| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1943181 = | 17 (0.430) | 37 (0.950) | 16/126 | 0.5 | 68.5% | coding (520/756 nt) | znuC | Zn(2(+)) ABC transporter ATP binding subunit |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
TGTAAATGGCCAGGTGGCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCTGTGCCTGAA > NC_000913/1943117‑1943245 | tGTAAATGGCCAGGTGGCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCg > 1:72670/1‑65 (MQ=255) aaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGt > 1:1258255‑M1/64‑65 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccgtttaa < 1:3125905‑M1/6‑3 (MQ=255) aTGGCCAGGGGGCGTTATATGACCTTATCGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTa > 1:2692197/1‑65 (MQ=255) gCCAGGTGGCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATg < 1:2725473/65‑1 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTttaact < 1:1962770‑M1/9‑3 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATg < 1:1726694‑M1/9‑1 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATg < 1:2668498‑M1/9‑1 (MQ=255) ccAGGTGGCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGg < 1:768729‑M2/65‑2 (MQ=255) ccAGGTGGCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGg > 1:2387801‑M2/1‑64 (MQ=255) ccAGGTGGCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGg < 1:1641425‑M2/65‑2 (MQ=255) cAGGTGGCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGgg > 1:255657‑M2/1‑63 (MQ=255) cAGGTGGCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGgg > 1:2525165‑M2/1‑63 (MQ=255) agcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGttt < 1:2642759‑M1/13‑1 (MQ=255) agcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGttt < 1:3191995‑M1/13‑1 (MQ=255) gcacctcacaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTtc < 1:397902‑M1/14‑1 (MQ=255) tGGCGTTATATTACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTtct < 1:1337304/65‑1 (MQ=255) acctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTtctc < 1:883821‑M1/16‑1 (MQ=255) acctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTtctc < 1:2738428‑M1/16‑1 (MQ=255) gCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatga > 1:2824291‑M2/1‑57 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACg > 1:2574801‑M1/47‑65 (MQ=255) gTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgact > 1:185529‑M2/1‑55 (MQ=255) gTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACg > 1:2722754/1‑65 (MQ=255) ttATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactc < 1:2731957‑M2/65‑12 (MQ=255) ttATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTACGGTATATCAATGGTTTCTCACGa > 1:3076812/1‑65 (MQ=37) caaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGa > 1:745304‑M1/46‑65 (MQ=255) tataTGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGAt < 1:514458/65‑1 (MQ=255) tataTGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGAt < 1:2452908/65‑1 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGAt > 1:395429‑M1/45‑65 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGAt > 1:3241330‑M1/45‑65 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGAt > 1:2044514‑M1/45‑65 (MQ=255) atatGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATc < 1:3143429/65‑1 (MQ=255) tatGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaa < 1:1285553‑M2/65‑15 (MQ=255) tatGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaa > 1:251980‑M2/1‑51 (MQ=255) tatGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCt > 1:2878942/1‑65 (MQ=255) atGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaac < 1:1114387‑M2/65‑16 (MQ=255) atGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaac < 1:1225203‑M2/65‑16 (MQ=255) atGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaac < 1:2146533‑M2/65‑16 (MQ=255) atGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaac < 1:1820404‑M2/65‑16 (MQ=255) atGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaac < 1:2011416‑M2/65‑16 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTg > 1:2646184‑M1/42‑65 (MQ=255) tGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaact > 1:3052798‑M2/1‑49 (MQ=255) tGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaact > 1:90114‑M2/1‑49 (MQ=255) tGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaact > 1:134557‑M2/1‑49 (MQ=255) tGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaact > 1:249479‑M2/1‑49 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCAt < 1:2230568‑M1/27‑1 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCAt < 1:2720077‑M1/27‑1 (MQ=255) aCCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaactta < 1:217449‑M2/65‑19 (MQ=255) ccTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGGTTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttat > 1:2581445‑M2/1‑46 (MQ=255) ccTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttat < 1:1013556‑M2/65‑20 (MQ=255) ccTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATc > 1:3186327/1‑65 (MQ=255) aTTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgat > 1:897437‑M2/1‑42 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTg < 1:94743‑M1/33‑1 (MQ=255) tGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatct < 1:941786‑M2/65‑26 (MQ=255) tGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatag < 1:2491003‑M2/65‑26 (MQ=255) tGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatag < 1:2837056‑M2/65‑26 (MQ=255) tGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatag < 1:105351‑M2/65‑26 (MQ=255) gACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagt < 1:768689‑M2/65‑27 (MQ=255) aCCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccgacttattgatagtg < 1:2595278‑M2/65‑28 (MQ=255) aCCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtg > 1:1420694‑M2/1‑38 (MQ=255) ccAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgt > 1:767200‑M2/1‑37 (MQ=255) ccAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgt > 1:966195‑M2/1‑37 (MQ=255) ccAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgt < 1:1483166‑M2/65‑29 (MQ=255) ccAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgt > 1:1405229‑M2/1‑37 (MQ=255) ccAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactcaaacttattgatagtgt < 1:195208‑M2/65‑29 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTACTGGTTTCTCACGATCTGCATCCGGTGATgg < 1:384860‑M1/37‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATgg < 1:2327684‑M1/37‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATgg < 1:2408748‑M1/37‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATgg < 1:1464045‑M1/37‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATgg < 1:941970‑M1/37‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATgg < 1:1457181‑M1/37‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATgg < 1:1058250‑M1/37‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATgg < 1:1798720‑M1/37‑1 (MQ=255) ctaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGc < 1:678083‑M1/38‑1 (MQ=255) ctaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGc < 1:1228927‑M1/38‑1 (MQ=255) ctaaatcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGc < 1:1983672‑M1/38‑1 (MQ=255) tGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttat < 1:960754‑M2/65‑34 (MQ=255) tGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCaaaa < 1:1255606/65‑1 (MQ=255) tcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCaaaaa < 1:2025032‑M1/43‑1 (MQ=255) tcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCaaaaa < 1:2969858‑M1/43‑1 (MQ=255) tcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCaaaaa < 1:1562369‑M1/43‑1 (MQ=255) tcagtaagttggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCaaaaa < 1:2316808‑M1/43‑1 (MQ=255) cgtGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGa > 1:779610/1‑65 (MQ=255) tGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 1:1879947‑M2/1‑25 (MQ=255) tGAACTGGATTCTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 1:1661049‑M2/1‑25 (MQ=255) aCTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAg > 1:2937081/1‑65 (MQ=255) ggcagcatcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGt < 1:364695‑M1/53‑1 (MQ=255) gATTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc > 1:2652463‑M2/1‑18 (MQ=255) gATTGTGGCGTTTTAATGggtaacgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc > 1:1142303‑M2/1‑18 (MQ=255) aTTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccc < 1:2099823‑M2/65‑49 (MQ=255) aTTGTGGCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccc < 1:2467960‑M2/65‑49 (MQ=255) aTTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCtg > 1:1706812/1‑65 (MQ=255) ttGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCtgt < 1:3045756/65‑1 (MQ=255) catcaccGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCtgt > 1:1632626‑M1/8‑65 (MQ=255) catcaccGTGTTAATGGTTTCTCACGATCTCCAGCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCtgt > 1:668455‑M1/8‑65 (MQ=255) gtgGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCTGTGc < 1:2097725/65‑1 (MQ=255) ggCGTTTTAATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga < 1:2679773‑M2/65‑54 (MQ=255) cGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCTGTGCCTGa < 1:1049608‑M1/64‑1 (MQ=255) gTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCTGTGCCTGaa < 1:50200/65‑1 (MQ=255) gTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCTGTGCCTGaa < 1:1143290/65‑1 (MQ=255) | TGTAAATGGCCAGGTGGCGTTATATGACCTTATTGACCAACTGCGTCGTGAACTGGATTGTGGCGTTTTAATGGTTTCTCACGATCTGCATCTGGTGATGGCAAAAACCGATGAAGTGCTGTGCCTGAA > NC_000913/1943117‑1943245 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |