Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 252,159 | IS1 (+) +9 bp | 100% | coding (155‑163/294 nt) | yafN → | antitoxin YafN |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 19796 = | NA (NA) | 109 (1.000) | 66/176 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 252159 = | 0 (0.000) | coding (155/294 nt) | yafN | antitoxin YafN | |||||
* | ? | NC_000913 | = 252167 | 0 (0.000) | 92 (0.850) | 63/176 | NT | 100% | coding (163/294 nt) | yafN | antitoxin YafN |
? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > NC_000913/19700‑19893 | cccGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGt > 2:1179673/1‑99 (MQ=255) cGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTaa > 2:939646/1‑99 (MQ=255) gCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAAt < 1:918758/99‑1 (MQ=255) cTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATg < 2:2203777/99‑1 (MQ=255) ttGAGACATTGTTTCCATATGTACGGGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGa < 1:2174972/99‑1 (MQ=255) ttGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGCAGTAATTGCTGGTAATGa > 2:2310089/1‑99 (MQ=255) tGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGAc > 2:176252/1‑99 (MQ=255) gagaCATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGTGGAATCTGATTTCTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACt < 1:2938336/99‑1 (MQ=255) gaCATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTcc > 1:2862514/1‑99 (MQ=255) gaCATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTcc > 2:2910149/1‑99 (MQ=255) gaCATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTcc > 2:3005484/1‑99 (MQ=255) aCATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCa < 2:876513/99‑1 (MQ=255) cATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCaa < 2:2629645/99‑1 (MQ=255) cATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCaa < 1:1420772/99‑1 (MQ=255) ttGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACt > 2:2886228/1‑99 (MQ=255) ttGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACt > 1:386958/1‑99 (MQ=255) ttGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACt > 1:2570338/1‑99 (MQ=255) ttGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACt > 1:2497064/1‑99 (MQ=255) ttGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACt > 1:857836/1‑99 (MQ=255) gTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTa < 1:488640/99‑1 (MQ=255) tttCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTAt < 1:508502/99‑1 (MQ=255) tttCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCAGGTAATGACTCCAACTTAt < 1:2803019/99‑1 (MQ=255) tCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTg > 2:1481788/1‑99 (MQ=255) ccATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 1:353214/99‑1 (MQ=255) atatGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 2:519560/1‑99 (MQ=255) atatGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 1:2444859/1‑99 (MQ=255) atatGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 2:2584532/1‑99 (MQ=255) tatGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg > 1:2445335/1‑99 (MQ=255) tatGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg < 2:1079057/99‑1 (MQ=255) gTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtgt < 2:1875305/99‑1 (MQ=255) tACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt < 1:1077418/99‑1 (MQ=255) tACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt < 1:1241627/99‑1 (MQ=255) ggCGAATAAATAGAGGAATCTCATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt < 2:2327974/99‑1 (MQ=255) gCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 2:2289543/1‑99 (MQ=255) gCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 2:201942/99‑1 (MQ=255) gCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 1:2130601/99‑1 (MQ=255) cGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:2179974/1‑99 (MQ=255) gAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:1467160/99‑1 (MQ=255) gAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 2:213531/99‑1 (MQ=255) aataaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 2:2618113/99‑1 (MQ=255) ataaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa < 1:2817873/99‑1 (MQ=255) aaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa < 1:1447727/99‑1 (MQ=255) aataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa > 1:414390/1‑99 (MQ=255) aataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa < 2:1565033/99‑1 (MQ=255) ataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt > 1:2704908/1‑99 (MQ=255) gagGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGcc > 2:2179977/1‑99 (MQ=255) gagGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGcc > 2:2045080/1‑99 (MQ=255) agGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc > 1:770688/1‑99 (MQ=255) agGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAAGccc > 2:1012980/1‑99 (MQ=255) ggAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg > 1:1113803/1‑99 (MQ=255) aaTCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt < 1:2222092/99‑1 (MQ=255) aaTCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt > 1:331516/1‑99 (MQ=255) aTCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATg > 2:1157817/1‑99 (MQ=255) cTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc < 2:851015/99‑1 (MQ=255) tGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 2:2971653/1‑99 (MQ=255) gATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt < 1:1798061/99‑1 (MQ=255) gATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 2:1755815/1‑99 (MQ=255) gATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt < 2:2466388/99‑1 (MQ=255) aTTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt < 1:1080922/99‑1 (MQ=255) ttACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 1:2279666/99‑1 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agagTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGaa > 2:2224885/1‑99 (MQ=255) agtagtAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACg > 2:1190132/1‑99 (MQ=255) gtagtaATTGCTGGTAATGACTTCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGa > 1:1071374/1‑99 (MQ=255) tagtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc > 2:1069743/1‑99 (MQ=255) gtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAg < 1:1542770/99‑1 (MQ=40) gtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAg < 1:2122741/99‑1 (MQ=40) taATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc > 2:1526716/1‑99 (MQ=39) taATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc > 2:2911654/1‑99 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(MQ=32) tGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTcc < 1:1351225/99‑1 (MQ=31) | CCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > NC_000913/19700‑19893 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |