New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 71275 | 90 (1.240) | 1561 (22.540) +GCTC |
156/168 | NT | 93.5% | intergenic (+10/‑76) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
? | NC_000913 | 366286 = | 138 (1.900) | coding (20/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase |
Only 100 of 1979 total aligned reads displayed.
ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |||| ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAG > 2:132531/1‑99 ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAG > 2:687097/1‑99 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC < 2:511630/99‑1 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC < 1:1319128/99‑1 TTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCT < 2:585028/99‑1 AAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGA > 2:1061869/1‑99 AAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAA > 1:258534/1‑99 AAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAAT < 1:15377/99‑1 AAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAAT < 2:1291160/99‑1 AATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATt > 1:701618/1‑98 AATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATt > 2:1551434/1‑98 ATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATtc > 2:1641389/1‑97 TGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATtcg > 2:1781846/1‑96 TGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCG < 2:1821770/99‑1 GCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGT < 2:1901578/99‑1 CACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTA < 2:263618/99‑1 ACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAA > 1:1201550/1‑99 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA > 2:1027645/1‑99 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 1:143229/99‑1 GGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATG < 1:53185/99‑1 CAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtca < 2:1422902/99‑4 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA > 2:1345789/1‑99 CCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAG < 1:940273/99‑1 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC < 1:650652/99‑1 GAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTG < 2:41843/99‑1 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT < 1:1023088/99‑1 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGAAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT > 1:289589/1‑99 GAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTC < 2:212140/99‑1 GAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTC > 1:897891/1‑99 GAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTC < 1:1161337/99‑1 AGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCC < 2:1150080/99‑1 gttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCT < 2:960297/95‑1 ttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTG > 1:435812/4‑99 CGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGT < 1:17303/99‑1 TGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGA > 2:351063/1‑99 GCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAA > 1:1810413/1‑99 CGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAT < 1:1760347/99‑1 GGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATT > 1:1090658/1‑99 GGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATT < 2:1458691/99‑1 GGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATT > 1:221032/1‑99 GTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTG > 1:606685/1‑99 GTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTA > 1:394077/1‑99 GTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTA < 2:1111356/99‑1 GTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTA < 1:1962100/99‑1 GTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAG > 2:138802/1‑76 TGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAT > 2:454053/1‑99 TGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAT < 2:1710988/99‑1 GAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATC < 1:810199/99‑1 GAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATC < 2:379229/99‑1 GAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATC < 1:1468834/99‑1 AGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCG < 1:865711/99‑1 AAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCA < 2:924011/99‑1 GTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAA < 2:286997/99‑1 GTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAA < 1:328462/99‑1 TGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAT > 1:1240425/1‑99 TGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAT > 1:1694632/1‑99 AATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTC > 1:678868/1‑99 AATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTC > 1:1564259/1‑99 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA > 2:1862689/1‑99 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA > 1:1659031/1‑99 TGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACAC > 2:850949/1‑99 TAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAA < 2:1193720/99‑1 GCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACA > 1:1787181/1‑99 GCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACA < 1:1281129/99‑1 GCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACA < 2:889436/99‑1 GCCGTCAAGTTGTCATAAATAGTACCGAGCTCCAATTCGTAAACAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATGCCACACAACA < 2:1942798/99‑1 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG > 2:634068/1‑99 CAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGA < 1:1507177/99‑1 AAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAG > 1:1127618/1‑99 AAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAG > 2:167425/1‑99 AAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAG < 1:830498/99‑1 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC < 2:1000404/99‑1 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC > 2:757642/1‑99 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC > 2:7754/1‑99 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC > 2:491449/1‑99 GTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCC < 1:569884/99‑1 TTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCG < 1:1837396/99‑1 TGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGG < 2:816927/99‑1 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA > 1:965854/1‑99 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA > 2:1593512/1‑99 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA > 2:1223859/1‑99 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA > 1:777275/1‑99 CATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAG < 1:106165/99‑1 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA < 1:486797/99‑1 AATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCAT < 1:1002522/99‑1 ATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATA > 2:234395/1‑99 TGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAA < 1:1613475/99‑1 GGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAG < 2:1514593/99‑1 GTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGT > 1:1379821/1‑99 tacCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTG > 2:1481301/4‑99 tacCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTG < 1:3599/96‑1 cCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTA > 2:549341/2‑99 cCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTA < 2:175140/98‑1 AGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAG > 2:735991/1‑99 GCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGC > 1:1346088/1‑99 GCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGC > 1:1919955/1‑99 CTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCC > 2:1254774/1‑99 CTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCC > 1:1870750/1‑99 CTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCC < 1:741641/99‑1 TCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCT > 2:318803/1‑99 |||| ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |