New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1999928 | 50 (1.020) | 5 (0.110) | 3/246 | 4.3 | 11.7% | coding (458/801 nt) | tcyJ | cystine ABC transporter periplasmic binding protein |
? | NC_000913 | = 2009249 | 31 (0.710) | coding (973/1206 nt) | yedE | putative selenium transporter YedE | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCGTTGAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACAT > NC_000913/2009112‑2009387 | gCGTTGAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACtggtgg > 1:470209/1‑140 (MQ=255) cGTTGAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTggg < 2:148499/140‑1 (MQ=255) cGTTGAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTggg < 1:783056/140‑1 (MQ=255) gAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGggtcgg > 2:434820/1‑140 (MQ=255) tgtgGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGggtcgg < 1:803242/127‑1 (MQ=255) tgtgGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGggtcgg > 2:803242/1‑127 (MQ=255) tgtgGGCGGGACCAAACGCGGT‑ATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGa > 2:421708/1‑140 (MQ=255) gtgGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGa > 1:175012/1‑140 (MQ=255) gtgGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGa > 1:547288/1‑140 (MQ=255) gggCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATc > 2:52369/1‑140 (MQ=255) gggACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCt > 2:547559/1‑140 (MQ=255) aCCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCaa < 1:434820/140‑1 (MQ=255) cgGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTg < 1:64196/140‑1 (MQ=255) cgGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTg < 1:769456/140‑1 (MQ=255) tAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCg < 2:470209/140‑1 (MQ=255) tAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCg < 1:44045/140‑1 (MQ=255) tAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCATGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCg < 1:473429/140‑1 (MQ=255) tttACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTggg > 1:202220/1‑140 (MQ=255) tttGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGAttt > 2:141347/1‑140 (MQ=255) cATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGgcgc < 2:175012/140‑1 (MQ=255) gctggctgGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCa < 1:713723/140‑1 (MQ=255) gCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACctg < 1:547559/140‑1 (MQ=255) gcgGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTgg > 2:445310/1‑140 (MQ=255) gcgGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTgg > 2:124935/1‑140 (MQ=255) cgGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGt > 2:113397/1‑140 (MQ=255) ggTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTc > 2:629187/1‑140 (MQ=255) ccAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTg < 2:159718/140‑1 (MQ=255) aGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGc < 1:629187/140‑1 (MQ=255) ggTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGcc > 2:26841/1‑140 (MQ=255) ggTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGcc > 2:530383/1‑140 (MQ=255) ggTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAAACCAACTGCTGAAGACCTACGGTCCGATGGGTGGcc > 2:358961/1‑140 (MQ=255) gCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCctgc > 2:83993/1‑140 (MQ=255) cACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGCCAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCctgct > 2:560402/1‑140 (MQ=255) ctGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGa < 1:530383/140‑1 (MQ=255) ggtggGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACa > 1:164266/1‑140 (MQ=255) gtggGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAACTCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACat > 2:275777/1‑140 (MQ=255) gtggGTCGGTCTGGGCAATGTGATCAGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAATTCAACCTGATGATAACTTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACat > 2:239760/1‑140 (MQ=255) | GCGTTGAACCCAAAATCATGTGGGCGGGACCAAACGCGGTAATTGGTGGTTTACTGTTTGGTTTTGGCATCGTGCTGGCTGGCGGCTGCGAAACCGGCTGGATGTACCGCGCGGTAGAAGGCCAGGTGCACTACTGGTGGGTCGGTCTGGGCAATGTGATCGGCTCAACGATTCTGGCGTATTACTGGGATGATTTCGCTCCGGCGCTGGCCACCGACTGGGACAAAATCAACCTGCTGAAAACCTTTGGTCCGATGGGTGGCCTGCTGGTGACAT > NC_000913/2009112‑2009387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |