| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpX/Lon protease |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 15387 = | NA (NA) | 62 (1.110) | 30/120 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpX/Lon protease | |||||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 61 (1.070) | 27/122 | 0.2 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpX/Lon protease |
| ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/15454‑15387‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaTGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCT < NC_000913/458795‑458733 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:333919/1‑65AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:198392/1‑65 GTAATTCATCGGCACGTTAAATCATCTCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG > 1:212367/1‑65 GTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 1:4728475/65‑1 GTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG > 1:3258798/1‑65 GTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGCAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG > 1:4301911/1‑65 agATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:4323801/63‑1 TAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:2623822/65‑1 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CGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCC < 1:1384845/65‑1 GGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCC < 1:654870/65‑1 GCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCC > 1:2639151/1‑65 GCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCC < 1:3356643/65‑1 ACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCA > 1:4575631/1‑65 CGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCAC < 1:4143379/65‑1 TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACAT < 1:3567556/65‑1 TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACAT < 1:3411909/65‑1 TCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCCCATTCAcc > 1:2907356/1‑63 TCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAAC > 1:1137988/1‑65 TCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAAC > 1:4207894/1‑65 TCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGTTTCCCCCACATTCAAC > 1:71420/1‑65 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AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/15454‑15387‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaTGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCT < NC_000913/458795‑458733 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |