| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 71275 | 128 (1.070) | 696 (6.100) +GCTC |
149/168 | NT | 84.4% | intergenic (+10/‑76) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| ? | NC_000913 | 366286 = | 142 (1.190) | coding (20/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase | |||||
Only 100 of 889 total aligned reads displayed.
ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |||| TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC < 1:100215/99‑1 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC < 1:984484/99‑1 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 1:1418434/1‑99 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 2:2424228/1‑99 TTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCT < 2:1350833/99‑1 TTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCT < 2:3130665/99‑1 TAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTC < 2:1745518/99‑1 TAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTC < 1:1332100/99‑1 AAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAA < 1:1854672/99‑1 AAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAAT > 1:2903223/1‑99 AAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAAT < 1:2064098/99‑1 AAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAAT > 1:565451/1‑99 AATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATt < 2:1929539/99‑2 CCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCACGTTGTCATAATTGGTACCGAGCCCGAATTCGTAAT > 1:2116169/1‑99 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 2:2732200/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 2:2468674/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 1:719888/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 2:1028876/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA > 2:70151/1‑99 GCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGt < 1:3063093/99‑2 CCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtc > 1:1468436/1‑97 CCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtc > 2:431199/1‑97 CAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtca < 1:1053424/99‑4 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA < 2:163831/99‑1 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA > 1:1969263/1‑99 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC < 1:2321979/99‑1 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC > 1:1523927/1‑99 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC < 1:1289879/99‑1 CGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCT > 1:1118808/1‑99 GAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTG > 1:2028437/1‑99 AGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGT > 2:215321/1‑99 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT < 1:2728661/99‑1 AGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCC > 2:1100438/1‑99 GTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCT > 2:1481345/1‑99 ttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTG > 1:2987899/4‑99 ttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTG > 1:2230402/4‑99 CGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGT > 2:874998/1‑99 CCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAA < 2:1525623/99‑1 CCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAA < 2:1806003/99‑1 CGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAT < 1:174299/99‑1 CGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAT > 1:3104114/1‑99 GGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATT < 2:2998211/99‑1 TTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGT < 1:521379/99‑1 TTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGT > 2:2372422/1‑99 TGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTTTTTCCGGTGTGAAATTGTatc < 2:1203277/99‑4 TGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAT < 2:1422704/99‑1 GAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTCATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATC < 2:2587785/99‑1 AAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCC > 2:619103/1‑99 GAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGC < 2:1847116/99‑1 GAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGC > 1:1179959/1‑99 GAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGC < 1:2402698/99‑1 AAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCT < 1:646022/99‑1 AGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACA > 2:1667524/1‑99 GTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAA > 2:2651039/1‑99 TGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAT < 2:944132/99‑1 GAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATT > 2:1265821/1‑99 AATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTC < 1:776064/99‑1 AATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTC < 2:129710/99‑1 AATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTC < 1:2558701/99‑1 ATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCC > 2:763213/1‑99 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA > 1:3150980/1‑99 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA > 1:956888/1‑99 ATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACA < 2:2872337/99‑1 ATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACA > 2:2198541/1‑99 ATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACA < 2:812411/99‑1 TAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAA < 2:199017/99‑1 GCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACA > 2:2316622/1‑99 CCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAT < 2:376043/99‑1 CCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAT > 2:2230628/1‑99 CCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAT < 2:1901222/99‑1 CGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATA < 2:558776/99‑1 AAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAG > 1:2168296/1‑99 AAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAG > 1:2772480/1‑99 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC < 2:509207/99‑1 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGATCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC > 1:871431/1‑99 GTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCC > 2:2113652/1‑99 GTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCC < 2:3081587/99‑1 GTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCC > 2:2947470/1‑99 GTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCC < 1:2641942/99‑1 GTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCC < 1:2455599/99‑1 TTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCG < 2:2023340/99‑1 GTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGA < 1:1924328/99‑1 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA > 1:83165/1‑99 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA > 2:3167713/1‑99 CATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAG > 2:463745/1‑99 CATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAG < 1:1603795/99‑1 ATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGC > 2:1139432/1‑99 ATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGC < 1:416343/99‑1 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA > 1:2819366/1‑99 AATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCAT < 1:259559/99‑1 ATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATA > 1:1226907/1‑99 ATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATA < 2:1578070/99‑1 ATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATA > 2:2551851/1‑99 TTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAA > 1:2268549/1‑99 tacCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTG > 1:352994/4‑99 acCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGT < 1:1781153/97‑1 cCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTA < 1:2520976/98‑1 CGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAA < 2:2805740/99‑1 GCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGC > 2:2063745/1‑99 TCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCT < 1:1666031/99‑1 |||| ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |