Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 252,159 | IS1 (+) +9 bp | 100% | coding (155‑163/294 nt) | yafN → | antitoxin YafN |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 19796 = | NA (NA) | 109 (1.000) | 66/176 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 252159 = | 0 (0.000) | coding (155/294 nt) | yafN | antitoxin YafN | |||||
* | ? | NC_000913 | = 252167 | 0 (0.000) | 92 (0.850) | 63/176 | NT | 100% | coding (163/294 nt) | yafN | antitoxin YafN |
? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/252070‑252167 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < NC_000913/258675‑258578 CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGG > 1:2802796/1‑99 CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGG > 2:272104/1‑99 ATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGA < 1:958088/99‑1 ATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGA < 1:2655299/99‑1 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TTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 2:301021/1‑99 GTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:703297/1‑99 TTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 2:2065467/1‑99 TTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:976656/99‑1 TCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:746402/99‑1 CTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 2:2035139/99‑1 TTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:2841765/99‑1 TTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:1821445/99‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |