| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,470,056 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑203/+82) | chiA ← / ← tufA | endochitinase/translation elongation factor Tu 1 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | 44 (1.000) | 32/276 | 0.3 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3470063 | 0 (0.000) | intergenic (‑210/+82) | chiA/tufA | endochitinase/translation elongation factor Tu 1 | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3470056 = | 0 (0.000) | 24 (0.550) | 21/274 | 0.8 | 100% | intergenic (‑203/+89) | chiA/tufA | endochitinase/translation elongation factor Tu 1 |
| ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1978640‑1978503‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCATATTGA < NC_000913/3470063‑3469928 CATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACCATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGT > 1:328506/1‑140 CCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAA < 2:168928/140‑1 AATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAA < 2:615951/140‑1 ATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAAT < 1:534303/140‑1 GAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAAT < 1:466089/140‑1 AGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATT > 1:481475/1‑140 CAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATT < 1:635149/140‑1 AGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTC < 2:586778/140‑1 CACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCAT > 1:499421/1‑140 GCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAA < 2:477872/140‑1 CACGGCTGGGACGGAAGACGCTGTCGTTCTCTAAAGCGGCGGAGCTGCTTGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATtcgttct < 2:215171/140‑8 GCTGGGACTGAAGTCGGTGTCGCTCTCAAACTCGGTGGACCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATAT < 2:355795/140‑1 AGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTT < 2:481475/140‑1 TCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAA < 2:643685/140‑1 GCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACA > 1:618278/1‑140 TCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTT < 1:137425/140‑1 TCGGTCTCAAAATCGGGGGAGCTGCATGACAAAGCCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCCGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTACCATTTT > 2:598449/1‑140 AATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAAT > 1:183887/1‑140 GTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTC > 2:536885/1‑140 GTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTC < 2:92075/140‑1 GTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTC > 2:175190/1‑140 GTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTC < 1:536885/140‑1 CATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAA > 1:619858/1‑140 ACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATG < 1:420379/140‑1 ACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATG < 2:462797/140‑1 GGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTC < 2:183887/140‑1 TTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCT < 1:636757/140‑1 GAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTC < 2:619858/140‑1 AACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCT > 2:104523/1‑140 AACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCT > 1:44493/1‑140 ACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTT > 2:103644/1‑140 ATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCC > 1:152125/1‑140 ATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCC > 1:386727/1‑140 ATCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCC > 1:458612/1‑140 TCAATAAGTTGGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAACTATGAATGTTTCTGTTTTTAAATTGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCG < 2:421381/140‑1 GGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATT > 1:597947/1‑140 GGAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATT > 2:718539/1‑140 GAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTC < 1:103644/140‑1 GAGTCATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTAAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTC < 1:283939/140‑1 ATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCATATT > 2:24473/1‑140 ATTACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCATATT > 2:17256/1‑140 TACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTGTTATTTTTAAGGCCGTAATTTAATTCATATTGA > 2:313499/1‑140 TACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCATATTGA > 1:557336/1‑140 TACCGTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCGTTTTTCTAATTTTTAACGCCGGAATTTAATTCATATTGA > 2:280303/1‑140 CATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1978640‑1978503‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCAGAACGAATAAATTATTCATATTTAAAATATCAATTCAATTTAACATTTTAAATATGAATGTTTCTGTTTTTAAAATGCTTCATTTGTCAGGCTTTTTTCTTATTTTTAATGCCGTAATTTAATTCATATTGA < NC_000913/3470063‑3469928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |