Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 2,857,096 | Δ2,538 bp | coding (4‑2541/2562 nt) | mutS → | DNA mismatch repair protein MutS |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2857096 | 2859633 | 2538 | 81 [0] | [0] 81 | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2857095 | 0 (0.000) | 80 (1.070) | 47/276 | 0.3 | 100% | coding (3/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
? | NC_000913 | 2859634 = | 0 (0.000) | coding (2542/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
AACCAGCATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2856958‑2857095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTAC > NC_000913/2859634‑2859770 AACCAGCATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCG < 1:1020358/140‑1 GCATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGA < 2:1173116/140‑1 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CTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAAT < 2:1140644/140‑1 CCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGA < 2:401719/140‑1 ATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGA < 2:627078/129‑1 ATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGA > 1:627078/1‑129 AACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTAT > 1:317637/1‑140 CCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGG < 1:802741/140‑1 GTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAAT > 2:1120570/1‑140 TGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAC > 1:400965/1‑140 TGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAC > 1:47832/1‑140 TGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAC > 1:1027006/1‑140 TGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCACATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAC > 1:437118/1‑140 TGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGA > 2:1029285/1‑140 TGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGA > 2:219580/1‑140 TGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGA > 1:160891/1‑140 TGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGA > 1:663036/1‑140 CGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACA > 2:958009/1‑140 CTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACT > 2:682162/1‑140 CTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACT > 1:858353/1‑140 TTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTG < 2:663036/140‑1 ATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATA > 2:379584/1‑140 TTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAA < 1:255194/140‑1 TACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAA > 2:924284/1‑140 TACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAA > 2:1079221/1‑140 ACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAA > 2:900281/1‑140 CGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAA < 1:379584/140‑1 GAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAA < 1:924284/140‑1 GAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAA < 2:1027006/140‑1 GAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAA < 1:465026/140‑1 GAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAA < 2:927278/140‑1 GAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAA < 2:667743/140‑1 AAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAAC > 2:601916/1‑140 AAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAAC > 1:570652/1‑140 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 2:551219/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 2:570652/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 2:535186/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 2:1122235/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 2:755314/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 1:958009/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:34176/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 2:160891/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:145623/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:89801/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:611084/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:682162/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 2:400965/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGACTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGCCGAATAAAATAAAAACACC < 2:575889/140‑1 AAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTG < 1:900281/140‑1 TCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAAT > 2:256230/1‑140 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AGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAt > 2:276430/1‑139 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGG > 2:119877/1‑140 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGG > 1:1105124/1‑140 CCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAA > 2:1260581/1‑140 CATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCAT < 1:601916/140‑1 CATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCAT < 1:456557/140‑1 ATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATG < 1:310126/140‑1 ATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATG < 1:359080/140‑1 TAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGC < 1:1029285/140‑1 CATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCAT < 2:170819/132‑1 CATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCAT > 1:170819/1‑132 ATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTAC > 1:794143/1‑140 AACCAGCATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2856958‑2857095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTAC > NC_000913/2859634‑2859770 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |