| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,542,578 | IS1 (+) +9 bp | 17.5% | coding (542‑550/597 nt) | fimE → | regulator for fimA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | 21 (0.180) | 21/176 | NT | 15.3% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4542578 = | 104 (0.970) | coding (542/597 nt) | fimE | regulator for fimA | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 23 (0.190) | 19/176 | NT | 16.5% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4542586 | 104 (0.970) | coding (550/597 nt) | fimE | regulator for fimA | |||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
GCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAA > NC_000913/4542480‑4542676 | gCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCgg > 1:2337173/1‑99 (MQ=255) gaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGa < 1:1315064‑M2/2‑1 (MQ=255) gaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGa < 1:1451323‑M2/2‑1 (MQ=255) aaaacactatcaataagttggagtcattaccATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGa < 1:135311‑M2/68‑1 (MQ=255) gtggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGAt < 1:962812/99‑1 (MQ=255) gtggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGAt < 2:1550878/99‑1 (MQ=255) tggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGAtt > 1:637786/1‑99 (MQ=255) ggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTa < 1:448448/99‑1 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGATTAt > 2:1578276‑M2/94‑99 (MQ=255) gtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTAt > 2:2726084/1‑99 (MQ=255) tgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATg > 1:3096070/1‑99 (MQ=255) cAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGgg > 1:1825370‑M2/1‑97 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGGATTATGGga < 2:3020405‑M2/11‑1 (MQ=255) aGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGg < 2:915779‑M2/99‑2 (MQ=255) gATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaa > 2:2133397/1‑99 (MQ=255) tcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGATTATGGgaaa < 2:2186480‑M2/12‑1 (MQ=255) aTACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaaa > 1:268529/1‑99 (MQ=255) aTACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaaa < 1:71476/99‑1 (MQ=255) tCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaaagaaa < 1:2894678/99‑1 (MQ=255) tttAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAaataa > 1:1758335/1‑99 (MQ=255) tAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAAtc < 2:2949618/99‑1 (MQ=255) ttCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCa > 2:2677953/1‑99 (MQ=255) ttCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCa > 2:1848071/1‑99 (MQ=255) ttCAGGATTATCTCGCGCATCGAAATATTCCCCAAAGTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTAGTTTTTCCTGATTATGGGAAAGAAATAATCGCa < 2:2027653/99‑1 (MQ=255) aGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATaa > 1:2783651/1‑99 (MQ=255) ggATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttac > 1:1828251‑M2/1‑80 (MQ=255) ggATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttac > 1:791914‑M2/1‑80 (MQ=255) ttATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGa > 2:2335864/1‑99 (MQ=255) tATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgat > 1:2070542‑M2/1‑76 (MQ=255) ctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGaaa < 1:938586‑M2/33‑1 (MQ=255) aTCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGaaa < 2:2664854/99‑1 (MQ=255) tctcGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGaaaa > 2:535470/1‑99 (MQ=255) tcGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAAt > 2:2012907/1‑99 (MQ=255) ggCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTaa > 2:1449372/1‑99 (MQ=255) gCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 2:2067161‑M2/99‑32 (MQ=255) gCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTaaa > 2:354139/1‑99 (MQ=255) caaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTaaaa < 2:2772749‑M2/41‑1 (MQ=255) cATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTaaaa < 2:1658644/99‑1 (MQ=255) aTCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTaaaaa < 2:2852329/99‑1 (MQ=255) tCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaag > 1:354329/1‑99 (MQ=255) gAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca > 2:1851914‑M2/1‑61 (MQ=255) gAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagag > 2:1761071/1‑99 (MQ=255) gAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagag < 1:2313026/99‑1 (MQ=255) aaTATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagagaa < 2:2713946/99‑1 (MQ=255) aaTATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagagaa > 2:2482490/1‑99 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagagaag > 1:3151591‑M2/51‑99 (MQ=255) atatTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagagaag > 1:2703341/1‑99 (MQ=255) atatTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagagaag > 1:1537457/1‑99 (MQ=255) atatTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagagaag > 2:2553628/1‑99 (MQ=255) acctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagagaaga < 2:1300424‑M2/50‑1 (MQ=255) ttCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 2:1125373‑M2/99‑43 (MQ=255) ttCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAgg < 1:596668/99‑1 (MQ=255) ttCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAgg > 1:2110196/1‑99 (MQ=255) tCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 1:1060816‑M2/1‑56 (MQ=255) gcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGtt > 1:1898133‑M2/47‑99 (MQ=255) cGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGtt < 2:1377663/99‑1 (MQ=255) cGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGtt < 2:3049114/99‑1 (MQ=255) cGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGtt < 1:554973/99‑1 (MQ=255) cGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGtt < 1:1475539/99‑1 (MQ=255) gCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg < 1:3082202‑M2/99‑46 (MQ=255) cattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGttt < 1:1393071‑M2/54‑1 (MQ=255) ccATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCAGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga < 2:550244‑M2/99‑47 (MQ=255) cATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 2:649897‑M2/99‑48 (MQ=255) cATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGa < 1:1179791/99‑1 (MQ=255) aTACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGAt < 1:2965556/99‑1 (MQ=255) aTACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGAt < 1:2428496/99‑1 (MQ=255) aTACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGAt > 2:1821953/1‑99 (MQ=255) aTACTGTGCGTTATACCGCCAGCAAGCCTGATCGTTTTGCCGGAGTATGGGAAAGAAATAATCGCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGAt < 2:1255896/99‑1 (MQ=255) tACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGAtt > 1:2833768/1‑99 (MQ=255) cTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTa < 1:1917537/99‑1 (MQ=255) tgCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACt < 1:1104604/99‑1 (MQ=255) tgCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACt < 1:1779695/99‑1 (MQ=255) gCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACtt < 1:823599/99‑1 (MQ=255) ttATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTAtt < 1:1713381/99‑1 (MQ=255) ttATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTAtt > 1:856334/1‑99 (MQ=255) tataCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTg < 2:693440/99‑1 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGa < 2:2246835‑M2/69‑1 (MQ=255) taCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg < 1:2615456‑M2/99‑64 (MQ=255) taCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 1:1976521‑M2/1‑38 (MQ=255) cGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGataat > 2:1930472/1‑99 (MQ=255) ccAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGAtaataa > 2:844541/1‑99 (MQ=255) ccAGTAATGCTGCTCG‑TTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATaaa < 1:164677/99‑1 (MQ=255) gTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGt > 1:91074/1‑99 (MQ=255) tAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGtt < 2:1865956/99‑1 (MQ=255) tAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGtt < 2:1014372/99‑1 (MQ=255) gctgctCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca > 2:1203904‑M2/1‑25 (MQ=255) gctgctCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTaaaa < 2:1778725/99‑1 (MQ=255) ctgctCGTTTTGCCGGATTATGGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcag < 1:30282‑M2/99‑76 (MQ=255) ctgctCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTaaaaa < 1:253836/99‑1 (MQ=255) gTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACaaa < 2:1336071/99‑1 (MQ=255) gTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACaaa < 1:137955/99‑1 (MQ=255) ttttGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACaaat > 2:2608533/1‑99 (MQ=255) tGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACaaataaa < 2:1483695/99‑1 (MQ=255) ccGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAaataaata > 2:606913‑M2/3‑99 (MQ=255) accGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAaataaata < 1:2202086‑M2/96‑1 (MQ=255) ccGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATAc > 1:199462‑M2/3‑99 (MQ=255) cGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATAc > 2:290538‑M2/2‑99 (MQ=255) ggATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACa < 1:1242641/99‑1 (MQ=255) ggATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACa > 1:2890248/1‑99 (MQ=255) gATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACaa < 1:897294/99‑1 (MQ=255) | GCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAA > NC_000913/4542480‑4542676 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |