| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 377353 = | NA (NA) | 16 (0.650) +TTAGCGTCGCATCAGGCATCTGCGCACGAC |
9/216 | 1.3 | NA | noncoding (18/37 nt) | other | REP32a |
| ? | NC_000913 | 4325850 = | NA (NA) | intergenic (‑109/+549) | yjdN/yjdM | conserved protein YjdN/conserved protein YjdM | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGG > NC_000913/377219‑377492 | agTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTc > 1:252567/1‑140 (MQ=255) tataGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCtt > 2:447422/1‑140 (MQ=255) ataGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTa > 1:27690/1‑140 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCAGGcc > 1:348343/1‑140 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCAGGcc > 1:447089/1‑140 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 1:502717/1‑140 (MQ=255) cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt < 2:488847/127‑1 (MQ=255) cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt > 1:488847/1‑127 (MQ=255) cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt > 1:28874/1‑140 (MQ=255) gatgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattctcgcgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTa < 2:491312‑M2/49‑1 (MQ=255) gcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAcaaattct < 2:27690/140‑8 (MQ=255) atgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattctcgcgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTtac < 1:397608‑M2/50‑2 (MQ=255) atgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattctcgcgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAt < 1:56388‑M2/50‑1 (MQ=255) atgcgacgctaacgcgtcttagcaggcctacaaattctcgcgccacccgtaggccggatagggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTtac < 1:105103‑M2/50‑2 (MQ=255) agCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGa > 1:192372/1‑140 (MQ=255) agCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGa > 1:93414/1‑140 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tcccgcgccatccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccg > 1:140507‑M2/56‑140 (MQ=255) tcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaaCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccgc < 1:341908‑M1/62‑1 (MQ=255) tcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaaCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccgc < 2:138950‑M1/62‑1 (MQ=255) cgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCTGCATcc > 2:297781‑M2/51‑140 (MQ=255) cgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATcc > 1:34572‑M2/51‑140 (MQ=255) cgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATcc > 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< 1:83105/140‑1 (MQ=255) tAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCg < 2:534907/130‑1 (MQ=255) tAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCg > 1:534907/1‑130 (MQ=255) aTAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt < 1:127222/140‑1 (MQ=255) gtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTgcg > 2:187249‑M2/8‑133 (MQ=255) gtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTgcg < 1:187249‑M2/126‑1 (MQ=255) gtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGcgtcgca < 2:157419‑M2/133‑4 (MQ=255) tcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt > 1:455733‑M2/7‑140 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 2:62213/1‑140 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGc > 1:252378/1‑140 (MQ=255) tGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa < 1:369868/140‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa < 1:139089/140‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa > 1:25867/1‑140 (MQ=255) tgatgcgacgctaaCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc > 2:254499‑M1/15‑140 (MQ=255) tgatgcgacgctaaCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc > 1:446026‑M1/15‑140 (MQ=255) gATGCGCCGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:502576/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCTGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:297781/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTAcaaattcc < 2:305341/140‑8 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:467169/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:25867/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:245414/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:83783/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:229152/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:82932/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAGGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:54116/140‑1 (MQ=255) atgcgacgctaaCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACgg > 2:341908‑M1/13‑140 (MQ=255) cGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGc < 1:421070/140‑1 (MQ=255) gACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCg < 1:233164/140‑1 (MQ=255) cgcgTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTgtagg > 1:295074‑M2/1‑135 (MQ=255) | AGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGG > NC_000913/377219‑377492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |