Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_000913 3762359–3765288 3765529–3765414 127–3171 20 [18] [17] 24 rhsA rhs element protein RhsA

ACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCC  >  NC_000913/3762219‑3762402
                                                                                                                                           |                                            
aCGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTcc                                              <  2:1079740/140‑1 (MQ=34)
aCGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTcc                                              <  2:1119638/140‑1 (MQ=34)
      tATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGGGTGCCCCCGCGGGGGGGCGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGGGCAAAGGGCCTTccccggga                                        >  2:1191200/1‑135 (MQ=11)
         ggCGGTAGCATTGTTCAGGGTTTAGTCGGCGTGCGCACTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAAc                                     <  1:666955/140‑1 (MQ=255)
         ggCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGGGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAAc                                     <  1:1345319/140‑1 (MQ=21)
              tAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACa                                <  2:809986/140‑1 (MQ=34)
                gCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGGGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGGGGCCCGTTTGGGGGGCCCCGGCGGGGGGGCGTCCCGCCCTCCGGGCAATCCCCTGCCCGGTGCCAAGGGCCTTCCCCGGGGAAcccgcctc                              >  2:76462/1‑134 (MQ=2)
                   ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGcc                           <  1:1191200/140‑1 (MQ=34)
                      ttCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTg                        >  1:1158949/1‑140 (MQ=35)
                          gggTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTgcccg                    <  2:968593/140‑1 (MQ=34)
                                aGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGc              >  1:271147/1‑140 (MQ=35)
                                aGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGc              >  2:1227171/1‑140 (MQ=35)
                                aGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGc              >  2:41994/1‑140 (MQ=35)
                                aGCCGGGGTGCGCATAAGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGCGTGGCTTCCGGCCAAACGGTCAAACCCCCCCTCGGTGCAAAGGACCTTCCCGGTGAAAACGACATCGCCCTgcccggcccgg              >  2:1496317/1‑139 (MQ=11)
                                     gggTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCCTCCGGTCAATCCCCTGCTCGGGGCAACGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCg         >  2:267657/1‑140 (MQ=255)
                                      ggTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGt        <  2:99415/140‑1 (MQ=34)
                                      ggTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGt        <  1:76462/140‑1 (MQ=34)
                                          cgcATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCAt    >  1:904282/1‑140 (MQ=32)
                                           gcATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATc   <  2:1197630/140‑1 (MQ=31)
                                            cATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATcc  <  2:930019/140‑1 (MQ=11)
                                                                                                                                           |                                            
ACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCC  >  NC_000913/3762219‑3762402

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: