| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 71275 | 128 (1.070) | 696 (6.100) +GCTC |
149/168 | NT | 84.4% | intergenic (+10/‑76) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| ? | NC_000913 | 366286 = | 142 (1.190) | coding (20/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase | |||||
Only 100 of 1011 total aligned reads displayed.
TATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACACTT > NC_000913/71177‑71373 | tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc < 1:100215‑M1/99‑3 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 2:2612442‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 1:1418434‑M1/1‑97 (MQ=255) ttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgct < 1:1472444‑M1/99‑4 (MQ=255) ttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgct < 2:3130665‑M1/99‑4 (MQ=255) tAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctc < 1:1332100‑M1/99‑5 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaa < 2:1517210‑M1/99‑8 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt > 2:1066474‑M1/1‑90 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt < 2:1560286‑M1/99‑10 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt > 2:1782917‑M1/1‑90 (MQ=255) aTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAAt > 2:941274/1‑99 (MQ=255) tGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcg > 1:2233530‑M1/1‑88 (MQ=255) cACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGa < 2:2149819/99‑1 (MQ=255) aCCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaa > 2:366899‑M1/1‑85 (MQ=255) ccGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACg > 2:3168323/1‑99 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 1:541450‑M1/99‑18 (MQ=255) gggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcat > 1:2760696‑M1/1‑81 (MQ=255) gCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTg > 2:539242/1‑99 (MQ=255) cAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtca < 1:2169645‑M1/99‑23 (MQ=255) aGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcat < 1:1184214‑M1/99‑24 (MQ=255) aGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcat > 1:2806031‑M1/1‑76 (MQ=255) gCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcata > 2:777281‑M1/1‑75 (MQ=255) gCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcata < 1:2871101‑M1/99‑25 (MQ=255) cccGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatag > 2:1655886‑M1/1‑74 (MQ=255) cgagcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagct > 1:1531488‑M1/1‑72 (MQ=255) agcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgt < 2:2652758‑M1/99‑30 (MQ=255) agcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgt > 1:1063679‑M1/1‑70 (MQ=255) gcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtt > 2:2875713‑M1/1‑69 (MQ=255) gcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtt < 1:2663424‑M1/99‑31 (MQ=255) ctagttCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgttt < 2:713140‑M1/97‑32 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc > 2:2246919‑M1/1‑66 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc < 1:1858951‑M1/99‑34 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc < 2:2507399‑M1/99‑34 (MQ=255) tGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtga > 1:204736‑M1/1‑59 (MQ=255) tGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcaaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtga > 2:1328496‑M1/1‑59 (MQ=255) tGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTg < 2:1162094/99‑1 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaa > 2:195190‑M1/1‑57 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaa < 2:2728431‑M1/99‑43 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCa < 2:1610377/99‑1 (MQ=255) cGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaat > 1:1744878‑M1/1‑56 (MQ=255) cGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaat < 2:658159‑M1/99‑44 (MQ=255) ggTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaatt < 2:2998211‑M1/99‑45 (MQ=255) ggTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGa > 1:2564673/1‑99 (MQ=255) gTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattg > 2:1710781‑M1/1‑54 (MQ=255) tgtgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtt < 2:2428876‑M1/99‑48 (MQ=255) gtgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtta < 1:247221‑M1/99‑49 (MQ=255) tgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttat < 2:1215315‑M1/99‑50 (MQ=255) tgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttat > 1:978960‑M1/1‑50 (MQ=255) tgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttat < 1:1782893‑M1/99‑50 (MQ=255) gaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgc > 1:194815‑M1/1‑46 (MQ=255) gaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgc < 1:2402698‑M1/99‑54 (MQ=255) gaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgc < 1:1292484‑M1/99‑54 (MQ=255) gaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgc < 2:887287‑M1/99‑54 (MQ=255) aaaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgct > 2:2009950‑M1/1‑45 (MQ=255) aaaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgct > 2:1896439‑M1/1‑45 (MQ=255) aaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctc > 1:681907‑M1/1‑44 (MQ=255) aaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctca > 1:2524734‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctca < 2:584763‑M1/99‑57 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTATCGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTcc > 1:2614934/1‑99 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa > 1:1615068‑M1/1‑40 (MQ=255) aaTGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCAtt < 2:1014886/99‑1 (MQ=255) atgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccaca < 2:812411‑M1/99‑67 (MQ=255) atgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccaca > 2:2198541‑M1/1‑33 (MQ=255) tgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacac < 2:1412980‑M1/99‑68 (MQ=255) tgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacac > 1:726241‑M1/1‑32 (MQ=255) tAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaa < 2:478818‑M1/99‑70 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca < 1:3003357‑M1/99‑72 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca > 1:1247146‑M1/1‑28 (MQ=255) ccGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacat < 1:1688791‑M1/99‑73 (MQ=255) ccGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacat < 1:2954298‑M1/99‑73 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 2:1830995‑M1/99‑74 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 1:437123‑M1/99‑74 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 1:2074732‑M1/99‑74 (MQ=255) cAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacga < 1:931381‑M1/99‑77 (MQ=255) aaGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgag > 2:2063580‑M1/1‑22 (MQ=255) aaGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgag < 1:1125953‑M1/99‑78 (MQ=255) aGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagc > 1:2281562‑M1/1‑21 (MQ=255) gTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagcc > 2:2113652‑M1/1‑20 (MQ=255) gTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagcc > 1:386066‑M1/1‑20 (MQ=255) gTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagcc < 2:450849‑M1/99‑80 (MQ=255) gTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagcc > 1:1981229‑M1/1‑20 (MQ=255) gTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagcc > 2:2947470‑M1/1‑20 (MQ=255) gTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagcc < 2:3081587‑M1/99‑80 (MQ=255) gTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAg < 2:1455866/99‑1 (MQ=255) tCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaa > 1:83165‑M1/1‑16 (MQ=255) tCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaa > 2:2341854‑M1/1‑16 (MQ=255) tCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGc < 2:2804403/99‑1 (MQ=255) cATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagtcggaag < 1:234593‑M1/99‑85 (MQ=255) cATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCa < 1:575516/99‑1 (MQ=255) aTAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagc > 2:1923578‑M1/1‑14 (MQ=255) aTAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagc < 1:3117092‑M1/99‑86 (MQ=255) tAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagca > 2:405028‑M1/1‑13 (MQ=255) aTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcata < 1:323609‑M1/99‑89 (MQ=255) tGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaa > 2:1117229‑M1/1‑9 (MQ=255) gtaccgagctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagt < 2:2559849‑M1/95‑93 (MQ=255) gTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagt > 2:238861‑M1/1‑7 (MQ=255) accgagctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgt > 1:307399‑M1/3‑5 (MQ=255) ccgAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgta < 2:1284641‑M1/98‑96 (MQ=255) ccgAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgta < 1:790581‑M1/98‑96 (MQ=255) gAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaaa < 1:2128831‑M1/99‑98 (MQ=255) | TATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACACTT > NC_000913/71177‑71373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |