| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,899,395 | IS1 (–) +9 bp | 100% | intergenic (‑2/+5) | yieK ← / ← yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 99 (1.070) | 65/174 | NT | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3899395 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+13) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 111 (1.190) | 76/176 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3899403 | 0 (0.000) | intergenic (‑10/+5) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL | |||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
ACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAATCAAAGTTA > NC_000913/3899305‑3899501 | cacGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTg < 1:1197341‑M2/99‑2 (MQ=255) acgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTgg > 2:738613‑M2/1‑97 (MQ=255) acgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTgg > 2:71526‑M2/1‑97 (MQ=255) cgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggt > 1:229708‑M2/1‑96 (MQ=255) cgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggt < 2:1546486‑M2/99‑4 (MQ=255) cgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggt < 2:1294850‑M2/99‑4 (MQ=255) 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aacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGt > 1:1668157‑M2/68‑99 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTAc > 1:2367392‑M2/66‑99 (MQ=255) agaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACa < 2:1806341‑M2/35‑1 (MQ=255) aaGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagt > 1:2033026‑M2/1‑73 (MQ=255) gaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACaa > 2:246520‑M2/64‑99 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAg > 2:46848‑M2/62‑99 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAgg < 1:437687‑M2/39‑1 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAgg > 1:895587‑M2/61‑99 (MQ=255) gATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 2:479085‑M2/99‑32 (MQ=255) gATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 1:1139752‑M2/1‑68 (MQ=255) tGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttat < 2:2061047‑M2/99‑34 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTg > 2:850149‑M2/58‑99 (MQ=255) tggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCa < 2:1658246‑M2/44‑1 (MQ=255) gtgtGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgt > 2:1958989‑M2/1‑64 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |