| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 56 (1.040) | 23/128 | 0.3 | 41.8% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3844020 | 78 (1.450) | coding (57/1767 nt) | adeD | adenine deaminase | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
AGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCG > NC_000913/3843956‑3844084 | agaAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGaa < 1:3810031/65‑1 (MQ=255) gaAACATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAt < 1:4129944/65‑1 (MQ=255) gaAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAt < 1:3981436/65‑1 (MQ=255) gAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAg > 1:2621813‑M2/1‑64 (MQ=255) gAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAg > 1:4131883‑M2/1‑64 (MQ=255) aaaaaTATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAgg > 1:3928189‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaaTATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTg < 1:2069416/65‑1 (MQ=255) aaaaTATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTg < 1:1035339/65‑1 (MQ=255) aaaTATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGt < 1:1673653/65‑1 (MQ=255) aaTATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGtt > 1:14690/1‑65 (MQ=255) atGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgc > 1:2374219‑M2/1‑57 (MQ=255) atGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgc > 1:2931621‑M2/1‑57 (MQ=255) atGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgc > 1:3474374‑M2/1‑57 (MQ=255) atGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGc < 1:707227/65‑1 (MQ=255) gAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCg < 1:2806839/65‑1 (MQ=255) aataatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGt < 1:752871/65‑1 (MQ=255) ataatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgcc < 1:3809686‑M2/65‑13 (MQ=255) ataatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgcc < 1:573531‑M2/65‑13 (MQ=255) ataatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGtt > 1:3618847/1‑65 (MQ=255) taatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCAGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGttt > 1:3342564/1‑65 (MQ=255) atTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaac > 1:1373181‑M2/1‑50 (MQ=255) ttCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaact > 1:1184944‑M2/1‑49 (MQ=255) ttCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaact > 1:1942650‑M2/1‑49 (MQ=255) aTTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAgctgatgctgccaacttact < 1:1755450‑M2/65‑21 (MQ=255) aTTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTgg < 1:222011/65‑1 (MQ=255) tAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaacttactga > 1:1451759‑M2/1‑43 (MQ=255) tAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCg > 1:1285909/1‑65 (MQ=255) ccATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACg < 1:2737093/65‑1 (MQ=255) ccATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACg < 1:2451674/65‑1 (MQ=255) aTAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCt < 1:2128430/65‑1 (MQ=255) 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aaaTTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGt < 1:24639/65‑1 (MQ=255) aaTTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 1:2118655‑M2/1‑35 (MQ=255) aaTTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 1:1798440‑M2/1‑35 (MQ=255) aTTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTg > 1:814566/1‑65 (MQ=255) tttCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat > 1:576598‑M2/1‑33 (MQ=255) tttCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 1:959770‑M2/65‑33 (MQ=255) tttCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGc > 1:4350291/1‑65 (MQ=255) tcaCATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGatt > 1:258757/1‑65 (MQ=255) tcaCATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGatt < 1:3020152/65‑1 (MQ=255) acaTTAGCCGGGCTGAATGCCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGattat < 1:4009803/65‑1 (MQ=255) acaTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGattat < 1:4340090/65‑1 (MQ=255) acaTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGattat < 1:1569653/65‑1 (MQ=255) aTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 1:1211460‑M2/1‑24 (MQ=255) aTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGattatat < 1:875956/65‑1 (MQ=255) aTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGattatat < 1:3900867/65‑1 (MQ=255) aGCCGGGCTGAATACCAGGATTTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGattatattat < 1:3399089/65‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATattatt < 1:1570392/65‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATattatt < 1:3341801/65‑1 (MQ=255) ccGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTg > 1:2323462/1‑65 (MQ=255) ccGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTCCCGATTATATTATTg > 1:1268891/1‑65 (MQ=255) ccGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCGGTTGCCGATTATATTATTg > 1:601906/1‑65 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |