| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,542,428 | IS1 (+) +9 bp | 11.2% | coding (392‑400/597 nt) | fimE → | regulator for fimA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 13 (0.100) | 12/176 | NT | 9.8% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4542436 | 107 (0.910) | coding (400/597 nt) | fimE | regulator for fimA | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 14 (0.110) | 12/176 | NT | 10.5% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4542428 = | 107 (0.910) | coding (392/597 nt) | fimE | regulator for fimA | |||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GACTGACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAA > NC_000913/4542330‑4542526 | gACTGACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAAc > 2:1044576/1‑99 (MQ=255) aCTGACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACg < 1:2915790/99‑1 (MQ=255) aCTGACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACg > 1:164860/1‑99 (MQ=255) gACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAg > 1:1230391/1‑99 (MQ=255) cTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTc > 1:3341090/1‑99 (MQ=255) tataTTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCa < 1:2683743/99‑1 (MQ=255) ttatttCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGGTGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTc < 1:1694741/99‑1 (MQ=255) ttatttCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTc > 2:2617427/1‑99 (MQ=255) tatttCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCa < 2:1482418/99‑1 (MQ=255) tatttCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCa > 2:2846933/1‑99 (MQ=255) tttCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCggtgatgct > 2:2662076‑M2/1‑90 (MQ=255) tttCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCata < 2:1415094/99‑1 (MQ=255) tttCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCata < 1:2650581/99‑1 (MQ=255) tctcGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATg < 1:3244809/99‑1 (MQ=255) tcGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGtt > 1:2574193/1‑99 (MQ=255) gccgcGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTaa < 2:853580/99‑1 (MQ=255) gccgcGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTaa < 1:111110/99‑1 (MQ=255) ccgcGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAg > 2:3414990/1‑99 (MQ=255) ggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAgg < 2:2689738‑M2/26‑1 (MQ=255) gcgGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCggtgatgctgccaactta > 1:2466117‑M2/1‑81 (MQ=255) gcgGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCggtgatgctgccaactta > 1:1729705‑M2/1‑81 (MQ=255) cgGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCa < 1:1940795/99‑1 (MQ=255) gggAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCCCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCAt > 1:220135/1‑99 (MQ=255) ggAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATg > 1:1231326/1‑99 (MQ=255) ggAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATg > 2:3016449/1‑99 (MQ=255) ggAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATg > 2:412389/1‑99 (MQ=255) agctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGc < 2:1933787‑M2/31‑1 (MQ=255) aGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCt < 2:2558639/99‑1 (MQ=255) aGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCCCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCt < 2:2911742/99‑1 (MQ=255) tCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCGTTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTg > 2:2188939/1‑99 (MQ=255) ggCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCg < 1:1373201/99‑1 (MQ=255) gCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCgg > 1:275906/1‑99 (MQ=255) gCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCACGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCgg > 1:773439/1‑99 (MQ=255) cTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGt < 1:3245733/99‑1 (MQ=255) cTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGt < 2:776446/99‑1 (MQ=255) cTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGt < 2:1401207/99‑1 (MQ=255) ttCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTa < 2:1749177/99‑1 (MQ=255) ttCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTa > 2:2314225/1‑99 (MQ=255) ttCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTa < 2:2590874/99‑1 (MQ=255) ttCTCGCCAGCAGGCCTATCCCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTa > 2:3234490/1‑99 (MQ=255) agtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGaa > 1:3433476‑M2/56‑99 (MQ=255) ccAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg < 1:1855744‑M2/99‑38 (MQ=255) ccAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAAtt > 1:1725336/1‑99 (MQ=255) cagcagGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTg > 1:2250615/1‑99 (MQ=255) agcagGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTgg > 1:1893002/1‑99 (MQ=255) tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGc > 1:188124‑M2/51‑99 (MQ=255) ggCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGa > 1:741524/1‑99 (MQ=255) tATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCgt < 1:3443281/99‑1 (MQ=255) tATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCgt > 2:3284600/1‑99 (MQ=255) aTCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCgtg > 2:1346112/1‑99 (MQ=255) tCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCgtgg < 2:3445598/99‑1 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCgtggt > 2:562129‑M2/41‑99 (MQ=255) cGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCgtggt < 2:1639361/99‑1 (MQ=255) gCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc > 1:952739‑M2/1‑48 (MQ=255) gCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCgtggtg > 1:682021/1‑99 (MQ=255) ttattCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAg > 1:1021906/1‑99 (MQ=255) aacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAg > 2:638434‑M2/37‑99 (MQ=255) tattCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGa < 2:2597161/99‑1 (MQ=255) acataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGa < 2:70560‑M2/64‑1 (MQ=255) cataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGAt > 2:865869‑M2/35‑99 (MQ=255) cataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGAt > 1:1521860‑M2/35‑99 (MQ=255) attCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGAt > 2:485077/1‑99 (MQ=255) attCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGAt > 2:3473759/1‑99 (MQ=255) tCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATAc < 2:2395965/99‑1 (MQ=255) cgcgATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACt < 1:1726953/99‑1 (MQ=255) cgcgATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACt < 2:2621009/99‑1 (MQ=255) cgATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCg < 2:581786/99‑1 (MQ=255) aTGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGtt > 1:581359/1‑99 (MQ=255) ccGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTaa < 1:2979230/99‑1 (MQ=255) ccGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTaa < 1:1588023/99‑1 (MQ=255) cGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAAt < 2:3385389/99‑1 (MQ=255) cGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAAt < 2:3449048/99‑1 (MQ=255) ggTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAAtt > 2:2987523/1‑99 (MQ=255) ggTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAAtt < 2:3208679/99‑1 (MQ=255) gTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttc > 1:1695803‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTc > 2:2326453/1‑99 (MQ=255) gTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTc > 2:28045/1‑99 (MQ=255) ttGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAgg > 1:2228881/1‑99 (MQ=255) ttGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAgg > 1:842271/1‑99 (MQ=255) tGAAGCTCGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAACTCAGGa > 2:1791208/1‑99 (MQ=255) gAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGAt < 1:1040021/99‑1 (MQ=255) gAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGAt < 2:1981683/99‑1 (MQ=255) gAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGAt > 2:214813/1‑99 (MQ=255) gAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGAt < 1:2960838/99‑1 (MQ=255) aGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTa < 1:1945141/99‑1 (MQ=255) gCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTAt < 2:551870/99‑1 (MQ=255) gCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTAt > 1:2190082/1‑99 (MQ=255) cTGGAACCGTAACGCAGACTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctg > 2:2163581‑M2/1‑21 (MQ=255) gAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCg < 1:459401/99‑1 (MQ=255) aaCCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCgg < 1:1434001/99‑1 (MQ=255) aaCCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCgg < 1:1114706/99‑1 (MQ=255) ccGTAACGCAGACTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc < 2:1545452‑M2/99‑85 (MQ=255) attaccCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGc > 1:1428761‑M2/7‑99 (MQ=255) gTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGcgt < 1:1331269/99‑3 (MQ=255) aaCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCg > 2:159704/1‑99 (MQ=255) cCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGa < 1:249669‑M2/98‑1 (MQ=255) aCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGa > 2:2418182/1‑99 (MQ=255) aCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGa > 1:1821677/1‑99 (MQ=255) aCGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGa > 2:1999317/1‑99 (MQ=255) cGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGaa < 2:2097200/99‑1 (MQ=255) | GACTGACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAA > NC_000913/4542330‑4542526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |