Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 3,899,395 | IS1 (–) +9 bp | 100% | intergenic (‑2/+5) | yieK ← / ← yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 99 (1.070) | 65/174 | NT | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 3899395 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+13) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL | |||||
* | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 111 (1.190) | 76/176 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 3899403 | 0 (0.000) | intergenic (‑10/+5) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
CCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAAT > NC_000913/3899297‑3899493 | cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct < 2:2433520‑M2/1‑1 (MQ=255) agtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacctt < 2:832449‑M2/2‑1 (MQ=255) tagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTaa < 1:604175‑M2/4‑1 (MQ=255) ttAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATg < 1:1978754/99‑1 (MQ=255) ttAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATg > 2:2327836/1‑99 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCt < 2:706482‑M2/9‑1 (MQ=255) 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gctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAaat < 2:451238‑M2/23‑1 (MQ=255) cGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaa > 2:2036657‑M2/1‑85 (MQ=255) gACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaac < 2:1228522‑M2/99‑16 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAaata < 1:453479‑M2/24‑1 (MQ=255) aCATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaact > 2:2141813‑M2/1‑83 (MQ=255) aCATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaact > 1:1235377‑M2/1‑83 (MQ=255) aCATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaact > 1:2190271‑M2/1‑83 (MQ=255) 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tataACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttat < 1:1927863‑M2/99‑20 (MQ=255) gaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCt > 1:698750‑M2/70‑99 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTg > 2:1862612‑M2/69‑99 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTa < 2:777825‑M2/33‑1 (MQ=255) agaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACa < 2:1806341‑M2/35‑1 (MQ=255) aaGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagt < 2:1485230‑M2/99‑27 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACaaa < 1:1742064‑M2/37‑1 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAgg < 2:145031‑M2/39‑1 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAgg < 2:1263999‑M2/39‑1 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAgg > 1:895587‑M2/61‑99 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAgg < 1:437687‑M2/39‑1 (MQ=255) tGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttat < 2:2159266‑M2/99‑34 (MQ=255) tggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCa < 1:520737‑M2/44‑1 (MQ=255) gtgtGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgt > 2:1958989‑M2/1‑64 (MQ=255) tgtgCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt 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< 1:1068791‑M2/90‑1 (MQ=255) agcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATAtt < 1:2252954‑M2/90‑1 (MQ=255) aaTTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga > 2:1627304‑M2/1‑18 (MQ=255) gcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTc > 1:1538449‑M2/9‑99 (MQ=255) aTTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag < 2:366366‑M2/99‑83 (MQ=255) aTTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag > 2:478849‑M2/1‑17 (MQ=255) aTTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag < 2:1387082‑M2/99‑83 (MQ=255) catcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTcc < 2:1672906‑M2/92‑1 (MQ=255) 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CCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAAT > NC_000913/3899297‑3899493 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |