62 (MQ=255) gTATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagg > 1:336049‑M2/1‑7 (MQ=255) tATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacaggg > 1:1633641‑M2/1‑6 (MQ=255) tATTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacaggg > 1:1488461‑M2/1‑6 (MQ=255) aTTAAggaaggtgcgatgaagtccctaatatgagatcatttttgtcatctggagccatagaacagggt > 1:1620694‑M2/1‑5 (MQ=255) aTTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccagagaacagggt > 1:1632762‑M2/1‑5 (MQ=255) ttAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggtt > 1:2126761‑M2/1‑4 (MQ=255) | AATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGA > NC_000913/485960‑486092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |