| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 66 (1.140) | 32/128 | 0.1 | 43.4% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3844020 | 86 (1.480) | coding (57/1767 nt) | adeD | adenine deaminase | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
AGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCT > NC_000913/3843956‑3844082 | agaAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGaa < 1:701088/65‑1 (MQ=255) gaAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAt < 1:1191680/65‑1 (MQ=255) gaAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAt < 1:2075814/65‑1 (MQ=255) gAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAg > 1:3297193‑M2/1‑64 (MQ=255) gAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAg > 1:3171514‑M2/1‑64 (MQ=255) gAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAg > 1:1949588‑M2/1‑64 (MQ=255) aaaaaTATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAgg > 1:545997‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaaTATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTg < 1:2270632/65‑1 (MQ=255) atatGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTa > 1:4158706/1‑65 (MQ=255) atGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgc > 1:1009231‑M2/1‑57 (MQ=255) atGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGc < 1:964805/65‑1 (MQ=255) atGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGc < 1:3823768/65‑1 (MQ=255) atGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGc < 1:1440581/65‑1 (MQ=255) ataatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgcc < 1:2573088‑M2/65‑13 (MQ=255) aatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaa > 1:1741739‑M2/1‑51 (MQ=255) aatTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTc < 1:1841262/65‑1 (MQ=255) atTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTcc < 1:1825932/65‑1 (MQ=255) ttCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaact > 1:1560793‑M2/1‑49 (MQ=255) ttCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaact > 1:3189257‑M2/1‑49 (MQ=255) ttCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaact > 1:404735‑M2/1‑49 (MQ=255) tCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaactt < 1:244174‑M2/65‑18 (MQ=255) tCTATTAACCATAAATTTCATCACATGAGCCGGCATGAATACCAGGAAggtgctgccgtcaactt < 1:3145697‑M2/65‑18 (MQ=255) cTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaactta > 1:1522856‑M2/1‑47 (MQ=255) tATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTg < 1:4527494/65‑1 (MQ=255) aTTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaacttact > 1:1482423‑M2/1‑45 (MQ=255) ttAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGc < 1:2920911/65‑1 (MQ=255) ttAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGc < 1:2788480/65‑1 (MQ=255) ttAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGc < 1:1377157/65‑1 (MQ=255) tAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAGggtgatgctgccaacttactga > 1:35471‑M2/1‑43 (MQ=255) tAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgctgccaacttactga > 1:2919518‑M2/1‑43 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |