| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,542,831 | IS5 (+) +4 bp | 20.7% | intergenic (+198/‑281) | fimE → / → fimA | regulator for fimA/type 1 fimbriae major subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 25 (0.250) | 24/176 | NT | 18.0% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4542831 = | 109 (1.150) | intergenic (+198/‑284) | fimE/fimA | regulator for fimA/type 1 fimbriae major subunit | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 32 (0.320) | 29/176 | NT | 21.9% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4542834 | 109 (1.150) | intergenic (+201/‑281) | fimE/fimA | regulator for fimA/type 1 fimbriae major subunit | |||||
ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2290016‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTT < NC_000913/4542834‑4542737 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:2371655/99‑1ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 1:415438/1‑99ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 1:548702/1‑99ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:734815/99‑1ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 2:342066/1‑99ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:2376707/99‑1ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:2609646/99‑1ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:2326939/99‑1ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 1:2072295/1‑99ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:709472/99‑1ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:17416/99‑1ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:1125957/99‑1ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:2193289/99‑1 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:1107038/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:427694/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:2358466/99‑1 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:416131/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:2050064/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:1306639/99‑1 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 1:1283089/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 1:496018/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:1267357/99‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA > 1:370331/1‑99 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:1144362/99‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:346309/99‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:145811/99‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:289065/99‑1 TGTCGGCGAACGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTaa < 2:874348/99‑3 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 1:280618/99‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 1:631115/99‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 2:1482914/99‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 1:1536028/99‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 2:1348889/99‑1 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC < 1:676804/99‑1 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC > 2:2589867/1‑99 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC < 2:1787391/99‑1 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC > 2:1034870/1‑99 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC < 1:1970023/99‑1 GGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTT < 2:2044843/99‑1 CGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTA < 1:1455391/99‑1 AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACA < 2:1663947/99‑1 AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACA > 2:1417128/1‑99 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATA < 1:2329091/99‑1 AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAG < 2:1029786/99‑1 TGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGT < 1:1363752/99‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGT < 1:1343618/99‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTG < 2:330252/99‑1 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGA > 2:1050746/1‑99 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAAT < 1:1619943/99‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAAT > 2:293966/1‑99 CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATT < 1:2495627/99‑1 TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTA > 2:779457/1‑99 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACA > 2:2070425/1‑99 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGA < 2:585522/99‑1 GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAA > 1:743069/1‑99 GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAA < 1:888855/99‑1 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATT < 2:16020/99‑1 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATT < 2:2330082/99‑1 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTA < 1:2269453/99‑1 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTA < 2:2048473/99‑1 TGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAGTTAATTTACAATAGAAATAATTTAC > 1:1077246/1‑99 TGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTAC > 1:313452/1‑99 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACA < 2:1201068/99‑1 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATC > 2:1361026/1‑99 CTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTT < 2:2243643/99‑1 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGC > 2:1573860/1‑99 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGC < 2:1224744/99‑1 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTT > 2:923603/1‑99 TCGCACCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTT < 2:1320478/99‑1 CCTTCCTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAA > 1:239576/1‑99 CTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTT > 1:1768511/1‑99 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2290016‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTT < NC_000913/4542834‑4542737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |