| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,857,096 | Δ2,538 bp | coding (4‑2541/2562 nt) | mutS → | DNA mismatch repair protein MutS |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2857096 | 2859633 | 2538 | 81 [0] | [0] 81 | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2857095 | 0 (0.000) | 80 (1.070) | 47/276 | 0.3 | 100% | coding (3/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| ? | NC_000913 | 2859634 = | 0 (0.000) | coding (2542/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS | |||||
AACGCCGCCGCTACGCAAGTGGATGGTACGCAAATGTCTTTGCTGTCAGTACCAGAAGAAACTTCGCCTGCGGTCGAAGCTCTGGAAAATCTTGATCCGGATTCACTCACCCCGCGTCAGGCGCTGGAGTGGATTTATCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACG > NC_000913/2859496‑2859773 | aaccagcatcaagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgcg < 1:1020358‑M2/2‑1 (MQ=255) gcatcaagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGa < 2:1173116‑M2/7‑1 (MQ=255) catcaagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGaa < 1:520607‑M2/8‑1 (MQ=255) catcaagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGaa < 1:1208155‑M2/8‑1 (MQ=255) catcaagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGaa > 2:310126‑M2/133‑140 (MQ=255) aagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGc > 1:1140644‑M2/129‑140 (MQ=255) agaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGcc < 1:368716‑M2/13‑1 (MQ=255) actcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTgg < 1:792277‑M2/16‑1 (MQ=255) actcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTgg < 2:694474‑M2/16‑1 (MQ=255) tcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGgtg > 2:1046422‑M2/123‑140 (MQ=255) cgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGgtgt < 1:560535‑M2/19‑1 (MQ=255) cgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGtaat > 2:770293‑M2/119‑140 (MQ=255) ttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGtaataa < 2:1010951‑M2/24‑1 (MQ=255) ttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGtaataa < 2:1027258‑M2/24‑1 (MQ=255) cttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAAt < 2:1140644‑M2/28‑1 (MQ=255) cccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGa < 2:401719‑M2/34‑1 (MQ=255) attaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGa < 2:627078‑M2/34‑1 (MQ=255) attaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGa > 1:627078‑M2/96‑129 (MQ=255) aactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTAt > 1:317637‑M2/93‑140 (MQ=255) ccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCggg < 1:802741‑M2/52‑1 (MQ=255) gtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAat > 2:1120570‑M2/86‑140 (MQ=255) tgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAc > 1:400965‑M2/80‑140 (MQ=255) tgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAc > 1:47832‑M2/80‑140 (MQ=255) tgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAc > 1:1027006‑M2/80‑140 (MQ=255) tgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccacatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAc > 1:437118‑M2/80‑140 (MQ=255) tgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGa > 2:1029285‑M2/78‑140 (MQ=255) tgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGa > 2:219580‑M2/78‑140 (MQ=255) tgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGa > 1:160891‑M2/78‑140 (MQ=255) tgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGa > 1:663036‑M2/78‑140 (MQ=255) cgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACa > 2:958009‑M2/76‑140 (MQ=255) cttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACt > 2:682162‑M2/73‑140 (MQ=255) cttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACt > 1:858353‑M2/73‑140 (MQ=255) ttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTg < 2:663036‑M2/69‑1 (MQ=255) attacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaata > 2:379584‑M2/65‑140 (MQ=255) ttacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataa < 1:255194‑M2/77‑1 (MQ=255) tacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataaa > 2:924284‑M2/63‑140 (MQ=255) tacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataaa > 2:1079221‑M2/63‑140 (MQ=255) acgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataaaataa > 2:900281‑M2/59‑140 (MQ=255) cgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAataaaataaa < 1:379584‑M2/83‑1 (MQ=255) gaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAAtaaaataaaa < 1:924284‑M2/84‑1 (MQ=255) gaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAAtaaaataaaa < 2:1027006‑M2/84‑1 (MQ=255) gaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAAtaaaataaaa < 1:465026‑M2/84‑1 (MQ=255) gaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAAtaaaataaaa < 2:927278‑M2/84‑1 (MQ=255) gaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAAtaaaataaaa < 2:667743‑M2/84‑1 (MQ=255) aaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAac > 2:601916‑M2/55‑140 (MQ=255) aaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAac > 1:570652‑M2/55‑140 (MQ=255) aataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAaca < 2:551219‑M2/87‑1 (MQ=255) aataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAaca < 2:570652‑M2/87‑1 (MQ=255) aataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAaca < 2:535186‑M2/87‑1 (MQ=255) aataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAaca < 2:1122235‑M2/87‑1 (MQ=255) aataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAaca < 2:755314‑M2/87‑1 (MQ=255) aataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAaca < 1:958009‑M2/87‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc < 1:34176‑M2/89‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc < 2:160891‑M2/89‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc < 1:145623‑M2/89‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc < 1:89801‑M2/89‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc < 1:611084‑M2/89‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc < 1:682162‑M2/89‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc < 2:400965‑M2/89‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGACTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGCCGAATAAAATAAAAACAcc < 2:575889‑M2/89‑1 (MQ=255) aaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTg < 1:900281‑M2/92‑1 (MQ=255) tcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTataat > 2:256230‑M2/43‑140 (MQ=255) cacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTataata > 2:1095857‑M2/42‑140 (MQ=255) cccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGaaa < 1:770293‑M2/104‑1 (MQ=255) catttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGc < 2:317637‑M2/106‑1 (MQ=255) tttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCtt > 2:896087‑M2/33‑140 (MQ=255) atcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTa > 2:456557‑M2/27‑140 (MQ=255) atcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTa < 1:1079221‑M2/114‑1 (MQ=255) agggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTAcat > 2:276430‑M2/24‑139 (MQ=255) gggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAgg > 2:119877‑M2/23‑140 (MQ=255) gggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAgg > 1:1105124‑M2/23‑140 (MQ=255) ccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTaaa > 2:1260581‑M2/18‑140 (MQ=255) cataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCAt < 1:601916‑M2/128‑1 (MQ=255) cataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCAt < 1:456557‑M2/128‑1 (MQ=255) ataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATg < 1:310126‑M2/129‑1 (MQ=255) ataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATg < 1:359080‑M2/129‑1 (MQ=255) 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AACGCCGCCGCTACGCAAGTGGATGGTACGCAAATGTCTTTGCTGTCAGTACCAGAAGAAACTTCGCCTGCGGTCGAAGCTCTGGAAAATCTTGATCCGGATTCACTCACCCCGCGTCAGGCGCTGGAGTGGATTTATCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACG > NC_000913/2859496‑2859773 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |